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RA | CP042583 | 482,050 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 482,052 | 0 | C | G | 99.8% | 993.1 / NA | 424 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base G (212/211); total (212/212) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 424 total aligned reads displayed.
GCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTTTATTATCATCAACGCCGTTAACCTGGTGAACGTGCGCTTATATGGCGAAACCGAGTTCTGGTTTGCGTTGATTAAAGTGCTGGCAATCATCGGTATGATCGGCTTTGGCCTGTGGCTGCTGTTTTCTGGTCACGGCGGCGAGAAAGCCAGTATCGACAACCTCTGGCGCTACGGTGGTTTCTTCGCCACCGGCTGGAATGGGCTGATTTTGAGCCTGGCGGTAATTATGTTCTCCTTCGGCGGTCTGGAGCTGATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTACATCGGTAGTCTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAATCTCGACAGCAACGTGGTAGCTTCTGCGCTGAACTTCGTCATTCTGGTAGCAAGCCTGAG > CP042583/481771‑482327 ||| gCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTTTATTATCATCAACGCCGTTAACCTGGTGAACGTGCGCTTATATGGCGAAACCGAGTTCTGGTTTGCGTTGATTAAAGTGCTGGCAATCATCGGTATGATCGGCTTTGGCCTGTGGCTGCTGTTTTCTGGTCACGGCGGCGAGAAAGCCAGTATCGACAACCTCTGGCGCTACGGTGGTTTCTTCGCCACCGGCTGGAATGGGCTGATTTTGTCGCTGGCgg < 1:1580364/289‑1 (MQ=255) cGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTTTATTATCATCAACGCCGTTAACCTGGTGAACGTGCGCTTATATGGCGAAACCGAGTTCTGGTTTGCGTTGATTAAAGTGCTGGCAATCATCGGTATGATCGGCTTTGGCCTGTGGCTGCTGTTTTCTGGTCACGGCGGCGAGAAAGCCAGTATCGACAACCTCTGGCGCTACGGTGGTTTCTTCGCCACCGGCTGGAATGGGCTGATTTTGTCGCTGGCGGTAAt > 1:2229537/1‑289 (MQ=255) aTCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTTTATTATCATCAACGCCGTTAACCTGGTGAACGTGCGCTTATATGGCGAAACCGAGTTCTGGTTTGCGTTGATTAAAGTGCTGGCAATCATCGGTATGATCGGCTTTGGCCTGTGGCTGCTGTTTTCTGGTCACGGCGGCGAGAAAGCCAGTATCGACAACCTCTGGCGCTACGGTGGTTTCTTCGCCACCGGCTGGAATGGGCTGATTTTGTCGCTGGCGGTAATTATGt > 2:2582498/1‑289 (MQ=255) tataTGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTTTATTATCATCAACGCCGTTAACCTGGTGAACGTGCGCTTATATGGCGAAACCGAGTTCTGGTTTGCGTTGATTAAAGTGCTGGCAATCATCGGTATGATCGGCTTTGGCCTGTGGCTGCTGTTTTCTGGTCACGGCGGCGAGAAAGCCAGTATCGACAACCTCTGGCGCTACGGTGGTTTCTTCGCCACCGGCTGGATTGGTCTGATTGTGTCGCTGGCGGTAATTATGTtc > 1:1524221/1‑288 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |