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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,470,913 | 0 | C | G | 100.0% | 813.9 / NA | 340 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Only 100 of 340 total aligned reads displayed.
AGTCGGCTGGAAATCGTAATGCGCACCT‑ATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTAGCGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCAGCCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCGATGATATCGCCGCAGCCTGCGATACGCTGCACGAGTTTGATTTACCTGAACATCTGGTGGTGGATTTCAGCCA > CP042583/1470635‑1471185 ||| tcacGGCTGGAAATCGTAATGCGCACCT‑ATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCt > 1:1026402/4‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |