Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,497,792 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,497,792 | 0 | A | T | 99.2% | 884.5 / NA | 376 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base T (181/189); minor base G (2/1); total (183/193) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.17e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,497,793 | 0 | G | C | 99.7% | 890.0 / NA | 376 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (183/192); total (183/193) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,497,794 | 0 | C | G | 99.5% | 894.2 / NA | 376 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); new base G (183/191); total (183/193) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 376 total aligned reads displayed.
GACTGACGACCAGCTGAATATCACCCCACCTCCGGACGTCAACGGTCTGAAAAAGGATCCATCCTTAAGTTTGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGAAGCGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTAGCCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGATGGAAGCCTACAAACACCTTAAACCGATTGCGCTGGCGGGTGACGCGCGCAAGTTTAAAGCAACAATCAAGATCGCTGACCAGGGTGAAGAAGGGATTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGAGTCGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCC > CP042583/1497515‑1498072 ||| ccACCTCCGGACGTCAACGGTCTGAAAAAGGATCCATCCTTAAGTTTGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCa < 1:2225647/289‑1 (MQ=255) cACCTCCGGACGTCAACGGTCTGAAAAAGGATCCATCCTTAAGTTTGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCaa > 1:1286230/1‑289 (MQ=255) ccTCCGGACGTCAACGGTCTGAAAAAGGATCCATCCTTAAGTTTGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAata > 2:636320/1‑289 (MQ=255) cccGGACGTAAACGGTCTGAAAAAGGATCCATCCTTAATTGTGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATc < 2:1322401/288‑1 (MQ=255) cAACGGTCTGAAAAAGGATCCATCCTTAAGTTTGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCTCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATc > 1:2003394/1‑289 (MQ=255) aaaaGGATCCATCCTTAAGTTTGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACg < 2:2170884/288‑1 (MQ=255) gATCCATCCTTAAGTTTGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCAt > 2:1979734/1‑245 (MQ=255) tccatccTTAAGTTTGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGc < 1:258462/288‑1 (MQ=255) atccTTAAGTTTGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAac < 1:2164924/289‑1 (MQ=255) tAAGTTTGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCAtt < 1:302543/236‑1 (MQ=255) aGTTTGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCTCGTGGTAGCTATTTTACTTAATAATGAAGTGAGATCGGCAAACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGGAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGAGTGAAGTGACTGCGGATGACTGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGGTGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTAcc < 1:972637/289‑1 (MQ=255) aGTTTGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTAcc < 1:3109814/289‑1 (MQ=255) tGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGTCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAAGGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTACAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGTTCCTTGTCCATTGCGGCAATATCTCGGAATACGTTGACAACGGCCA‑TGCCAactcacccctggt > 2:1760967/1‑279 (MQ=255) tGTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTGGCGGCAATATAGCGGATATCGCGGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGAt > 1:875577/1‑289 (MQ=255) gTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGATg > 1:3036542/1‑289 (MQ=255) gTACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACCACCTGagg > 2:1184985/1‑287 (MQ=255) tACGCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGATgg > 1:1726401/1‑289 (MQ=255) gCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGATGGAAg < 1:2038533/289‑1 (MQ=255) gCCATTCCTGACGGTGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGATGGAAg < 1:1489261/289‑1 (MQ=255) tGATGTGAACGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGTCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGACTGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTGGCCTAGAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGAGGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGTGTCACGCTGACCA‑GTCAAGTGCCAATTCCTACCTGATGGCAGACTACATACACCtt > 2:2230624/1‑289 (MQ=255) tGATGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGATGGAAGcc > 1:3209207/1‑277 (MQ=255) aTGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGcc < 2:2635086/254‑1 (MQ=255) aTGTGAAAGGTCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGcc > 1:2635086/1‑254 (MQ=255) tCGCGTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCg > 1:479138/1‑188 (MQ=255) cgcgTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGATGGAAGCCTACAAACACCTTAAACCGATTgcg < 1:1970637/288‑1 (MQ=255) gcgTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCg > 2:1059165/1‑237 (MQ=255) cgTGGTAGCGATTTTACTTAATGATGAAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGACGGACGCCTACAAACACCTTAAACCGAtcgtgatg > 2:1851377/1‑282 (MQ=255) tgatgaAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGATGGAAGCCTACAAACACCTTAAACCGATTGCGCTGGCGGGTGACGCGCGCAAGttt > 2:795196/1‑289 (MQ=255) gaAGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGATGGAAGCCTACAAACACCTTAAACCGATTGCGCTGGCGGGTGACGCGCGCAAGTTTAAAg < 2:260758/289‑1 (MQ=255) aGTGAGATCGGCAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGATGGAAGCCTACAAACACCTTAAACCGATTGCGCTGGCGGGTGACGCGCGCAAGTTTAAAGca < 2:275244/289‑1 (MQ=255) atcggcAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAactact > 2:1666734/5‑215 (MQ=255) atcggcAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGATGGAAGCCTACAAACACCTTAAACCGATTGCGCTGGCGGGTGACgcgcgc < 1:2765313/267‑1 (MQ=255) atcggcAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGATGGAAGCCTACAAACACCTTAAACCGATTGCGCTGGCGGGTGACGCGCGCAAGTTTAAAGcaa > 1:1854737/5‑284 (MQ=255) atcggcAGACCTTCTGGCCATTCTCAAGGCGCTGAAGGCCAAAGGCGTTCATGCCAAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAGCCGCTACCTTTGCCGGTGCAC‑CTTCGCTGACGGTCGATGCGGTCATTGTCCCTTGCGGCAATATCGCGGATATCGCTGACAACGGCGA‑TGCCAACTACTACCTGATGGAAGCCTACAAACACCTTAAACCGATTGCGCTGGCGGGTGACGCGCGCAAGTTTAAAGCAACAATc > 1:1657410/5‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |