Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 496,035 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 496,035 | 0 | A | T | 99.2% | 917.4 / NA | 388 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 496,036 | 0 | G | C | 100.0% | 917.9 / NA | 388 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (198/190); total (198/190) | |||||||||||
* | CP042583 | 496,037 | 0 | C | G | 100.0% | 930.8 / NA | 388 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (198/190); total (198/190) |
Only 100 of 388 total aligned reads displayed.
ATACGAACTTCCATGATAATGAAATTAATTATCGTTATCGATCTTATTTGGATATGTTAGCATGTGCAGCCTAAGAATAGGTATTTAAAATATTTGATGGCAAGGCATTGTAATGAATAAACAATCCTGGCTGCTTAACCTCAGCCTGTTGAAAACGCACCCGGCGTTTCGCGCAGTATTCCTCGCTCGTTTCATCAGTATTGTGTCTCTGGGTTTGCTCGGCGTCGCGGTGCCGGTGCAGATCCAGATGATGACACATTCCACCTGGCAGGTGGGGCTTAGCGTGACGCTGACCGGCGGCGCGATGTTTGTTGGCCTGATGGTCGGCGGTGTGCTGGCGGATCGCTATGAGCGCAAAAAAGTGATTTTGCTGGCGCGCGGCACCTGTGGCATTGGCTTCATTGGACTGTGCCTTAATGCACTGCTGCCGGAGCCGAGTTTGCTGGCAATCTATTTACTTGGTTTATGGGATGGTTTTTTCGCAAGCCTTGGCGTTACGGCGCTATTGGCGGCGACACCAGCACTGGTAGGGCGTGAAAACTTAATGCAGGCCGGGGCGA > CP042583/495755‑496314 ||| aaTGAAATTAATTATCGTTATCGATCTTATTTGGATATGTTAGCATGTGCAGCCTAAGAATAGGTATTTAAAATATTTGATGGCAAGGCATTGTAATGAATAAACAATCCTGGCTGCTTAACCTCAGCCTGTTGAAAACGCACCCGGCGTTTCGCGCAGTATTCCTCGCTCGTTTCATCTCAATTGTGTCTCTGGGTTTGCTCGGCGTCGCGGTGCCGGTGCAGATCCAGATGATGACACATTCCACCTGGCAGGTGGGGCTTTCGGTGACGCTGACCGGCGGCGCGAt < 1:163546/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |