| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,466,035 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,466,035 | 0 | A | T | 100.0% | 629.2 / NA | 262 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (124/138); total (124/138) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,466,036 | 0 | G | C | 100.0% | 623.3 / NA | 262 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (124/138); total (124/138) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,466,037 | 0 | C | G | 99.6% | 624.4 / NA | 262 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (123/138); total (124/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
TTGTTAGATATTTTCACTCCTGATGCGTGTCTCGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTAGTGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTAGCCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGAGCCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCAGCCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAG > CP042583/1465759‑1466315 ||| ttgttAGATATTTTCACTCCTGATGCGTGTCTCGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATg > 2:376877/1‑288 (MQ=255) acatatGTTCTCTCCTGATGCGTGTCTCGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACAcc < 1:791605/287‑1 (MQ=255) tttCACTCCTGATGCGTGTCTCGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGt > 1:3180910/1‑289 (MQ=255) tCACTCCTGATGCGTGTCTCGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGtt > 1:105494/1‑288 (MQ=255) gttGCGGGTCTGGCGCTGCTTGAGCAGCAGGGTTGGACCGGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCg < 2:1695111/287‑1 (MQ=255) gATGCGTGTCTCGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCg < 2:2506622/289‑1 (MQ=255) aTGCGTGTCTCGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACAcc < 1:852702/272‑1 (MQ=255) aTGCGTGTCTCGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACAcc > 2:852702/1‑272 (MQ=255) ggtataagggacaggctTGCGCGGCACGGTTAGACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGGTTGTCTATGATCTTTTGAATTTAATAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCACCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAg < 2:1259268/275‑1 (MQ=255) gCGTGTCTCGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAg < 1:2215472/289‑1 (MQ=255) gCGTGTCGTGGGCTGCTTGAACAGCAGCGTTGCACCTGTAGGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTGCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCg < 2:2185997/286‑1 (MQ=255) tgtCTCGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGgtg > 1:2410767/1‑289 (MQ=255) tgtCTCGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGgtg > 2:108084/1‑289 (MQ=255) gtCTCGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGgtgt < 1:665927/289‑1 (MQ=255) ctcGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTag < 2:1399636/289‑1 (MQ=255) cgcTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGTTTACGCTGCCGCAGGCTTagaggt > 2:2340475/1‑287 (MQ=255) cgcTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGAt > 1:2996458/1‑289 (MQ=255) ctTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTa < 2:2756512/247‑1 (MQ=255) ctTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAAGTCTTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATTGTTAAGCTGCCGCAGgtggtggtgttaaag > 2:383308/1‑277 (MQ=255) cagcGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGGGGTCGATg > 2:1132389/1‑289 (MQ=255) agcGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCCGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGAt > 1:1259268/1‑274 (MQ=255) agcGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGATATTTAAGTGGTCGATGa > 1:973393/1‑289 (MQ=255) ttGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGCGATTAAAg > 1:2122251/1‑275 (MQ=255) gTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCg > 2:2359623/1‑249 (MQ=255) ttctctgctccccGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCtt > 1:2771331/13‑289 (MQ=255) ggCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTTGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACg < 2:3324291/235‑1 (MQ=255) ggCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGgtgt > 1:2396523/1‑248 (MQ=255) gcAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATAAAATAATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTCCGCCGCATGCGGTGGTGAACCCCGATGATCCTTTTTCGCGCTTTATGCCCACCGATGGTTAGCCTGCCGCGGGGTTAGAGATTAAGGTGGTCGAGGACGCCCGCAAAAccctgtccttta > 2:917045/1‑279 (MQ=255) aaCGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGt > 1:115283/1‑289 (MQ=255) cGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGtt > 1:1869292/1‑288 (MQ=255) cGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTGTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTg < 1:1900075/289‑1 (MQ=255) cGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAAC‑ACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGaa < 1:297658/289‑1 (MQ=255) tttGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGca > 2:1639556/1‑209 (MQ=255) tttGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGc < 2:1538862/230‑1 (MQ=255) tATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCg > 1:1130777/1‑223 (MQ=255) gaaaccTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTgaag < 1:81825/283‑1 (MQ=255) tGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCt > 1:1519479/1‑263 (MQ=255) tGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTgaagaa > 1:3072449/1‑289 (MQ=255) tttGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGc < 1:1349932/263‑1 (MQ=255) tGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAagcctcgcg < 2:2996458/289‑6 (MQ=255) tGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAagcctcgcg < 1:351752/289‑6 (MQ=255) aaTGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAagcctcgcgtg < 1:513847/289‑8 (MQ=255) aCTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAAGCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCCAGAACTTACCGCCAGGTTGCGAAGGGGaaggaggctcgcgtctgtct > 2:81825/1‑275 (MQ=255) tacaggaAACAAACCCCCGACCTTTCACCTCTTCGTTTATTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCTAAAAAGTGGCGCGTTAAGGCCAAGAGCGCGGCATTAAATTCTTAATTGTTTATGGTTCCCCAGAAAGTTCACCGCATGCGGGGGTGAATCTCGATTATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCa < 2:973393/284‑1 (MQ=255) tAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCaa > 1:2295558/1‑289 (MQ=255) aaacaaacCGCGGACCTTTCAGGGCATCGTTACTTTCTTTGCAGCGGAACCACATTCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGGAGTGATGCATTAAATTAGTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAATTCGCCGCATGCGGTGGTGAGTCTCGATGATACTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATAGTTAAGCTTCCGCAGGAGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGGAAGAACTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGACGACTCGTGTGGCCCCAAtgtg < 2:2103785/288‑1 (MQ=255) acaacCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCGGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGttt < 1:154990/289‑1 (MQ=255) acaacCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGttt > 2:649810/1‑289 (MQ=255) acCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAt < 1:1432428/280‑1 (MQ=255) cgGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCg < 2:868240/246‑1 (MQ=255) cGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAAt > 2:2595307/1‑289 (MQ=255) cGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAAt > 1:2951510/1‑289 (MQ=255) cGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAAt > 2:1940671/1‑289 (MQ=255) tctttattTGCAGCGGAACCACAATACCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTGTTGGTTCCACAGGAAGTTCGTCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGAGCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGGGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTATCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAAc < 2:2410767/289‑1 (MQ=255) tttGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGc < 2:2029164/163‑1 (MQ=255) tttGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGc > 1:2029164/1‑163 (MQ=255) ggcggAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGcc < 1:2595307/288‑1 (MQ=255) ggcggAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGAGCGTGCATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTACCCGCCCGTGcc < 1:1308712/288‑1 (MQ=255) cgccgaaaccaattCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGTGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGcc < 2:2875123/275‑1 (MQ=255) caATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGc > 2:507106/1‑227 (MQ=255) caATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGc < 1:507106/227‑1 (MQ=255) ccccAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTGTATGGTTCCACAGAAAGTTCTACGAATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACATTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGc < 2:1826535/289‑1 (MQ=255) caccAAAAAATTGGCGCGTGAATGCCAGCACGGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGGTCCACAGAAAGGTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGc < 2:1905871/287‑1 (MQ=255) cccAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATggg < 2:3286147/239‑1 (MQ=255) cccAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATggg > 1:3286147/1‑239 (MQ=255) ggCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAgc > 2:1010237/1‑289 (MQ=255) cgcgTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAACGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAgcg < 2:2964033/288‑1 (MQ=255) cgTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGccc < 1:2641331/209‑1 (MQ=255) cgTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGccc > 2:2641331/1‑209 (MQ=255) cgTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATg < 1:634268/222‑1 (MQ=255) gAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTTTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGAt < 2:2295558/288‑1 (MQ=255) gAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGAt < 1:1797453/288‑1 (MQ=255) gAATGCCAGCAGAGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGAt < 1:383308/288‑1 (MQ=255) cagcagCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGcc < 1:770791/289‑1 (MQ=255) cagcagCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGcc < 1:926221/289‑1 (MQ=255) agcGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGt < 1:2819339/287‑1 (MQ=255) agcGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGt < 1:1698065/287‑1 (MQ=255) cgcgGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACATAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCTAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTATATGGGGTATTTTTATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGa > 1:2004365/1‑248 (MQ=255) cgcgGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTtgatg > 2:13191/1‑220 (MQ=255) cgcgGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGccc > 1:567521/1‑238 (MQ=255) cgcgGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGccc < 2:567521/238‑1 (MQ=255) gcgGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGcc < 2:2931038/242‑1 (MQ=255) cgGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGAt > 1:270510/1‑289 (MQ=255) ttaAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTtga < 2:749631/203‑1 (MQ=255) tgtTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAAc < 2:1752575/213‑1 (MQ=255) tgtTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAAc > 1:1752575/1‑213 (MQ=255) tgtTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCg > 2:1453919/1‑219 (MQ=255) tttATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGt < 2:2682543/263‑1 (MQ=255) tATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGcc < 1:2558604/213‑1 (MQ=255) tATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGc > 1:894453/1‑234 (MQ=255) tATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGc < 2:894453/234‑1 (MQ=255) tCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAt < 1:2441390/168‑1 (MQ=255) tCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATggg > 1:336825/1‑179 (MQ=255) aagttcgccGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCaaaaa < 1:1940671/281‑1 (MQ=255) agttcgccGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGAAGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGAtct > 2:3175243/7‑239 (MQ=255) cgccGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGatat > 2:1841566/3‑289 (MQ=255) ccGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAgcg > 2:305135/1‑226 (MQ=255) cGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTa < 1:68669/201‑1 (MQ=255) atgatCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTGTGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACAGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAatat > 1:2889671/1‑289 (MQ=255) atgatCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCTGCGGCGGCGaaataat > 2:2790719/1‑285 (MQ=255) ||| TTGTTAGATATTTTCACTCCTGATGCGTGTCTCGCGCTGCTTGAGCAGCAGCGTTGCACCTGTATGCTCGGCGCAACGCCGTTTGTCTATGATCTTTTGAATGTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTAGTGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTAGCCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGAGCCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCAGCCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAG > CP042583/1465759‑1466315 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |