Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 808,906 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 808,906 | 0 | A | T | 99.2% | 841.5 / NA | 356 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (174/178); minor base C (3/0); total (177/179) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 808,907 | 0 | G | C | 100.0% | 849.8 / NA | 356 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (177/179); total (177/179) | |||||||||||
* | CP042583 | 808,908 | 0 | T | A | 99.4% | 843.9 / NA | 356 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base A (175/178); minor base C (2/0); total (177/179) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.48e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 356 total aligned reads displayed.
TCTTCAGCATTAGCGTTATGAATGAGTAATATAAATCGATAATACCGCCGCTGGGATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCAGTTCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGAGTCGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGT > CP042583/808626‑809186 ||| cGTTATGAATGAGTAATATAAATCGATAATACCGCCGCTGGGATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAAc < 2:1079150/288‑1 (MQ=255) atgaatgaGTAATATAAATCGATAATACCGCCGCTGGGATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGACCACCTGTCCACATGCCAGGTAGGCGTTGGCCGCCCCTCCTATTTTA‑CCGTCAACCTTg > 2:2672607/1‑288 (MQ=255) atgaatgaGTAATATAAATCGATAATACCGCCGCTGGGATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTg > 2:1989040/1‑288 (MQ=255) atgaatgaGTAATATAAATCGATAATACCGCCGCTGGGATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGt < 1:1580273/289‑1 (MQ=255) gaatgaGTAATATCAATAGATAATACCTCCGCTGAGATATCGCGTATTTTCACCCATTGACCATGTTTTTGGCGGTTGCAGAATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCGACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCg < 2:1912182/289‑1 (MQ=255) tAATATAAATCGATAATACCGCCGCTGGGATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACAtt > 2:481245/1‑289 (MQ=255) ataAATCGATAATACCGCCGCTGGGATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTg > 1:2537119/1‑289 (MQ=255) aTCGATAATACCGCCGCTGGGATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTCGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAg > 2:3084099/1‑289 (MQ=255) taataCCGCCGCTGGGATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATTTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCAACCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTTGGTACCTTGTGTACAGGGGAt > 2:1590277/1‑289 (MQ=255) taataCCGCCGCTGGGATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTACACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCAGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCGCGCCCAGGAACACATGTCCAAATCGCAGGTAGGCCTTGACAGCTCATACTATTTTA‑CCGGCAACCTTATCGGGAACTTGCGGACAggggtt > 2:2052284/1‑286 (MQ=255) ccgcTGGGATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTaa > 1:2034957/1‑289 (MQ=255) gggATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCa < 1:2998879/289‑1 (MQ=255) gggATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCa < 1:2672607/289‑1 (MQ=255) gggATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCACCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACa < 1:958048/270‑1 (MQ=255) tCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCt > 2:600489/1‑289 (MQ=255) tCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCt > 1:2229843/1‑289 (MQ=255) tCGCGTACTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGt < 1:739015/268‑1 (MQ=255) tCGCGTACTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGt > 2:739015/1‑268 (MQ=255) cgTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGt > 1:105269/1‑265 (MQ=255) cgTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTa > 1:2507198/1‑289 (MQ=255) tATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCa < 2:1050605/278‑1 (MQ=255) aTTTTAACCCATTGTAAAGGGTTTTGTAGGTGGCATGATTCTAATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTACACGTATCCCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAAcc < 2:2034957/289‑1 (MQ=255) ttGAAACTGTTTTTGGCGGTGGCATGATGTGCATTAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCtattat < 2:1524488/289‑1 (MQ=255) tGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCg > 2:820567/1‑266 (MQ=255) tGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCa > 1:465681/1‑289 (MQ=255) ggCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCAt > 1:2636584/1‑289 (MQ=255) ggTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGATTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCAttt < 2:924874/288‑1 (MQ=255) tGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCAtt < 1:1235741/240‑1 (MQ=255) tGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCa > 2:1646296/1‑247 (MQ=255) tGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCCCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGCTGTCAGCTCATCCTCTTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACACTGCTGACAGGGTCTGTTATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTGTTATCTGGCCTCCTTTAttttt > 2:2423272/1‑288 (MQ=255) gttgccaaTGAAATTTAAATTCCCTC‑CCGTTTTTATTCAATTTCACCTTTAACCCGGCTGTTATGGTTTTGCCTGCTTGGCTGGCTTTGTTTGCTCCGGGGAATGCGGTGTTAAAATCCATCGTGGCGCCTTTGCTCGCCCAGGAAAACCTGGTCCCATTGCAGGTTAGCGTTGTCAGCTCATTCTATTTTACCCGCCACCCTTTCCGGTAC‑TTTCTTACAGGGTATTTTATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCgctgg < 2:144322/282‑1 (MQ=255) aTGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGc < 1:389633/289‑1 (MQ=255) ttGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTa < 1:335639/197‑1 (MQ=255) cTTCCTCACGTTTTTAATTCATGTCCACGGATACCCTGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCTTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATAGCCTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACAAGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCt < 2:3002357/289‑1 (MQ=255) cTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCt < 2:1325790/289‑1 (MQ=255) ccTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCATCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGTGTATGTCATTAAGCGCATTGGCGTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCtgat > 1:1035699/1‑289 (MQ=255) ccTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGGCtgat > 1:1743508/1‑289 (MQ=255) tCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCtgatga < 1:619111/289‑1 (MQ=255) cGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTg < 2:2636584/289‑1 (MQ=255) ttttAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGAt > 1:114388/1‑289 (MQ=255) ttAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCg > 2:156496/1‑222 (MQ=255) ttAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCg < 1:156496/222‑1 (MQ=255) ttAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGAt > 1:16255/1‑287 (MQ=255) tGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTg > 1:3165838/1‑289 (MQ=255) gTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggct < 1:481245/289‑1 (MQ=255) aGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGt > 1:1763528/1‑155 (MQ=255) aGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCgctgg < 1:2819336/235‑1 (MQ=255) aGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGcc > 1:1480077/1‑246 (MQ=255) ccTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCg < 2:2909390/197‑1 (MQ=255) ccTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCg < 1:1447972/197‑1 (MQ=255) ccTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGc < 2:2527371/212‑1 (MQ=255) ccTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTg > 1:3052659/1‑289 (MQ=255) gTCATGCTTTTGCTTGCTGGCCTGCTTTGGTGGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTcg < 2:3052659/289‑1 (MQ=255) tCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACAt > 1:1307732/1‑153 (MQ=255) tttGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAgg > 1:571672/1‑156 (MQ=255) gCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTTGCCTGATGATTGGTTTCTGGATCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTGGGc > 2:1730881/1‑289 (MQ=255) gCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGc > 2:3227861/1‑289 (MQ=255) tGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGt > 2:114395/1‑144 (MQ=255) cTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCt < 2:2861323/119‑1 (MQ=255) cTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGAttt > 1:1992836/1‑289 (MQ=255) ttgttgCCTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTTCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTggg < 1:896941/289‑1 (MQ=255) ttgttgACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTggg < 1:1285682/289‑1 (MQ=255) ctctGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGc > 2:890501/1‑206 (MQ=255) ctctGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCCGTGCCATGGTTTGGGTGgttgt > 1:1883843/1‑289 (MQ=255) tGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGt < 2:2247052/113‑1 (MQ=255) gCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttg < 2:24595/239‑1 (MQ=255) ttAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTAtttt > 1:2925010/1‑81 (MQ=255) aaTACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCa > 1:2618562/1‑127 (MQ=255) aaTACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCa < 2:2618562/127‑1 (MQ=255) acTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCgctgg < 1:3273841/171‑1 (MQ=255) tCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGc < 1:2423880/175‑1 (MQ=255) tCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTTCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGGGCGCGGTGGTGTGCAGTgggcg > 2:2718553/1‑287 (MQ=255) tCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTggg < 2:1219142/255‑1 (MQ=255) tCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGAtgtg < 2:1240331/280‑1 (MQ=255) tGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACa > 2:2928504/1‑98 (MQ=255) tGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTTGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGa > 1:286394/1‑285 (MQ=255) gCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGt < 2:95857/85‑1 (MQ=255) ttGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAgcgcg > 1:1686421/1‑262 (MQ=255) cccAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACa > 1:828715/1‑83 (MQ=255) cccAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCt < 1:2161861/169‑1 (MQ=255) cccAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCt > 2:2161861/1‑169 (MQ=255) cccAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACg > 1:1214735/1‑272 (MQ=255) caTGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct < 2:409414/289‑1 (MQ=255) aTGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGc < 1:2098655/156‑1 (MQ=255) aTGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGc > 2:2098655/1‑156 (MQ=255) gTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTtgctgca < 2:1132115/289‑2 (MQ=255) tCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGcc < 1:800151/148‑1 (MQ=255) caTGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGc < 2:1381882/208‑1 (MQ=255) caTGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGc > 1:1381882/1‑208 (MQ=255) aTGGGAGGTAGGCGTTGTAAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTTTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatg < 1:3070772/289‑1 (MQ=255) cAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAgcgcg < 2:1786324/231‑1 (MQ=255) cAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGGTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATgg > 1:1102373/1‑289 (MQ=255) aGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTTGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTGGCTGGCTGCGTATATggtggt > 2:2502376/1‑289 (MQ=255) aGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCtgatga > 2:3282381/1‑150 (MQ=255) gTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGGGGGCGGTTGCTTGCTGCGTATATGGTGGttt > 1:2973906/1‑289 (MQ=255) gCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCg < 1:2714578/253‑1 (MQ=255) cGTTGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTAc > 1:979542/1‑289 (MQ=255) ttGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTGTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGGTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCATGTAACCGTGGGCGTTTGCTTACTGCGTTATTGATGGTTTTTTGCGt > 2:1472078/1‑289 (MQ=255) ttGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCgg > 2:2974777/1‑187 (MQ=255) ttGTCAGCTCATCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGAtgtg < 1:2063355/229‑1 (MQ=255) ||| TCTTCAGCATTAGCGTTATGAATGAGTAATATAAATCGATAATACCGCCGCTGGGATATCGCGTATTTTCACCCATTGACAATGTTTTTGGCGGTGGCATGATGCGCATGAAATTTGAACTTCCTCACGGTTTTAATTCATGTCCACGTATACCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCAGTTCCTATTTTA‑CCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGAGTCGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGT > CP042583/808626‑809186 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |