| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 829,890 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 829,890 | 0 | A | T | 99.5% | 1002.5 / NA | 415 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (198/215); minor base G (2/0); total (200/215) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 829,891 | 0 | G | C | 100.0% | 993.4 / NA | 415 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (200/215); total (200/215) | |||||||||||
| * | CP042583 | 829,892 | 0 | T | A | 99.8% | 1002.6 / NA | 415 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (199/215); minor base C (1/0); total (200/215) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 415 total aligned reads displayed.
AGCGTTAATCCTCAACGCAGCCAGCGATACCTTCATGTTAAGCCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTAAGTGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTAGTTTCTTTGACAAACAGAGTACGGGTACGCTGTTGAGTCGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGAGCATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGAGCATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTAGCATTGCGATTCGCGTTGTAAGCAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAGCGCAGAACAAATGCTGAAGGGCCACAAAGAAGTATTGAT > CP042583/829610‑830170 ||| cGTTAATCCTCAACGCAGCCAGCGATACCTTCATGTTATCGCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTa > 1:890106/1‑288 (MQ=255) aTCCTCAACGCAGCCAGCGATACCTTCATGTTATCGCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACg > 2:953277/1‑289 (MQ=255) cGCAGCCAGCGATACCTTCATGTTATCGCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACGGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCTaa < 2:886902/289‑1 (MQ=255) cGCAGCCAGCGATACCTTCATGTTATCGCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGaa > 2:115933/1‑289 (MQ=255) cTTCATGTTATCGCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGcttcttct > 1:477117/1‑289 (MQ=255) gctcctTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa < 1:660217/288‑1 (MQ=255) gctcctTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa < 1:734165/288‑1 (MQ=255) cACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACtg < 1:1511923/288‑1 (MQ=255) cACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACt < 1:386346/287‑1 (MQ=255) aCTTCTTGGTGATGGCTTTGGTTAAACAGGTCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACtgtt < 2:2434759/289‑1 (MQ=255) aCTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGGGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACtgtt < 2:1581045/289‑1 (MQ=255) ttcttGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCTCACTGATTACtgttgt > 1:1595904/1‑289 (MQ=255) ttcttGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACtgttgt > 1:244786/1‑289 (MQ=255) tgGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCg > 2:2163218/1‑236 (MQ=255) tgGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa < 2:198502/265‑1 (MQ=255) tgGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGt > 1:2943986/1‑289 (MQ=255) tgGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGt > 1:1703677/1‑289 (MQ=255) gCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa < 1:2210836/263‑1 (MQ=255) gCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa > 2:2210836/1‑263 (MQ=255) ttGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCgtc < 1:2894139/289‑3 (MQ=255) aaaaCAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCgtcgatca < 1:175154/289‑8 (MQ=255) agcAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa < 1:116272/251‑1 (MQ=255) aCAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGcttcttcacgcaca < 1:2236349/246‑8 (MQ=255) aTCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACt < 2:461136/250‑1 (MQ=255) aTCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCgg > 1:2353682/1‑286 (MQ=255) tCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGgcgc < 2:1455171/246‑1 (MQ=255) ggcgatgtgTATGCCGCTGATGGGTGTCGAGCTGATGATTTTACGTGGTGTCACCAGCGATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCatg < 2:1925449/284‑1 (MQ=255) tGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCatga < 1:258786/288‑1 (MQ=255) tGGTGTGGAGGCGGCTGGTGTGGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTAGCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCTCCGCCTGTTTGGGCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCatga < 2:3005853/288‑1 (MQ=255) tgtgGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGtt > 2:294961/1‑289 (MQ=255) gATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAAc > 2:1689964/1‑203 (MQ=255) gATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTTCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTAt > 2:2671331/1‑289 (MQ=255) gATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTAt > 1:1296222/1‑289 (MQ=255) gATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTGCTAt > 1:2623388/1‑289 (MQ=255) aTGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTAt < 1:2267817/288‑1 (MQ=255) gtccGCTGGTGGTGATCGGGATAATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTACCAGGAAAGGTGGTAATGACCAGGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTa < 2:2623388/287‑1 (MQ=255) cTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCatgatg > 2:1357601/1‑276 (MQ=255) ttACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACGGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATtg > 1:3196526/1‑289 (MQ=255) gTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCt < 1:1419350/289‑1 (MQ=255) ggTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGaa < 2:2885225/165‑1 (MQ=255) gTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTa < 1:1277048/154‑1 (MQ=255) gTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGgcgc > 1:3123677/1‑190 (MQ=255) gTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGgcgc < 2:3123677/190‑1 (MQ=255) ccAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGc < 2:2049256/224‑1 (MQ=255) ccAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGc > 1:2049256/1‑224 (MQ=255) tATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGc < 1:2004326/219‑1 (MQ=255) tGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACtg > 1:2709205/1‑188 (MQ=255) tctcCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGc < 1:2659825/215‑1 (MQ=255) tcCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACt > 1:2100913/1‑176 (MQ=255) aGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCAGCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCACCTGGCGACCATTTTGATTGTGCTGGCCCCGATtttttcgatttcga > 2:1755751/1‑279 (MQ=255) cTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTcc < 2:1031882/160‑1 (MQ=255) cTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTcc > 1:1031882/1‑160 (MQ=255) cTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGc > 2:188860/1‑205 (MQ=255) cTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGc < 1:188860/205‑1 (MQ=255) tcCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa > 1:1531086/1‑159 (MQ=255) ccTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGAt < 1:2873294/247‑1 (MQ=255) gggtatcaggAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCTTCGGCCTGTTCATCATGTTTTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTTCGATTCGCGTTGtttcgat > 2:2583472/9‑283 (MQ=255) gggtatcaggAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGAt < 2:2934321/236‑1 (MQ=255) gtatcaggAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTa > 1:326476/7‑160 (MQ=255) tcaggAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGtt < 2:1195698/286‑1 (MQ=255) tcaggAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACGGTCGATCATTTTGATTGTGTTGGTACCGATTGTTTCGATTGGGATTCGCGCTGTATCGAAGCGtt > 2:1251214/4‑289 (MQ=255) caggAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGc < 1:951952/186‑1 (MQ=255) aaaGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCg < 1:1684929/288‑1 (MQ=255) aaGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTgg < 1:280222/241‑1 (MQ=255) tggtAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTGTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACa < 1:2520784/288‑1 (MQ=255) tggtAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAAc < 1:1785253/287‑1 (MQ=255) cATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGcttcttc < 2:3282363/117‑1 (MQ=255) cATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAAc < 2:2473631/289‑1 (MQ=255) tGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTCCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACAt > 2:397768/1‑289 (MQ=255) gccgccTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCg < 2:2449584/139‑1 (MQ=255) ccgccTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAac > 2:2117522/1‑289 (MQ=255) tGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa < 1:2972621/116‑1 (MQ=255) gTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGc < 1:1091318/185‑1 (MQ=255) tGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACGGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATgggg < 2:841057/289‑1 (MQ=255) ggTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGc < 2:707874/289‑1 (MQ=255) ggTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGc < 2:1294113/289‑1 (MQ=255) ggTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGc < 2:2774385/289‑1 (MQ=255) cacaTGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCatgatg < 2:800118/162‑1 (MQ=255) cacaTGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCatgatg > 1:800118/1‑162 (MQ=255) atgatgGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGaa < 1:2433625/272‑1 (MQ=255) tgatgGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGt > 2:1715416/1‑229 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa < 2:234716/95‑1 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCCCTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCACCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACAGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACCTCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAgcg > 2:915318/1‑288 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGACGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTCCGATTCGCTTTGTATCGAAGCGTTTACGGAACATCAGTAAAAACATGCAAAACACCATGGGGCAGGTGacaacccgagc > 2:1526997/1‑284 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGc < 2:224002/134‑1 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTgtcg > 1:631833/1‑170 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTgtcg < 2:631833/173‑4 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGAt > 1:2468145/1‑184 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGAt > 2:209946/1‑214 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAgcgc > 1:854088/1‑289 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAgcgc > 2:1386141/1‑289 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAgcgc > 1:574436/1‑289 (MQ=255) cagtttcattCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGAt < 1:2116316/203‑1 (MQ=255) tttcattCTTTGAGAACCAGTCAACTGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAGCGCAGAAc < 2:3207410/283‑1 (MQ=255) tcattCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAGCGCAGAACaaa < 2:2524061/286‑1 (MQ=255) ttCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAGCGCAGAACAAAt > 2:1101355/1‑287 (MQ=255) tGACACACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAGCGCAGAACAAATGCTGAAg < 2:574436/289‑1 (MQ=255) tGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTAt > 1:1198684/1‑139 (MQ=255) tACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAGCGCAGAACAAATGCTGAAGGGCca < 2:2855808/276‑1 (MQ=255) cGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTa > 1:1957150/1‑121 (MQ=255) ||| AGCGTTAATCCTCAACGCAGCCAGCGATACCTTCATGTTAAGCCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTAAGTGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTAGTTTCTTTGACAAACAGAGTACGGGTACGCTGTTGAGTCGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGAGCATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGAGCATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTAGCATTGCGATTCGCGTTGTAAGCAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAGCGCAGAACAAATGCTGAAGGGCCACAAAGAAGTATTGAT > CP042583/829610‑830170 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |