| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 1,515,097 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 1,515,098 | 0 | G | C | 99.7% | 884.4 / NA | 371 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (194/174); total (195/176) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,515,099 | 0 | T | A | 99.5% | 877.2 / NA | 371 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base A (193/175); total (195/176) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 371 total aligned reads displayed.
CAAAAGCGCAGTTTTATCAGAATCTGCAAAACTACCTGGAAACCGAACTCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCAGTTGGTTTGATTACCGCAGTAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTCCTTTGTTATACCGTCTCTGCGTTTTTAGTTGT > CP042583/1514819‑1515377 ||| cAAAAGCGCAGTTTTATCAGAATCTGCAAAACTACCTGGAAACCGAACTCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGtt < 2:1494940/288‑1 (MQ=255) 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