| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 807,200 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 807,200 | 0 | A | T | 99.8% | 1110.4 / NA | 463 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (232/229); minor base C (1/0); total (234/229) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 807,201 | 0 | G | C | 100.0% | 1114.9 / NA | 463 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (234/229); total (234/229) | |||||||||||
| * | CP042583 | 807,202 | 0 | C | G | 99.8% | 1099.8 / NA | 463 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (233/229); total (234/229) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 463 total aligned reads displayed.
GTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTAGTCCAATGCGCGCTTTTAACAGCCTCAACCGGGTAGGGGCTAGTGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTAGCATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGAGTCCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTACTGGGTTACCTGTTGTTGAGTCTGGCTGGCGTCGATGGCTGGGCGATGCGTCTGCTG > CP042583/806920‑807478 ||| ggAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAg > 1:1717147/1‑289 (MQ=255) aaGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAgg < 1:349595/288‑1 (MQ=255) tGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGcc > 2:1377549/1‑280 (MQ=255) tGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCg > 1:2633223/1‑281 (MQ=255) tGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAggcggc > 2:906931/1‑289 (MQ=255) cATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGc < 1:3275398/288‑1 (MQ=255) cATGAATGGCCGCGGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAAGGTGTGGCGGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTAATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGc < 2:360317/288‑1 (MQ=255) cGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCTCCTGCATGTTTTGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGATTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCATCGGCTCGATTTTTTTTTCCGTAGGGGGGATCGggtggtctgtgg > 2:1069236/1‑282 (MQ=255) gCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGTCGGCATCGGTGGGTTGCTGGCa > 2:1020455/1‑289 (MQ=255) tgatgaTCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCaa < 1:1900250/288‑1 (MQ=255) cACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGaaaaa > 2:145907/1‑288 (MQ=255) cACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGaaaaa > 1:2959933/1‑288 (MQ=255) cACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGaaaaa > 1:2603048/1‑288 (MQ=255) ggCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTgtcaccgg > 2:3224777/1‑281 (MQ=255) gCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTgtcaccggc < 1:1285112/288‑9 (MQ=255) cAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCa < 1:746903/288‑1 (MQ=255) aTGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTgtcaccg < 1:415112/283‑7 (MQ=255) aTGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCAtt > 1:723821/1‑288 (MQ=255) gtgtAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCATGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCg < 1:1199605/289‑1 (MQ=255) gtggCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGt < 2:1206897/285‑1 (MQ=255) aGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCt < 2:731374/288‑1 (MQ=255) gtggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCtgtg > 1:1515159/1‑289 (MQ=255) gtggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCtgtg > 2:2385735/1‑289 (MQ=255) ggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCtgtg > 1:3060145/1‑287 (MQ=255) ggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCCCCCTCTTAGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACACGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCAATCAGTAACGAAATCACCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCAGGTTGCTGGCAATGCTGACAAAGCTGTCCCCGGCATTGCGTCCGCTGTgg > 2:425398/1‑288 (MQ=255) cTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGa > 1:1160184/1‑289 (MQ=255) tGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGAt < 1:922921/289‑1 (MQ=255) gCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGaaa < 2:404020/243‑1 (MQ=255) ttGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTc < 1:2672875/289‑1 (MQ=255) ggCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCtt > 1:1638525/1‑289 (MQ=255) tgctCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTgtcaccggc < 1:2415076/247‑9 (MQ=255) tgctCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCt > 2:1573250/1‑259 (MQ=255) cGACCTGCGGGCAGAAGCCCAGCAGCGTTTTATCGCCTGCATGTTTGTTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTTTGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGt < 1:1069236/288‑1 (MQ=255) cGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGt < 1:2788669/288‑1 (MQ=255) cGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGt < 1:2022746/288‑1 (MQ=255) aCCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTTTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGCTAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCACCTTTTTCTg > 2:1277199/1‑289 (MQ=255) aCCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCTTACGCTGTGGCGTATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTGGTCTg > 2:1776201/1‑289 (MQ=255) aCCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTATTGGCGTCATCTTTGTCTg > 1:3216508/1‑289 (MQ=255) aCCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTACGCGGCATCGGCTGGTTGCTGCAAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGAGTTCGCCGTGGCTGATAGTGACGATGGGTCGTCGCGTCATATTTGTCTg > 2:1887602/1‑289 (MQ=255) gggCAGAAGCTCAGCAGCGTGTTATGGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGGGCTGATGGGCATTGGCGTTATCGCCTCTATGCTCCAGCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGgatga < 2:587261/286‑1 (MQ=255) atcccATCTGCGTGTGATCGCCTGCATGTTTGGTTTCTGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTGTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGGTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGc < 2:2521125/285‑1 (MQ=255) aGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGc < 1:145907/287‑1 (MQ=255) aGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCgt < 2:2603048/289‑1 (MQ=255) tgtTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCAt > 2:688848/1‑212 (MQ=255) tgtTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTTCGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGc > 2:1006764/1‑275 (MQ=255) tgtTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTTCGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGc < 1:1006764/275‑1 (MQ=255) tgtTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGc > 1:1018669/1‑289 (MQ=255) ttATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGtat < 1:1045152/281‑1 (MQ=255) cTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATAc < 1:1776201/288‑1 (MQ=255) tGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCttttt < 1:2490021/146‑1 (MQ=255) tGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCa > 2:2286444/1‑177 (MQ=255) tGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTgg < 2:884869/216‑1 (MQ=255) cATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTa > 2:2956736/1‑206 (MQ=255) cATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGGGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTTCGGTGGTATAACAGCATTGacggtc > 2:1045152/1‑282 (MQ=255) aTGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTc < 1:2994577/289‑1 (MQ=255) ttATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATa < 2:2557477/274‑1 (MQ=255) ttATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTgg < 2:2005695/288‑1 (MQ=255) ttATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGt < 1:169299/289‑1 (MQ=255) tATTGGTGCTGATCGGCATTGGCTTTGTCGCCTCTATGCTCCATGTTGGTTCACCAATGCGCGATTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTa < 2:3054057/289‑1 (MQ=255) tATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTa < 2:2421984/289‑1 (MQ=255) aTGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACg < 2:741516/196‑1 (MQ=255) tGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTGAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGgatga > 2:2657718/1‑244 (MQ=255) cTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCt > 2:1624557/1‑232 (MQ=255) cTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCCGAAAAAGCTgtca > 1:1562897/1‑171 (MQ=255) cATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAAc < 1:895479/247‑1 (MQ=255) gCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGt > 2:2984510/1‑217 (MQ=255) tttATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGc < 1:870787/288‑1 (MQ=255) tttATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGc < 1:677901/288‑1 (MQ=255) tATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCt > 2:1176731/1‑215 (MQ=255) ctctATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCt > 2:2845071/1‑203 (MQ=255) ctATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATggg > 2:1534949/1‑277 (MQ=255) tATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGTACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGGCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCGTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTTGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACg < 1:1887602/289‑1 (MQ=255) tATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACg < 2:3162769/289‑1 (MQ=255) cATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACg > 1:3193837/1‑156 (MQ=255) cATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGCTGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCGGGCCGCCGAGGGGCTTCTTCCTGACGCTGTTTa > 2:1724978/1‑289 (MQ=255) tCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTgtcaccg < 1:2886962/142‑7 (MQ=255) cttggttcaccAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATgg > 1:2239361/10‑289 (MQ=255) ttggttcaccAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATggg < 1:969928/281‑1 (MQ=255) tggttcaccAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAAc > 1:499249/8‑217 (MQ=255) gttcaccAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGc < 2:825104/199‑1 (MQ=255) gttcaccAATGCGCGCTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGc > 1:825104/6‑204 (MQ=255) gcgcTTTTAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTACTggg < 1:2551912/289‑1 (MQ=255) ttttAACTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGa > 2:1698953/1‑152 (MQ=255) cTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCgt > 2:1899636/1‑180 (MQ=255) cTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATAc > 1:2129422/1‑200 (MQ=255) cTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATAc < 2:2129422/200‑1 (MQ=255) cTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTa > 2:523898/1‑215 (MQ=255) ggTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTACTGGGTTACCTGTTGTTGAGTctg > 1:3120259/1‑286 (MQ=255) gcttcagCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCg < 1:218094/133‑1 (MQ=255) gcttcagCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCg > 2:218094/7‑139 (MQ=255) cagCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATggg < 1:612197/239‑1 (MQ=255) cagCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTACTGGGTTACCTGTTGTTGAGTCTGGCTGGCGTCGa < 2:950905/284‑1 (MQ=255) cagCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTACTGGGTTACCTGTTGTTGAGTCTGGCTGGCGTCGATg > 1:1589747/3‑288 (MQ=255) agCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCg > 2:332024/2‑187 (MQ=255) tCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTACTGGGTTACCTGTTGTTGAGTCTGGCTGGCGTCGATGGCTGGGc > 1:1364967/1‑289 (MQ=255) aGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGc < 2:3096828/151‑1 (MQ=255) aGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGc > 1:3096828/1‑151 (MQ=255) aGTAACGAAATCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGta > 1:2310730/1‑158 (MQ=255) aaTCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGcc > 2:272756/1‑230 (MQ=255) aaTCGCCAGCGGTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGcc < 1:272756/230‑1 (MQ=255) ||| GTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTAGTCCAATGCGCGCTTTTAACAGCCTCAACCGGGTAGGGGCTAGTGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGGTAGCATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGAGTCCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTACTGGGTTACCTGTTGTTGAGTCTGGCTGGCGTCGATGGCTGGGCGATGCGTCTGCTG > CP042583/806920‑807478 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |