Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 845,815 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 845,815 | 0 | A | T | 99.7% | 790.9 / NA | 330 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (175/154); minor base G (0/1); total (175/155) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 845,816 | 0 | G | C | 99.4% | 781.8 / NA | 330 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base C (174/154); total (175/155) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 845,817 | 0 | C | G | 100.0% | 789.9 / NA | 330 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (175/155); total (175/155) |
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
AATCTGTTCAAGCGTGATACACGCGCATTGAGCAGTGGCTGTGTACGAGTGAATAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGAGCATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCAGCCAAATCGTAAGCAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAAGTGCATATAAACGATAACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTTGCACTCGGTGCCGCCATCCTGCC > CP042583/845536‑846095 ||| gTGATACACGCGCATTGAGCTCAGGCTGTGTACGAGTGAATAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAg < 1:1893213/289‑1 (MQ=255) tGATACACGCGCATTGAGCTCAGGCTGTGTACGAGTGAATAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTACTCAgg > 1:2629757/1‑289 (MQ=255) aTACGCGCGCATTGAGCTCAGGGTGTGTACGAGTGAAGAAAGCTTCCGGTCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGGATTTCGGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGGCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGt < 1:1465798/288‑1 (MQ=255) aTACACGCGCATTGAGCTCAGGCTGTGTACGAGTGAATAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTTCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTa > 2:89983/1‑289 (MQ=255) acacGCGCATTGGGCTCAGGCTGTGTACGAGTGAATAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTaaa < 2:3124066/289‑1 (MQ=255) gagtcgacggcaggCTGTAGACGAGGTAGTAAGACTTCCGACCTGGGGAATATGCGGTTGCAGAATGCAGGCTGGAATAACAACCGTATTTCTGAGTCACTGAAGCAGGGTGATCCACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAag < 2:1346081/276‑1 (MQ=255) agctcaggCTGTGTACGAGTGAATAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCg > 1:1654988/7‑289 (MQ=255) aggCTGTGTACGAGTGAATAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAag < 2:2220596/276‑1 (MQ=255) aaTAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAATGCGGAACAATTAATCAg < 1:2144187/251‑1 (MQ=255) aaTAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCgg < 1:1991854/238‑1 (MQ=255) aaTAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCgg > 2:1991854/1‑238 (MQ=255) aaTAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAAt < 2:1385230/248‑1 (MQ=255) aaTAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGtaata > 1:1530638/1‑289 (MQ=255) aaTAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGtaata > 1:2479452/1‑289 (MQ=255) aaTAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGtaata > 2:924043/1‑289 (MQ=255) aaTAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAACTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGtaata > 2:1134872/1‑289 (MQ=255) tAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTaataat < 2:28189/289‑1 (MQ=255) ttCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGc < 1:89983/287‑1 (MQ=255) ccGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGa > 2:273166/1‑289 (MQ=255) 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tGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGt < 1:282356/288‑1 (MQ=255) cAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGt < 1:81217/245‑1 (MQ=255) gAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTggg > 2:1241634/1‑289 (MQ=255) cAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTTGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATT‑GGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAg > 2:2381824/1‑288 (MQ=255) cAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATT‑GGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAg < 1:2381824/288‑1 (MQ=255) gTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCa > 1:13529/1‑270 (MQ=255) 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agctagggtaTACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCGGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGTGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACg < 2:780807/279‑1 (MQ=255) agaaGGGTGATCAACGTTACGTCAATATGCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACg < 2:1932216/285‑1 (MQ=255) ggTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGt > 1:504874/1‑289 (MQ=255) 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aTACACGTTACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAg > 1:1278094/1‑257 (MQ=255) ttACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCg > 1:111747/1‑216 (MQ=255) tACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCtt < 1:1034104/256‑1 (MQ=255) tACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCtt > 2:1034104/1‑256 (MQ=255) tACGTCAATATTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCctct > 2:1358413/1‑289 (MQ=255) tatTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGTGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGcc > 1:1733864/1‑289 (MQ=255) atTCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCa < 1:764205/289‑1 (MQ=255) ttCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCgggg > 2:584463/1‑168 (MQ=255) ttCGGCAGTCGATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCgggg < 1:584463/168‑1 (MQ=255) cggcagtcgaTTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGaa < 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AATCTGTTCAAGCGTGATACACGCGCATTGAGCAGTGGCTGTGTACGAGTGAATAAAGCTTCCGATCTGGCGAATATGCTGTTGCAGGATGCAGGCTGGAATGACAAACGTATTTCTGATGCGCTGAAGCAGGGTGATACACGTTACGTCAATATTCGGCAGAGCATTCCGGTGAATCTCTACTACCTGACGGCCTTTGTTGGTGCAGATGGTCGTACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCAGCCAAATCGTAAGCAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAAGTGCATATAAACGATAACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTTGCACTCGGTGCCGCCATCCTGCC > CP042583/845536‑846095 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |