| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,601,014 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,601,014 | 0 | A | T | 99.7% | 914.4 / NA | 385 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (186/197); minor base C (1/0); total (188/197) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,601,015 | 0 | G | C | 99.7% | 920.0 / NA | 385 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (187/197); minor base T (1/0); total (188/197) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,601,016 | 0 | T | A | 99.5% | 903.6 / NA | 385 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base A (185/196); total (188/197) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 385 total aligned reads displayed.
GGCGGCATCGCCTTCGCCACGCCTCCGGGTACGCCACTGGCACCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTAGCACGCTCAGTTTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTAGTATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGG > CP042583/1600734‑1601285 ||| gCCACTGGCACCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAGTGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTg < 2:1086160/287‑1 (MQ=255) gCCACTGGCACCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTTGACGCCCTCATTTGATGATTTTCTTTGCGCCTGTTAGCGCCCCTTgc > 2:598483/1‑288 (MQ=255) aCTGGCACCGCAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGcgccg < 1:2976862/289‑1 (MQ=255) tGGCACCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAACGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGTACCGTTTATGCTAACCTGCGCTCCTGTGTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGCCGCCGTTCTGACACAAATTCTCGCAGCGATGCCTTCGACGCTCGCTTTTGCTGATTTTCTTTCCGCCTGTTGGCTCCCGTTGcgccgc > 1:333950/1‑288 (MQ=255) aCCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCgcagca < 1:2583940/288‑1 (MQ=255) caGGCAAACACTTCCTGATGCAGGAAAGTGAACCGAGCGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAATTGATGGCCACTGCTCCGGCGTGCCTGGGCCGGAGCGTTTATGCTAACCTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGAGGTACATGCTCGTGGCCCAACACGCCGTTTATGTCCCGGACGCCTTTCTGACACGAAGGCGCGAAGCGATGCCTTCGGCGCTCTCAGTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCAATCGCGTTGGTACg < 2:205604/287‑1 (MQ=255) cTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATa < 1:558050/276‑1 (MQ=255) ccTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACCAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGATCTCCTTTGATGATTTTCTTTCCGCCTGTCAGCGCCCGTCGCGCCGCAGCATTCGCTTTAATACGCCGCAAACCTCCGt > 2:565197/1‑289 (MQ=255) ccTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGt > 1:648514/1‑289 (MQ=255) aGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGAtt > 1:221785/1‑289 (MQ=255) aaaGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAAc > 1:2070222/1‑288 (MQ=255) aaGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTCCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCg < 1:1839080/289‑1 (MQ=255) aaGAGCGGCGTGAATGGGGGACTGCCCTTCCCAAATAACTCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCAGAAGCGTTGATGCTAAACTGCGCGCCTGTGTTTCTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCGCAACCCACCGTTTATTTCCCGGGCGCCTTTCTGACACAACTGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCg < 2:1558608/289‑1 (MQ=255) agagTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACCAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATCCCGTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAActt > 2:932882/1‑286 (MQ=255) tGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCg < 2:2499044/267‑1 (MQ=255) tGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCg > 1:2499044/1‑267 (MQ=255) tGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTAc > 1:1810220/1‑289 (MQ=255) cccAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCa < 1:1542111/286‑1 (MQ=255) aaaTAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCg < 1:3154542/289‑1 (MQ=255) aaaTAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCg < 1:2018324/289‑1 (MQ=255) cccACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCg < 2:2268398/249‑1 (MQ=255) cccACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCg > 1:2268398/1‑249 (MQ=255) ccACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTCCGCCAATTCCGCGGTGTgag > 2:1349521/1‑288 (MQ=255) cACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTgaag < 1:61084/289‑1 (MQ=255) aCTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCg < 2:2599942/246‑1 (MQ=255) aCTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTgaaga > 2:124447/1‑289 (MQ=255) cTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTgaagaa < 2:557185/289‑1 (MQ=255) cGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGATGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCCATTAACCGCCCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCTTGGTGTGAAGAAGGtt > 1:8767/1‑287 (MQ=255) cGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGtt > 2:2862381/1‑287 (MQ=255) gCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTa < 2:1668714/244‑1 (MQ=255) gTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGa < 1:1341755/289‑1 (MQ=255) ccTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTc < 2:1935133/219‑1 (MQ=255) ccTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTc > 1:1935133/1‑219 (MQ=255) aGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACCACTGCGCGAAGCGATGCCTTCGCCGCTCTCATTTGATGCTTTTCTTGCCGCATGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAACACGCTGAAACTCTCCGTTGCTGATTGCCTGCAATTAACCGCTCATTATGGCGGGACGCTTACGCCACTTCCGTGGTGTGAAGACGGTTTCTGGATTGCACGCGACaa > 2:1523183/1‑289 (MQ=255) aGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAAtct < 2:1424870/195‑1 (MQ=255) tttATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCa > 1:1199989/1‑244 (MQ=255) taaacgatcagcCTGTTTTTTTGCCAGTAGTACATGCTCGTGGTCCCACACACCGTATATTTCCCGCACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGAGATGCGTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCAt < 2:679519/279‑1 (MQ=255) tAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCAt < 2:336544/289‑1 (MQ=255) aaaCTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTaa < 2:2950130/169‑1 (MQ=255) aaaCTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCAtt > 2:2636877/1‑289 (MQ=255) tGCGCGCCTTTTTTTTTGCCGGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACCCACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCa < 2:1808810/289‑1 (MQ=255) tGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCa < 2:198067/289‑1 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTTATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCAtt > 2:3121868/1‑289 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGtt < 1:3005527/142‑1 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTg > 1:2925461/1‑194 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCg > 2:2123483/1‑204 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGc < 2:1456418/228‑1 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTgaagaa < 2:835829/248‑1 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTgaag > 2:1852995/1‑246 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGc > 2:441147/1‑285 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCa > 2:2430122/1‑287 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCa < 1:2430122/287‑1 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCAtt > 1:2298885/1‑289 (MQ=255) gcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTTAACTCGACCATCAAAATGCATTGCCATTg > 2:2290998/1‑289 (MQ=255) gcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCAtt < 1:94336/288‑1 (MQ=255) cgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACaa > 1:1487195/1‑269 (MQ=255) gcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTggg < 1:435869/289‑1 (MQ=255) ttGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTAccgcc < 2:2322205/289‑1 (MQ=255) gCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGCGGGGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGAAGTTCACTTGGGTATGAacgccgc > 2:2201198/1‑288 (MQ=255) ggTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCa < 1:3103311/286‑1 (MQ=255) aCATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTaa < 1:2862381/288‑1 (MQ=255) tCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCt > 1:3279490/1‑193 (MQ=255) tCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTgg > 1:2813704/1‑286 (MQ=255) gTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTAccgcc < 1:1373949/270‑1 (MQ=255) tGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTg < 2:2830783/153‑1 (MQ=255) tGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGc > 1:1815480/1‑195 (MQ=255) tGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGc < 2:1815480/195‑1 (MQ=255) tGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTgg > 1:2635219/1‑283 (MQ=255) tGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGtt > 1:517567/1‑289 (MQ=255) acacacCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCAtt < 2:3156942/115‑1 (MQ=255) cacCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAg < 1:124447/289‑1 (MQ=255) acCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAAcgc < 1:416571/222‑1 (MQ=255) acCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGG‑CGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTgaagaa > 1:58783/1‑203 (MQ=255) acCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCCGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAAcgc > 2:416571/1‑222 (MQ=255) cGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCAtt > 1:1636338/1‑109 (MQ=255) cGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGc < 2:1196857/271‑1 (MQ=255) gTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTgaagaa > 1:3185993/1‑201 (MQ=255) gTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTgaagaa < 2:3185993/201‑1 (MQ=255) gTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGa > 1:3049242/1‑221 (MQ=255) tttatttaCCCGACGCCTTTCTGACACAAACGGGCCAAGCGATGCCCTCGACGCACTCATTTGATGATTTTATTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGAAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCTTTGCTGATTTCCTGCAAGGAAGCGCTCCTTATGTCTAGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGAAATGAACGCGACAATGGAGTTGCATTGCCATTGCGTAGTACCGCCGAGCAATTAAGTTGCCAGTTGTATAATCAGGAAGc < 2:1923438/289‑1 (MQ=255) tttATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTTTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGc < 2:1633630/289‑1 (MQ=255) tttATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGc > 2:1763571/1‑180 (MQ=255) tttCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCagt < 1:1434141/289‑1 (MQ=255) ggACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCg < 1:11203/178‑1 (MQ=255) ggACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTgaagaa < 2:2999720/190‑1 (MQ=255) ggACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCagttcaatg < 1:174091/289‑7 (MQ=255) caAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTAccgcc > 2:3285311/1‑228 (MQ=255) caAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGc < 2:3047077/243‑1 (MQ=255) caAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCt > 1:3209426/1‑289 (MQ=255) aTGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCAt > 1:2343149/1‑205 (MQ=255) aTGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTAccgcc > 1:1287601/1‑225 (MQ=255) aTGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTAccgcc < 2:1287601/225‑1 (MQ=255) aTGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGt > 1:1974465/1‑289 (MQ=255) tGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGa > 1:1038633/1‑180 (MQ=255) gcgcGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGc < 1:2161912/258‑1 (MQ=255) cgcgAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCAtt < 1:1866269/75‑1 (MQ=255) cgAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACg < 1:678139/85‑1 (MQ=255) aGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTTGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGa < 2:3222856/288‑1 (MQ=255) aGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGtt > 2:2892802/1‑237 (MQ=255) gATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACgg < 2:648514/288‑1 (MQ=255) ||| GGCGGCATCGCCTTCGCCACGCCTCCGGGTACGCCACTGGCACCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTAGCACGCTCAGTTTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTAGTATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGG > CP042583/1600734‑1601285 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |