Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 914,318 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 914,318 | 0 | A | T | 99.7% | 818.2 / NA | 342 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (167/174); total (168/174) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 914,319 | 0 | G | C | 99.7% | 816.8 / NA | 342 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (167/174); minor base T (1/0); total (168/174) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 914,320 | 0 | C | G | 99.7% | 810.6 / NA | 342 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (167/174); total (168/174) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 342 total aligned reads displayed.
TGGATAAATATCCGAGCAAAATGATTGCCGGATTGCCGGATCACGTACACAACGCGGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAAAGCACGGGGATGTTCCATAACGCTAGCG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTAGCATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAGCGAACTGGTGGTGCCCGGATCACGATGTTTATGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATT > CP042583/914046‑914599 ||| aaaTATCCGTCGAAAATGATTGCCGGATTGCCGGATCACGTACACAACGCGGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTa < 1:2340589/289‑1 (MQ=255) aaaTATCCGTCGAAAATGATTGCCGGATTGCCGGAACACGTACACAACGCGGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATACCCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTa < 1:2240662/289‑1 (MQ=255) tccgtcgaaaaTGATTGCCGGATTGCCGGATCACGTACACAACGCGGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGTGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGCGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGcc < 1:2121854/282‑1 (MQ=255) tccgtcgaaaaTGATTGCCGGATTGCCGGATCACGTACACAACGCGGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTg > 1:679646/8‑287 (MQ=255) tccgtcgaaaaTGATTGCCGGATTGCCGGATCACGTACACAACGCGGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGcc < 1:3186319/282‑1 (MQ=255) tcgaaaaTGATTGCCGGATTGCCGGATCACGTACACAACGCGGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTg < 2:404404/285‑1 (MQ=255) tcgaaaaTGATTGCCGGATTGCCGGATCACGTACACAACGCGGCGCGTATTCGTTATACGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGGGGTTGGCAATCGACGGGGCGCTTCCATAACGC‑ATCGAGGATGCTGGCGAAACGTATTgagtttg > 2:1709473/4‑283 (MQ=255) cgaaaaGGATTGCCGGATTGCCGGATCACGTACACAACGCGGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCa < 1:786396/287‑1 (MQ=255) ttgcgggacCAAGTACACATCGCGGCGCTAATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACTGCCCAGCGCGGTGATAACAGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGGAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGt < 2:2311512/288‑1 (MQ=255) ttgacggagCACGTAAACAACGCGGCGCGTATTCGTTATCGGATGGTACGCGGGGACTGGCTGCGTAAGCGCCAGCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGGTAACCGGTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGt < 2:1741893/288‑1 (MQ=255) tCACGTACACAACGCGGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGga < 2:1442447/289‑1 (MQ=255) acccaACGCGTCGCGTATTCGGTATCCGGTGGTACTCGTGGACTTGCTGCGTAGGCGCCATCTCAGCGATACCGCCCATCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGGTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTa < 2:2696492/285‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCAt < 2:303890/255‑1 (MQ=255) aCGCGGCGCGTATTGGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCGGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCGGGGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCGGGGATGAAGCCCGCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGGGTGCCGTGCTGACCGCCAGTGGGTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTAc < 2:2584610/289‑1 (MQ=255) cgcgGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCt > 1:3081154/1‑248 (MQ=255) cgcgGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTg < 1:2483304/250‑1 (MQ=255) cgcgGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGGGGCGATTCCTCTAcc > 2:106569/1‑289 (MQ=255) cgcgGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTAcc > 1:1926312/1‑289 (MQ=255) cgcgGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTAcc > 1:2392283/1‑289 (MQ=255) cggcgCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGCAAGCTATTGCCTGGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCCGAGATTaactctctgg > 2:3159296/1‑280 (MQ=255) cggcgCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTg > 1:2624880/1‑243 (MQ=255) gcggcagatccGTAATCCGATGGTACGCGGGGACTGTCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGGGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCgg < 2:2174125/278‑1 (MQ=255) gcgcGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGGTGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGt > 1:1010284/1‑288 (MQ=255) ggcgTATTCGTTGACGGAGGGGACGCGTGGACTGGCGGCGTAAGGGCCATCTCAGCGTTACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGGGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGtg < 2:2640954/287‑1 (MQ=255) cgcgTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGGGTTTTCTCTACCGGttg > 2:795873/1‑287 (MQ=255) cGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAgg < 1:3035222/289‑1 (MQ=255) aTCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTAc > 2:675606/1‑266 (MQ=255) aTGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTAc < 2:2397076/261‑1 (MQ=255) aTGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGtg < 1:1479392/271‑1 (MQ=255) aTGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGtg > 2:1479392/1‑271 (MQ=255) tGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGc < 1:2699477/288‑1 (MQ=255) ggACTGGCTGCGTAAGGGCCATCTCAGCGATACGTCCCAGAGCGGTGGTAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTAACGGGCCGGGGGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGt < 2:2331946/288‑1 (MQ=255) cTGGCTGCGTAGGGGCAAGCTCAGCGAGACATCCCAGGGCGGTGTTAACCGTTTTGTGCGCGGGAGCTGGGATGAAGCCCTCTACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCgg < 2:3215270/288‑1 (MQ=255) ttcGTAAGGGCCAACCCAGCAATACCTCCAAGCGCGGTGATAACCGTTTTGGGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACTGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCAATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAACGCTATTGCCTGGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGttcga < 2:1550138/286‑5 (MQ=255) gTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGttcgatgga < 1:1119569/289‑9 (MQ=255) gTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGttcgatgga < 1:106569/289‑9 (MQ=255) cgcCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTg > 2:309847/1‑201 (MQ=255) cgcCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGAt < 2:1376327/231‑1 (MQ=255) ccATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTAt > 1:1410160/1‑289 (MQ=255) ccATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGAAACGCGTCCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGGGGGTGGCAATCGACGGAGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGACTTGCATGGGAATAGCGTTGGTACTGGCGGAGATTACTCTACAGGTGCTGAGCAGGTGATCATGCCGCGCGTAGTGGGTTGGATGGAAGAGTAt > 2:169050/1‑289 (MQ=255) aTCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGCGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGAGGTTCCATAACGCCTCGG‑GCATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCACTGAAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCCGTTCTGTGCAGGTGATCCTGCCGTGCGTGGGCGGTTCGATCGAAGTGTATGa > 2:2871766/1‑289 (MQ=255) ctcAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGt > 2:1278905/1‑213 (MQ=255) ctcAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAAc < 1:1572248/289‑1 (MQ=255) aCCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGttcgatgga > 2:1134405/1‑261 (MQ=255) cccAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGTTGCTGCTCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTGCGATGTAAGTGTCTGAACAGCCAACCCCCTg > 2:1588195/1‑289 (MQ=255) cccAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGTAGGAAGTGTATGAACAGCAAAcatccgg > 2:2528516/1‑287 (MQ=255) gcgGTGATAACCGTTGTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGc < 2:2271226/288‑1 (MQ=255) tttGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGcc < 2:1820850/159‑1 (MQ=255) tttGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACgg < 1:174785/184‑1 (MQ=255) tttGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGtgctgc > 1:1980477/1‑209 (MQ=255) tttGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGtgctgc < 2:1980477/209‑1 (MQ=255) tttGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGGATTGCAGAACa > 1:2446467/1‑289 (MQ=255) gcgTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGTCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGGGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTACTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCaaaa > 1:1282750/1‑288 (MQ=255) gcgTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCATGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCaaaa > 1:1373211/1‑288 (MQ=255) gTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCa < 1:913228/289‑1 (MQ=255) tGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCa < 1:3108365/288‑1 (MQ=255) cTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATg < 1:423332/239‑1 (MQ=255) ggATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCAt > 1:1196667/1‑282 (MQ=255) aaGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGaa > 2:1893014/1‑127 (MQ=255) aaGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGaa < 1:1893014/127‑1 (MQ=255) cTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGttcgatgga < 1:553371/218‑9 (MQ=255) cGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTGTTGCAGAACAGCAAAAACAGTGTGCTGTGGGGCTCCGAt > 1:84010/1‑289 (MQ=255) cATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCa < 2:3316951/132‑1 (MQ=255) cATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCa > 1:3316951/1‑132 (MQ=255) aTGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGAttt > 1:2175423/1‑287 (MQ=255) gTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTg > 1:1697526/1‑289 (MQ=255) tGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCa < 2:1215526/123‑1 (MQ=255) tGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGa < 2:499450/245‑1 (MQ=255) agaaCTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGttcgatgga > 1:273125/1‑193 (MQ=255) aaCTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTa < 2:2236749/108‑1 (MQ=255) aaCTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCa < 1:2307449/118‑1 (MQ=255) aaCTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGa < 1:1252066/240‑1 (MQ=255) cTGGAAGGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGATTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTGGGCAATCGACGTGGATGTTCCATAAGGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAATCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAg < 1:2279151/289‑1 (MQ=255) tGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTAc > 1:3168551/1‑151 (MQ=255) tGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTg < 2:2472387/173‑1 (MQ=255) acgagggagaaaaaCTCCCGGGCCGAGTGCCTTGCTGACGGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAGCGAAc < 2:2103195/279‑1 (MQ=255) aCGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAACAACCAGCAAGCGa > 1:1718877/1‑287 (MQ=255) aCGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAGCGAAc < 1:642233/289‑1 (MQ=255) cgTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCa < 1:2978793/108‑1 (MQ=255) cgTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCa > 2:2978793/1‑108 (MQ=255) cgTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCAt > 1:15100/1‑109 (MQ=255) cgTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCAt < 2:15100/109‑1 (MQ=255) cgTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGt < 2:92748/177‑1 (MQ=255) cgTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGc < 1:2013847/218‑1 (MQ=255) tGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAGCGAACtggtg > 1:2209851/1‑289 (MQ=255) gCAGAAACCTCCCGGGCCGAGTGGCTTGCGGACGGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAGCGAACtggtg < 2:630316/288‑1 (MQ=255) ataCTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTGGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAGCGAACTGGTGGTGcc < 1:2871766/286‑1 (MQ=255) cTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAGCGAACTGGTGGTGCCCGGa > 1:2521346/1‑289 (MQ=255) aCGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACggg < 1:986827/115‑1 (MQ=255) aGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCaa < 2:2297822/183‑1 (MQ=255) tGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAGCGAACTGGTGGTGCCCGGATCACGATGTTTa < 2:2763407/288‑1 (MQ=255) aCCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATtg < 1:693161/211‑1 (MQ=255) aCCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATtg > 2:693161/1‑211 (MQ=255) aCCGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAGCGAACTTGTGGTGCCCGGATCACGATGTTTATGAATATTAc > 1:1686645/1‑288 (MQ=255) cGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATg < 2:2916998/161‑1 (MQ=255) cGCCAGTGGTTGGCAATCGACGGGGATGTTCCATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATg > 1:2916998/1‑161 (MQ=255) ccATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAg > 1:727809/1‑215 (MQ=255) ccATAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAg < 2:727809/215‑1 (MQ=255) tAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGGGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCATAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACAAGCAAGCGAACTGGTGGTGCCCGGAGCACGCTGTCTATGAATATTACCGCCAGCTAAAAGCGAAAGGcggcgcgcgggaa > 2:103818/1‑279 (MQ=255) tAACGCTTCGG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTTCGATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAg < 1:2545928/212‑1 (MQ=255) ||| TGGATAAATATCCGAGCAAAATGATTGCCGGATTGCCGGATCACGTACACAACGCGGCGCGTATTCGTTATCCGATGGTACGCGTGGACTGGCTGCGTAAGCGCCATCTCAGCGATACCTCCCAGCGCGGTGATAACCGTTTTGTGCGCGTGAGCTGGGATGAAGCCCTCGACATGTTCTATGAAGAACTGGAACGCGTGCAGAAAACTCACGGGCCGAGTGCCTTGCTGACCGCCAGTGGTTGGCAAAGCACGGGGATGTTCCATAACGCTAGCG‑GGATGCTGGCGAAAGCTATTGCCTTGCATGGTAATAGCGTTGGTACGGGCGGAGATTACTCTACCGGTGCTGCGCAGGTGATCCTGCCGCGCGTAGTCGGTAGCATGGAAGTGTATGAACAGCAAACCTCCTGGCCGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAACCATTGTGCTGTGGGGCTCCGATTTGCTGAAAAACCAGCAAGCGAACTGGTGGTGCCCGGATCACGATGTTTATGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATT > CP042583/914046‑914599 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |