Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 787,682 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 787,682 | 0 | A | T | 99.8% | 1009.4 / NA | 420 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (201/218); minor base G (0/1); total (201/219) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 787,683 | 0 | G | C | 99.5% | 983.7 / NA | 420 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base C (198/219); total (201/219) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.27e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 787,684 | 0 | C | G | 99.5% | 986.1 / NA | 420 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base G (199/217); minor base T (0/2); total (201/219) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 420 total aligned reads displayed.
CAAACGCAAGAAAACCGTTAATGTGGCGGATATTGAGTCCGTGGTGGCCCGTATTGCACGCATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTAGCTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTAGCAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTGACCGATAACAACGGACGCAAAGCAGACTTCCGTAACGTGGTGCTGGTG > CP042583/787402‑787963 ||| ttAATGTGGCGGATATTGAGTCCGTGGTGGCCCGTATTGCACGCATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCt > 2:2925879/1‑286 (MQ=255) ggATATTGAGTCCGTGGTGGCCCGTATTGCACGCATTCCAGGGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGat < 1:3023587/289‑1 (MQ=255) gATATTGAGTCCGTGGTGGCCCGTATTGCACGCATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGat < 1:497602/288‑1 (MQ=255) ttGAGTCCGTGGTGGCCCGTATTGCACGCATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTc < 1:2778851/289‑1 (MQ=255) gTCCGTGGTGGCCCGTATTGCACGCATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGa < 2:2168575/288‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCCCGTATTGCACGCATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCa < 1:566853/257‑1 (MQ=255) gtggtgGCCCGTATTGCACGCATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGtata > 1:1219493/1‑289 (MQ=255) gtggCCCGTATTGCACGCATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATg < 2:1103575/288‑1 (MQ=255) ggCCCGTATTGCACGCATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGa < 2:1656712/288‑1 (MQ=255) gCCCGTATTGCACGCATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGat > 2:633538/1‑270 (MQ=255) cccGTATTGCACGCATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTgcgc < 2:2515435/263‑1 (MQ=255) tATTGCACGCATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGTGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTGGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTTTGCGCTTTGATTTGTCCGAGGATATGGAAAGCCAt > 1:2040121/1‑289 (MQ=255) tggCACGCATTCCAGGGAAGAGGGTTTCGCCGAGTGTTATTGATACCCTGAAAAACGTCGGCGATCGCTTGAAAAGGCTGGTCTTCGGTCAGGTTAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATAc < 2:1057217/287‑1 (MQ=255) cATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGNTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGc < 1:521545/289‑1 (MQ=255) aTTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTgcgc < 2:2124543/249‑1 (MQ=255) aTTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGCACGCCATACCGTCAGc > 2:1283459/1‑288 (MQ=255) agTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATTTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGCTTTATTGGTg > 2:525016/1‑289 (MQ=255) agTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTtgtg > 2:2341264/1‑289 (MQ=255) agTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGt > 2:3246590/1‑288 (MQ=255) agTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGt > 1:1921339/1‑288 (MQ=255) gtgtTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTg < 1:2148228/288‑1 (MQ=255) gtgtTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTg < 1:2341264/288‑1 (MQ=255) cGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGt < 1:429896/235‑1 (MQ=255) aCCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATg > 2:2759856/1‑234 (MQ=255) ccTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTg > 2:2642296/1‑263 (MQ=255) ccTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGa > 2:468417/1‑288 (MQ=255) ccTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGa > 1:1778913/1‑288 (MQ=255) tGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTTACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTggg < 1:3119833/193‑1 (MQ=255) tGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTggg > 1:1107088/1‑193 (MQ=255) tGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTg > 1:2298766/1‑261 (MQ=255) tGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTg < 1:1631773/261‑1 (MQ=255) tGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTTCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCa > 2:2908267/1‑289 (MQ=255) ccTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGt < 1:1533081/289‑1 (MQ=255) tCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGttt < 2:1590896/289‑1 (MQ=255) cGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCt > 2:3180097/1‑195 (MQ=255) ttGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATg < 1:3168913/289‑1 (MQ=255) tggAAAAGGCTGGTCTTCGGTAAGGATAAAGCCATGGAGTCGCTGCCTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATg < 2:1036817/287‑1 (MQ=255) tGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGt < 1:649975/269‑1 (MQ=255) tGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGt > 2:649975/1‑269 (MQ=255) gCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATg > 1:2420965/1‑190 (MQ=255) gCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATg < 2:2420965/190‑1 (MQ=255) tGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCaa < 1:298748/289‑1 (MQ=255) gTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACCGGGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCaa > 2:2056895/1‑288 (MQ=255) tCGGTCAGAATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACGTCAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATcc < 1:46549/289‑1 (MQ=255) ggTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCcac > 1:2535978/1‑289 (MQ=255) cAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATg < 1:1584711/289‑1 (MQ=255) gATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTgcg < 2:1761225/219‑1 (MQ=255) aTAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCAGGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGCGGTGACGGTACAGCTTTGGAAAGCTTTGGGCATGGAGCTTCTGCGATTTGATATGTCCGCGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCTGTTTGCTGCCTGATGCGGTCATCAAGCAGCCAAATGCGGt > 2:570361/1‑289 (MQ=255) aTAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGt > 2:502825/1‑289 (MQ=255) aTAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCACTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATg > 2:2874596/1‑185 (MQ=255) ttGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGat > 1:96424/1‑161 (MQ=255) ttGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGcc < 1:2122318/183‑1 (MQ=255) ttGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGtgctgct > 1:1050956/1‑286 (MQ=255) tGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGa < 1:1160985/217‑1 (MQ=255) aGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGaaa > 1:740277/1‑289 (MQ=255) ttAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGa < 2:2695644/148‑1 (MQ=255) ttAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAgcgc > 1:827411/1‑288 (MQ=255) ttAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTATTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGt > 1:3049157/1‑202 (MQ=255) ttAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTATTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGt < 2:3049157/202‑1 (MQ=255) ggCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGAc > 1:1884564/1‑289 (MQ=255) gcgcGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTGGGTTGTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCTACAAGCAGCCACATGCGGTGCTGCCGCTGGACGCGAGCGAGAACGCGCAcaccgagt > 2:1831215/1‑282 (MQ=255) cgcgTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCa < 2:1520909/238‑1 (MQ=255) cgcgTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGCCCGCGTATATGGAACGCCATACCGACAGCCGCCTTATTGGTGAGCCTCCGGGATAAGTTGGTTTGGATCAGGGCGCTTTGCTGACTGATGCGGTCGTCATGCATCCACATGCGTGGCTGCTGCTGCACGCAATCGACAAAGCACAACCGGCCgt > 2:2484755/1‑289 (MQ=255) gTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGtt < 1:1008343/289‑1 (MQ=255) tttAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATAtt > 1:2903443/1‑289 (MQ=255) ggTCACGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGt > 2:3013020/1‑289 (MQ=255) aCGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAata > 1:612570/1‑279 (MQ=255) cGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTc > 1:2653226/1‑117 (MQ=255) cGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGc > 1:3318468/1‑145 (MQ=255) cGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATATGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAg > 2:385593/1‑289 (MQ=255) cGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAgc < 2:731823/258‑1 (MQ=255) cGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAg > 1:2749686/1‑289 (MQ=255) cGAACATAAACCGGTTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTAAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCATCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGTGCGGTTTTCTGACTGATGCGGTCATCAGGCACCCACATGCGGTTCGGCTGCTGGACGAAATAGAGAAAGAGCACCTGGACTGGTCCAATATTCTGTTCCAg > 2:2281738/1‑289 (MQ=255) cactAAACCGGCTGGTTAGTTCCTGTTTGCCGGCCCTAAC‑GGGGTCGGGAAAACAGCGGTGATGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTg < 2:3163171/286‑1 (MQ=255) aaCCGGGTGGTTCGTTCCTGTTTGCCGGCCCTCCC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGa < 2:2233907/289‑1 (MQ=255) gttggttcgttCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAatat > 2:1957037/10‑266 (MQ=255) ttggttcgttCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACgg > 1:2864155/9‑289 (MQ=255) tgggttcgttCCTGTTTGCCGGCCCTACA‑GGGGTCGGGAAAACAGAGTTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCGTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACg < 2:837306/280‑1 (MQ=255) ggttcgttCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTa < 1:1411133/283‑1 (MQ=255) tcgttCCTGTTGGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGGGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTAGATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGc < 2:1562890/286‑1 (MQ=255) gttCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTg < 1:3269532/288‑1 (MQ=255) ccTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGAc < 1:128845/244‑1 (MQ=255) cGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATg < 1:2461537/82‑1 (MQ=255) cGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTGACCGATaacaac < 2:1884564/289‑1 (MQ=255) tccc‑GGGGTCGGGAAAACGGAGGTGACGGTACGGCTTTCTAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGGTATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCa < 2:3285595/234‑1 (MQ=255) gTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTg > 1:1470940/1‑246 (MQ=255) gTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGa > 1:1824637/1‑251 (MQ=255) gTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTGACCGATAACAACGGACGCAAAGCa < 2:1396388/288‑1 (MQ=255) gTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTGACCGATAACAACGGACGCAAAGCAg > 1:2619782/1‑289 (MQ=255) gTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTGACCGATAACAACGGACGCAAAGCAg > 1:85017/1‑289 (MQ=255) gTCGGGAAAAAAGAGGTGACGGTAAAGGTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTGACCGATAACAACGGACGCAAAGCa < 2:1219493/288‑1 (MQ=255) cGGGAAAACAGAGGGGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTGACCGATAACAACGGACGCAAAGCAGa < 2:1148640/288‑1 (MQ=255) ggAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGt < 2:231191/124‑1 (MQ=255) aaaCAGAGGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTGACCGATAACAACGGACGCAAAGCAGACTTCCg < 1:1567385/289‑1 (MQ=255) agGTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAgg < 1:2918908/129‑1 (MQ=255) ggTGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTGACCGATAACAACGGACGCAAAGCAGACTTCCGTAACg < 1:173286/287‑1 (MQ=255) tGACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGGGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTGACCGATAACAACGGACGCAAAGCAGACTTCCGTAACgtgg < 2:1445912/288‑1 (MQ=255) gACGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTGACCGATAACAACGGACGCAAAGCAGACTTCCGTAACgtggtg < 1:3197352/289‑1 (MQ=255) aCGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCg > 2:895956/1‑201 (MQ=255) cGGTACAGCTTTCGAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTGACCGATAACAACGGACGCAAAGCAGACTTCCGTAACGTGGTGc < 2:2618004/288‑1 (MQ=255) ||| CAAACGCAAGAAAACCGTTAATGTGGCGGATATTGAGTCCGTGGTGGCCCGTATTGCACGCATTCCAGAGAAGAGTGTTTCTCAGAGTGATCGTGATACCCTGAAAAACCTCGGCGATCGCTTGAAAATGCTGGTCTTCGGTCAGGATAAAGCCATTGAGGCGCTGACTGAAGCCATTAAGATGGCGCGTGCAGGTTTAGGTCACGAACATAAACCGGTTGGTAGCTTCCTGTTTGCCGGCCCTACC‑GGGGTCGGGAAAACAGAGGTGACGGTACAGCTTAGCAAAGCTTTGGGCATTGAGCTTCTGCGCTTTGATATGTCCGAGTATATGGAACGCCATACCGTCAGCCGTCTTATTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTTTGATCAGGGCGGTTTGCTGACTGATGCGGTCATCAAGCATCCACATGCGGTGCTGCTGCTGGACGAAATCGAGAAAGCGCACCCGGACGTGTTCAATATTCTGTTGCAGGTGATGGATAACGGTACGCTGACCGATAACAACGGACGCAAAGCAGACTTCCGTAACGTGGTGCTGGTG > CP042583/787402‑787963 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |