Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 876,010 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 876,010 | 0 | A | T | 99.5% | 994.5 / NA | 415 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (203/210); minor base C (2/0); total (205/210) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 876,011 | 0 | G | C | 99.8% | 985.9 / NA | 415 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (203/210); total (205/210) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 876,012 | 0 | C | G | 99.5% | 990.4 / ‑2.3 | 415 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (204/209); minor base T (1/1); total (205/210) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.30e-01 |
Only 100 of 415 total aligned reads displayed.
ACGTCCATCATGCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCAGCAAGATGCCGAGCACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGAGCATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCAGCGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGAGCTGGGATCGTCAACCTGAAAGTGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGGCGCTCAT > CP042583/875731‑876291 ||| ccATCATGCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGt > 2:538964/1‑289 (MQ=255) tGCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGt < 1:865150/289‑1 (MQ=255) cGGCTACTATTTTGTCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCt < 1:1191181/289‑1 (MQ=255) cTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCt > 1:2484927/1‑286 (MQ=255) cTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTct < 1:1005009/288‑2 (MQ=255) aaTATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTctcgg < 1:836288/289‑5 (MQ=255) tatTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATcgcg < 2:2340963/277‑1 (MQ=255) tatTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTctcggcg < 1:2907761/289‑7 (MQ=255) tGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGt < 1:490943/289‑1 (MQ=255) catcatGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGt < 1:1961422/289‑1 (MQ=255) tcatGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTAt > 1:2447240/1‑289 (MQ=255) atGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATgg < 2:2070213/289‑1 (MQ=255) tGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATggg < 1:1140114/289‑1 (MQ=255) cGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGt < 1:1093122/250‑1 (MQ=255) gATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTAACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTGTaa > 2:1851023/1‑289 (MQ=255) ctcgaaGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATgg > 2:938576/5‑269 (MQ=255) ctcgaaGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAAt > 1:332015/5‑279 (MQ=255) cgtcgaCGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATgg < 2:2010923/283‑1 (MQ=255) ggTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTct > 2:781102/1‑220 (MQ=255) gTCATTCTGTTATGGGGCGAAGGCTCTTATCCCGTGGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATGGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTa < 2:1050968/288‑1 (MQ=255) gTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCa > 2:2516731/1‑264 (MQ=255) cATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAgtc < 2:2422882/289‑1 (MQ=255) cTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCa < 1:387747/289‑1 (MQ=255) tGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCAt < 2:3322947/289‑1 (MQ=255) ttATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATgg < 1:263187/259‑1 (MQ=255) tATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATaa < 1:2763406/288‑1 (MQ=255) gAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAATCGTCATAATGACa > 1:633609/1‑289 (MQ=255) gAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGACCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGAc < 2:1294981/288‑1 (MQ=255) aGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCTATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTg > 2:2861599/1‑213 (MQ=255) cGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTa < 2:1912460/229‑1 (MQ=255) cGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATgg < 1:1465582/251‑1 (MQ=255) aGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGtt < 2:596701/288‑1 (MQ=255) gCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTc > 2:1465172/1‑289 (MQ=255) ctctTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGtttt < 2:459410/287‑1 (MQ=255) gTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCAt < 2:85647/263‑1 (MQ=255) gTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGt > 2:1101707/1‑289 (MQ=255) tCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAAt > 2:505363/1‑214 (MQ=255) tCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCtt > 1:1684004/1‑252 (MQ=255) gcttgttttGGCCAGTATTTTGTGGCAAAGGTTAAAGATGATGGCCATCGGTTGGCTGGGTTGGGATGCCAAAGGGCGTGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTTTGAAGTTTTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGATCTCGGTGCTGGTGAGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCGATGGGTTCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGt < 2:1794490/281‑1 (MQ=255) gATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATTATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGt < 1:2148075/289‑1 (MQ=255) tttCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAAt < 2:3282986/200‑1 (MQ=255) tCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTgtcg > 1:543866/1‑286 (MQ=255) ggCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTgtcgtgg < 1:3124345/289‑7 (MQ=255) tattatGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGt > 1:2353604/1‑156 (MQ=255) tGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCaa > 1:2076519/1‑287 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTCTTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATTATGACAATGTTTACTGCTATGACGTTTTACCCGCGTTTGTCTTGGGCTGGTCAACCTGaat > 2:422261/1‑288 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaa > 1:427974/1‑288 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaa > 1:2840210/1‑288 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaa > 2:2139628/1‑288 (MQ=255) aaCGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGt > 1:1612767/1‑277 (MQ=255) cGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCCCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaatcaga > 2:1612873/1‑284 (MQ=255) aaaGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCAt > 2:2751885/1‑289 (MQ=255) aGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 1:2419524/289‑1 (MQ=255) aGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 2:3046634/289‑1 (MQ=255) tgatCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTTAATCAGAGCATgag < 1:2571098/287‑1 (MQ=255) atCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATgg < 1:3141890/154‑1 (MQ=255) atCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTgtcgtgg > 1:2653209/1‑252 (MQ=255) aTCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGAAAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGAc < 1:231512/289‑1 (MQ=255) tCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACa < 1:1635844/289‑1 (MQ=255) cgcgTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCa < 1:989098/172‑1 (MQ=255) cgcgTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAAc > 1:716289/1‑260 (MQ=255) gTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTa < 1:801982/288‑1 (MQ=255) gTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTa < 1:1240489/288‑1 (MQ=255) tGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaatca < 1:1273632/264‑4 (MQ=255) ggCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATg < 1:1828487/288‑1 (MQ=255) tgtTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGt < 2:3128975/246‑1 (MQ=255) tgtTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATgag < 2:1141933/267‑1 (MQ=255) ttGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCtaa > 2:1397937/1‑289 (MQ=255) ttGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCAGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCtaa > 1:2722491/1‑289 (MQ=255) ccAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGTGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATggag > 1:1065632/1‑287 (MQ=255) ccAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 2:2632147/256‑1 (MQ=255) aaaGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATg > 2:2478769/1‑271 (MQ=255) tGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGtt > 1:938869/1‑212 (MQ=255) tGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCaaaa > 1:3000724/1‑288 (MQ=255) ggCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAAt > 1:326727/1‑288 (MQ=255) cgcgACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCt < 1:2784147/247‑1 (MQ=255) cgcgACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCt > 2:2784147/1‑247 (MQ=255) cgcgACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGaaa > 1:1324674/1‑289 (MQ=255) aCAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCa < 2:2440413/131‑1 (MQ=255) aCAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 2:1738846/235‑1 (MQ=255) tGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaatc > 2:1652504/1‑220 (MQ=255) gAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTgaa < 1:2518893/285‑1 (MQ=255) aaaGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATg < 1:2384124/246‑1 (MQ=255) aaaGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATg > 2:2384124/1‑246 (MQ=255) aTGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 2:2172873/224‑1 (MQ=255) aTGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGcc > 1:2045492/1‑262 (MQ=255) aTGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGtct < 2:2570029/289‑1 (MQ=255) tGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGt > 1:514614/1‑55 (MQ=255) tGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 2:2671642/223‑1 (MQ=255) cATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaatcag < 2:1587533/214‑5 (MQ=255) cATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGCGTCCTGTCAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCGAAAATCCAAAAAGTGAAGAACTTGTCTccc > 2:3222678/1‑289 (MQ=255) ttgttgAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATg < 2:1504594/222‑1 (MQ=255) ttgttgAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATg > 1:1504594/1‑222 (MQ=255) tgttgAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGGCGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTa < 1:3019630/288‑1 (MQ=255) tgttgAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTa > 1:1434077/1‑82 (MQ=255) gttgAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGa > 1:1774709/1‑278 (MQ=255) tttGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGCGCGCATGGGTGGTTTAATGAGTCTTTATCCGGCACTGGGTGCATTGATGGTTGTATTAGTAGTCATATTGACATTGTTTTCTGGTATTACGTTTGACGTGCGGTTGTCGTGGGATCGTCTACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCATGACATTATGGAATCTAATAATGGGGACGACACAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGTTATTTCCTATTGTAACg > 2:65114/1‑289 (MQ=255) tGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGt > 2:823657/1‑160 (MQ=255) aGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCgt < 2:1243285/262‑1 (MQ=255) ccGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGGCGCTCAt > 2:1207407/1‑289 (MQ=255) ||| ACGTCCATCATGCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCAGCAAGATGCCGAGCACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGAGCATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCAGCGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGAGCTGGGATCGTCAACCTGAAAGTGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGGCGCTCAT > CP042583/875731‑876291 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |