| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 1,851,241 | A→G | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 1,851,241 | 0 | A | G | 99.7% | 870.1 / NA | 365 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.84e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 365 total aligned reads displayed.
CATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTAGCATAACCACCCTGACCAGCCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTAGTCCGAGTCTCGGTGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGAGCGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAACATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTGAAAATTTGAGCGTGGGTTTTCGCCATCAGCAAACCGTACGTACAGTAGTCAATGATGTTAGTCTACAGATTGAGGCTGGCGAAACGCTGGCGCTGGTGGGTGAGAGTGGTAGTGGCAAAAGCGTTACCGCGCTGAGTATTTTACGCCTGCTCCCTTCCCCGCCGGTTGAATATCTCTCCGGCGATATTCGTTTTCATGGCGAAAGCCTGCTTCACGCCAGCGATCAAACGTTGCGCGGTGTACGCGGTAATAAGATCG > CP042583/1850959‑1851525 | catcCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATAACCACCCTGACCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGAc < 2:477316/289‑1 (MQ=255) 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tatGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATAACCACCCTGACCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCa > 1:217925/1‑280 (MQ=255) ccTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATAACCACCCTGACCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCa > 1:565324/1‑273 (MQ=255) cTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATAACCACCCTGACCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTg > 1:2790633/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |