Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 828,582 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 828,582 | 0 | A | T | 99.7% | 900.8 / NA | 376 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base T (186/188); total (187/189) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 828,583 | 0 | G | C | 99.7% | 898.4 / NA | 376 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (187/188); minor base A (0/1); total (187/189) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 828,584 | 0 | T | A | 99.7% | 900.1 / NA | 376 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base A (186/188); total (187/189) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 376 total aligned reads displayed.
TGCAACTGGGAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCAGCTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTAAGTTTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGCTCCACTGGCATAATCTTGA > CP042583/828304‑828859 ||| tgaaaCTGGGAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTcccc < 1:146910/286‑1 (MQ=255) tGCATCTGGGCATCTCACTTCTGCTTATGCCAGTTCAAATCGTAATATTTTATGTCATTCGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTTACATTTCTCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTcccc < 1:1579075/289‑1 (MQ=255) gCAACTGGGAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCa < 1:3258245/289‑1 (MQ=255) aaCTGGGAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATg < 2:2228850/289‑1 (MQ=255) aCTGGGAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATgg < 1:3188794/289‑1 (MQ=255) aCTGGGAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTACATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATgg < 1:187148/289‑1 (MQ=255) ggAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTcccc < 2:2933467/281‑1 (MQ=255) ggAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCt > 1:1643523/1‑289 (MQ=255) tGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACg > 2:1937252/1‑288 (MQ=255) tGCAAATCGTCATATTTCATCGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACg > 1:1094241/1‑288 (MQ=255) ttCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGcc < 2:3301061/289‑1 (MQ=255) cATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCa > 1:2237743/1‑288 (MQ=255) tGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCa < 2:1643523/289‑1 (MQ=255) tAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAAtgtgt > 1:2701049/1‑289 (MQ=255) aGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAAtgtgtg < 1:1187182/289‑1 (MQ=255) tttATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCt > 1:2176829/1‑289 (MQ=255) tATTGCAACTCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTTCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTg < 1:698097/289‑1 (MQ=255) tATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTg < 2:120172/289‑1 (MQ=255) ttGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTATTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAAAATGGCTGAATGTTGGGAATGGCTATCATTTTGCCCATGGTTCTTAATGGTGGTATGGGGATGAAAGGCCTGGCGACCGTTGGCAGCAAGGGGTGTGGTTGGAGGCTTgat > 1:881328/1‑287 (MQ=255) aaTCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGAtgt > 1:2784137/1‑289 (MQ=255) ttCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATgg < 1:2223073/218‑1 (MQ=255) tGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAAcc < 2:761765/289‑1 (MQ=255) gACATTTTTCACGGTTCCGTTGTTCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAAcc < 2:724508/288‑1 (MQ=255) tttATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGAc < 2:1312693/289‑1 (MQ=255) tCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCCATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTCATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAACACCTCGACCTg > 2:3000177/1‑288 (MQ=255) ggTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCCTGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGCGTGTGGCTGGACGCTTGCCGACGTGCTGGCAGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAg > 2:2610878/1‑289 (MQ=255) gTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACt < 2:2806322/185‑1 (MQ=255) ttCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGt < 1:387551/288‑1 (MQ=255) tcagTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTgg < 1:1546836/286‑1 (MQ=255) ccGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCt < 1:2984204/241‑1 (MQ=255) aTCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAAtgtgt > 2:2306622/1‑222 (MQ=255) tCCTGGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTa < 2:2245870/289‑1 (MQ=255) ccTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCATCTGTAc > 1:2080585/1‑289 (MQ=255) ccTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTAc > 2:3266851/1‑289 (MQ=255) ccgcGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCt > 2:266155/1‑289 (MQ=255) cgcgATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCt < 1:1025334/288‑1 (MQ=255) tAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGt < 1:142507/255‑1 (MQ=255) aaGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGtt > 2:1807098/1‑144 (MQ=255) aaGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGc < 2:1574435/257‑1 (MQ=255) aaGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTg > 2:2523299/1‑289 (MQ=255) gCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAg < 1:2252038/253‑1 (MQ=255) ttAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCa < 1:648843/180‑1 (MQ=255) cTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCa > 1:589720/1‑289 (MQ=255) ggAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGa > 2:1477655/1‑289 (MQ=255) aGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCa > 1:48509/1‑119 (MQ=255) aGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCaa > 1:2353273/1‑269 (MQ=255) aGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGc > 1:1001756/1‑289 (MQ=255) tGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGa < 1:1864019/289‑1 (MQ=255) ggTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCa < 1:259151/107‑1 (MQ=255) tCTTGCCGACCGGCCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGCAGGGTGGATCAACATTGCTGAACGATGGCAATGTGTATCCTTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTTTGGCGATTAAACACCTGGCGAACGTTGCCAGCCATGTGTGTGTCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTCGCAAAATCATCGACCTGACGTGGGGCGGCTGCACCCGTTTGCTGTCCGGAAAGGGCTGGCAGTGGTGAGAGCGAGACACGGCGAGGCgctggtg > 2:1054781/1‑283 (MQ=255) cTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGAGAGTCAGACACGGCAAAGCGGATctct > 2:872229/1‑289 (MQ=255) cTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTACTGGGGGTTGAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCCGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTTTACATGCTTTAGGTCGGGCAAGGGCTGGCCATGGTGATAGCCAGGAAAGGCAAAGCGATcctc > 2:2564885/1‑288 (MQ=255) ttGCCTACCGGTCTTTGGGTTTACTTTGCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCAGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCGATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTa < 2:2472421/289‑1 (MQ=255) ttGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTa < 1:1276657/289‑1 (MQ=255) ttGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTa < 1:1915305/289‑1 (MQ=255) ttGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGGGGCAGCTGTACATGGTTGGTGTCGGGCAAGGGCTGGGCATTGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGGAtctcca > 2:2122835/1‑287 (MQ=255) gACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAGAGCGATTCTCTATGaca < 2:2069959/289‑1 (MQ=255) aCCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAg > 1:3304743/1‑215 (MQ=255) gTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGa > 2:463532/1‑289 (MQ=255) tCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGa < 2:2390539/288‑1 (MQ=255) tGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGActggc < 1:1704176/289‑1 (MQ=255) ggCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGActggcc < 1:44004/289‑1 (MQ=255) ctgtACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTGTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGActggc < 1:3053912/283‑1 (MQ=255) tACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAAcc > 2:387121/1‑181 (MQ=255) tACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAggg < 1:2046551/227‑1 (MQ=255) tACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAggg > 2:2046551/1‑227 (MQ=255) tACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGa < 1:2474331/248‑1 (MQ=255) tACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAg > 1:2646216/1‑258 (MQ=255) tACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTa > 2:3023429/1‑268 (MQ=255) tACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTa < 1:3023429/268‑1 (MQ=255) tACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGa > 1:766207/1‑278 (MQ=255) tACTATTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTg < 2:416505/144‑1 (MQ=255) tttCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGaa < 1:1235265/289‑1 (MQ=255) ttCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGaca < 1:3272548/268‑1 (MQ=255) tCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAgg < 2:911545/289‑1 (MQ=255) ggTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAg > 1:2755898/1‑289 (MQ=255) tttGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGc > 2:2533997/1‑176 (MQ=255) tttGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGActggcct > 2:1700705/1‑263 (MQ=255) ttGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCaacaac < 1:1969227/289‑1 (MQ=255) cGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAACCCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGAt < 2:642741/289‑1 (MQ=255) tGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGa > 2:271390/1‑158 (MQ=255) taaaCATTGCTGAATGTTGTCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGTGGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGc < 2:1401359/286‑1 (MQ=255) tCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGc < 2:571508/288‑1 (MQ=255) cAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCAGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGGTTCTCTATGACACAGGActggc > 1:252647/1‑243 (MQ=255) cATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAAt > 2:334249/1‑90 (MQ=255) cATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAAt < 1:334249/90‑1 (MQ=255) aTTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTa > 1:922288/1‑224 (MQ=255) ttGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAAtgtgtg > 2:1865507/1‑93 (MQ=255) ttGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGc > 2:1437150/1‑177 (MQ=255) cTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAAtgtgt > 2:3158874/1‑89 (MQ=255) cTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGt < 2:1015705/147‑1 (MQ=255) cTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCa > 2:10956/1‑175 (MQ=255) cTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGCTCCACTGGCa > 2:3121901/1‑289 (MQ=255) cTGAATGTTGGAAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGActggc < 2:2200710/235‑1 (MQ=255) tGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAACACATCGACATGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTTGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGAAAAGCGACTCTCAATGATACAGGACTGGCATGGAATGACGGGGCAAGTGAGCAACACCCGACTTTCCCCGGGATCGACTGTCagatt > 2:1871984/1‑284 (MQ=255) tGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCtt > 2:276050/1‑159 (MQ=255) tGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGTCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGa < 1:2897848/222‑1 (MQ=255) tGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGaca > 1:820333/1‑217 (MQ=255) tGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGaca < 2:820333/217‑1 (MQ=255) tGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGCTCCACTGGCATAATCTTg > 1:1822423/1‑289 (MQ=255) ||| TGCAACTGGGAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCAGCTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTAAGTTTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGCTCCACTGGCATAATCTTGA > CP042583/828304‑828859 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |