Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 478,388 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 478,388 | 0 | A | T | 99.7% | 853.9 / NA | 358 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (166/189); total (169/189) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 478,389 | 0 | G | C | 99.2% | 842.0 / NA | 358 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base C (167/187); total (169/189) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 478,390 | 0 | C | G | 99.7% | 855.8 / NA | 358 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (168/189); total (169/189) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.40e-01 |
Only 100 of 358 total aligned reads displayed.
CGCACTGGAGCGGATGCGCTCTGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCAGCGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGAGCGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCAGTCAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCACCGATCCGTACTGGGCGCGTAGCCGGGTGCTGGAGTACCTCAACCAGGTACAGGGTAAGCTGCCTGCGGGAGTCAGCGCCGAGCTGGGGCCAGATGCCACGGGTGTTGGCTGGATCTATGAATATGCACTGGTGGATCGCAGCGGTAAGCACGATCTGGCCGATTTACGCAGTTTACAGGACTGGTTTCTCAAATATG > CP042583/478109‑478664 ||| cTGGAGCGGATGCGCTCTGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGgcgc > 1:681804/1‑289 (MQ=255) cggtgtcgcTCTGAAAGTGGTACCCATGCGCATTGAGGGAATACCTAATGATTGAATGGAGTATTCGTGGCTGGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCGGAGGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGa < 2:762925/282‑1 (MQ=255) gATGCGCTCTGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCACCGATGTGCAGGTTCTTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGCCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATCTTG‑TCGTGGCCTGGCGCGAAg > 1:1833093/1‑285 (MQ=255) aTGCGCTCTGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACtgt > 2:2249865/1‑289 (MQ=255) gcgcTCTGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCt > 2:3008632/1‑273 (MQ=255) aaaGTGCTACCCATGCGCATTGAGTGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCt < 1:2784074/265‑1 (MQ=255) aaaGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCt > 2:2784074/1‑265 (MQ=255) cTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGcgcg > 1:487127/1‑278 (MQ=255) cTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTtctca > 2:1681129/1‑283 (MQ=255) tGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCg < 1:2130719/289‑1 (MQ=255) gcgcATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCt < 2:968672/251‑1 (MQ=255) gcgcATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGACGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCg > 1:432841/1‑288 (MQ=255) gcgcATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCg > 2:1101171/1‑288 (MQ=255) cgcATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGa < 1:2470362/288‑1 (MQ=255) cgaaTTGAGGGAATAACCAATGATTGGAGTGATTATTCTTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTGTGGGGGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGCGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGa < 2:81942/285‑1 (MQ=255) ttGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCt < 1:2704975/246‑1 (MQ=255) ttGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCtt < 2:2439181/289‑1 (MQ=255) ttGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCtt > 1:3131416/1‑289 (MQ=255) tGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTTTCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTa > 2:363422/1‑289 (MQ=255) aTAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGTTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGCGCGCGGTTTCTCATCGTTTGGAGACTCTTAtgtga > 2:2705465/1‑286 (MQ=255) aTGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTtctca > 2:2024144/1‑255 (MQ=255) tGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTgg < 1:2077046/265‑1 (MQ=255) gATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTc < 1:1101171/289‑1 (MQ=255) gAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCg < 1:1969759/262‑1 (MQ=255) aTGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGAt < 1:579844/289‑1 (MQ=255) ttattCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCa < 1:1692059/288‑1 (MQ=255) cgtcgctcggTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCACCGATc < 1:3214495/280‑1 (MQ=255) gctcggTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACtgtg > 1:2996180/6‑224 (MQ=255) 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cgcgTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTAt < 1:2572919/220‑1 (MQ=255) gcgTTGTTTCTGGGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCACCGATCCGTACTGGGCGCGTTCGCGGGTGCTGGAGTACCTCAAc < 2:3322838/288‑1 (MQ=255) gcgTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCACCGATCCGTACTGGGCGCGTTCGCGGGTGCTGGAGTACCTCAAc < 2:1331033/288‑1 (MQ=255) cgTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGa < 1:1320540/211‑1 (MQ=255) tgttTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCACCGATCCGTACTGGGCGCGTTCGCGGGTGCTGGAGTACCTCAACCAGGt < 2:1470695/289‑1 (MQ=255) gttTCTGAGCATCTGGGGCACCTAGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTGTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAA‑CCAGCTATCCCGTTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCACCGATCCGTACTGGGCGCGTTCGCGGGTGCTGGAGTACCTCAACCAGGTa < 1:2119934/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |