Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 876,043 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 876,043 | 0 | A | T | 99.7% | 940.7 / NA | 391 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (184/206); minor base C (1/0); total (185/206) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 876,044 | 0 | G | C | 99.7% | 933.1 / NA | 391 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (184/206); minor base T (1/0); total (185/206) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 876,045 | 0 | C | G | 99.5% | 940.8 / ‑2.8 | 391 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (184/205); minor base A (1/1); total (185/206) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.77e-01 |
Only 100 of 391 total aligned reads displayed.
TTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCAGCAAGATGCCGAGCACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGAGCATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCAGCGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGAGCTGGGATCGTCAACCTGAAAGTGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGGCGCTCATTGGGGCCTGGGTTCTTTTTTATCATTACAGCC > CP042583/875763‑876323 ||| tttGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTg < 1:1014855/289‑1 (MQ=255) catcatGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGt < 1:1961422/289‑1 (MQ=255) tGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATggg < 1:1140114/289‑1 (MQ=255) ctcgaaGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATTGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTAt > 1:64325/5‑289 (MQ=255) ctcgaaGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATgg > 2:938576/5‑269 (MQ=255) ctcgaaGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATgg < 1:938576/265‑1 (MQ=255) cATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAgtc < 2:2422882/289‑1 (MQ=255) cTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCa < 1:387747/289‑1 (MQ=255) ttATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATgg < 1:263187/259‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAAt < 1:3253204/237‑1 (MQ=255) gAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATgg > 2:2899895/1‑224 (MQ=255) aGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCTATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTg < 1:2861599/213‑1 (MQ=255) aGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTATTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGTGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACaa > 1:2764764/1‑289 (MQ=255) cGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCTGGCACTGGGTGCATGAATGGTTGCTTTAGTCGTCATAATGAAAATg > 2:1963549/1‑289 (MQ=255) cGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAAt < 1:3001422/288‑1 (MQ=255) cGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGGTTAATGAGTATTTAACCGGCAATGGGGGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATTATGACAATg > 2:1562947/1‑289 (MQ=255) cGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTACGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATg > 1:2330499/1‑289 (MQ=255) aGGCTCTTATCCCTTGGCTTCGGTGATATTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGAGCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGAAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGtt < 2:1692556/288‑1 (MQ=255) tATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATggg > 2:1471586/1‑212 (MQ=255) tCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAAt < 1:505363/214‑1 (MQ=255) tGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGa > 1:467177/1‑288 (MQ=255) tCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTg > 1:2376479/1‑178 (MQ=255) ggCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTgtcgtgg < 1:3124345/289‑7 (MQ=255) ccAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTgtcgtggga > 2:3278148/1‑281 (MQ=255) tattatGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCCTTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCTAGTTTgtcgtgggacat > 2:1202335/1‑277 (MQ=255) tattatGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTgtcgttggatcg > 2:321006/1‑277 (MQ=255) tattatGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCg > 2:802195/1‑288 (MQ=255) attatGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGt < 1:1101707/288‑1 (MQ=255) tGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAAc > 2:1635844/1‑288 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTg < 1:1617400/159‑1 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTCTTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATTATGACAATGTTTACTGCTATGACGTTTTACCCGCGTTTGTCTTGGGCTGGTCAACCTGaat > 2:422261/1‑288 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaa > 2:2093708/1‑288 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaa > 2:238027/1‑288 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaa > 2:3125183/1‑288 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCGGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTAGTGATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCTGCGTTTGTCGTGTGATCGTCAACCTGagt > 2:2801848/1‑287 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGACAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTg > 2:626933/1‑159 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTT‑GGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaatc > 1:531497/1‑287 (MQ=255) aaCGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGt < 2:1612767/277‑1 (MQ=255) aaaGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTg > 1:1463505/1‑236 (MQ=255) aaaGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCAt > 2:2751885/1‑289 (MQ=255) agaggtttgCCATCGGGTGGATGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGGAAGCGGGAAAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGGGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 2:2574064/281‑1 (MQ=255) aGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 1:802195/289‑1 (MQ=255) tgatCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTTAATCAGAGCATgag < 1:2571098/287‑1 (MQ=255) atCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATgg < 1:3141890/154‑1 (MQ=255) atCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAAt > 2:840996/1‑182 (MQ=255) atCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAAt < 1:840996/182‑1 (MQ=255) atCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCAtt < 2:1309355/191‑1 (MQ=255) atCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTgtcgtgg > 1:2653209/1‑252 (MQ=255) atCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATgaggag > 2:2487071/1‑288 (MQ=255) gCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCt < 1:2801848/289‑1 (MQ=255) catggggtggtggtgtTGGGATGCCAAAGGGAATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGa < 2:2330499/277‑1 (MQ=255) tCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACa > 1:2977485/1‑289 (MQ=255) cgcgTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCa < 1:989098/172‑1 (MQ=255) cgcgTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAAc < 2:716289/260‑1 (MQ=255) cgcgTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAAc > 1:716289/1‑260 (MQ=255) tGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaatca > 2:1273632/1‑261 (MQ=255) ggCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATg < 1:1828487/288‑1 (MQ=255) ggCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATg < 1:2093708/288‑1 (MQ=255) gtTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCt < 2:2447240/288‑1 (MQ=255) ttGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCtaa > 2:1397937/1‑289 (MQ=255) ttGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCAGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCtaa > 1:2722491/1‑289 (MQ=255) ccAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGTGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATggag > 1:1065632/1‑287 (MQ=255) ccAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 2:2632147/256‑1 (MQ=255) aaaGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATg < 1:2478769/271‑1 (MQ=255) tGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCaaaa > 2:2158806/1‑288 (MQ=255) cAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTg < 1:1212217/94‑1 (MQ=255) cAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTg > 2:1212217/1‑94 (MQ=255) tGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaatc < 1:1652504/222‑3 (MQ=255) tGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGATTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTgaagaa > 2:1462751/1‑289 (MQ=255) tGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTgaaga > 1:1686006/1‑288 (MQ=255) gAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTgaa < 1:2518893/285‑1 (MQ=255) aaaGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGa < 1:1487714/277‑1 (MQ=255) aTGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGcc < 2:2045492/262‑1 (MQ=255) aTGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGcc > 1:2045492/1‑262 (MQ=255) tGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 2:2671642/223‑1 (MQ=255) cATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaatcag > 1:1587533/1‑210 (MQ=255) cATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCtaata < 2:1086574/248‑1 (MQ=255) ttATGAAGGTGTTGAGTTTGTAGGCCGTGGGTCGTTGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGtct < 2:1774709/278‑1 (MQ=255) aTGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 1:3312908/211‑1 (MQ=255) aTGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga > 2:3312908/1‑211 (MQ=255) aTGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGatat > 1:2395568/1‑289 (MQ=255) tGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATggg > 1:1271116/1‑111 (MQ=255) gttgAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGa > 1:1774709/1‑278 (MQ=255) tttGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAAt > 2:526261/1‑218 (MQ=255) tGTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaat > 2:1899362/1‑184 (MQ=255) gTAGGCCGCTGGTCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGgcg < 1:2440395/289‑1 (MQ=255) cgctggtcgaTGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGGCGCTCAt < 1:2246189/279‑1 (MQ=255) gctggtcgaTGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTCGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATgag < 2:1134034/180‑1 (MQ=255) ctggtcgaTGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGGCGCTCATTgg > 1:1302274/8‑289 (MQ=255) tcgaTGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGGCGCTCATTGGGGc < 2:467177/285‑1 (MQ=255) tGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGtctc < 2:25222/244‑1 (MQ=255) aTTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGgcg > 1:1345919/1‑271 (MQ=255) gACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGa > 2:1812404/1‑183 (MQ=255) tttCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga > 2:3026665/1‑168 (MQ=255) tttCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 1:3026665/168‑1 (MQ=255) tttCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGtctc > 2:581023/1‑234 (MQ=255) tttCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGtctc < 1:581023/234‑1 (MQ=255) ttCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCtta > 2:3226377/1‑175 (MQ=255) tCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATg > 1:1405740/1‑183 (MQ=255) cGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGACTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGGCGCTCATTGGGGCCTGGGTTCTTTTTTATCa < 1:2158806/289‑1 (MQ=255) ||| TTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCAGCAAGATGCCGAGCACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGAGCATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCAGCGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAATGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGAGCTGGGATCGTCAACCTGAAAGTGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGGCGCTCATTGGGGCCTGGGTTCTTTTTTATCATTACAGCC > CP042583/875763‑876323 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |