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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 497,696 | 0 | T | A | 99.0% | 729.3 / NA | 309 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
TTCCAGCATCTGCCCTTGTGCACTTTCTGGCGTCCAGAGATTGGCACTGTGTGCAGCGGCAGTATAGACAATGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTGCGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGGCTCTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCGCTATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTT‑CGG‑CGCTCGGTTCGCCGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCGTAAAAAGCCCTGGTCATCCGCGACGCGGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGACTGCCGGTCAGGGTGACGCTGGTGGAAACAATACGCTGCGGCTGGCTTTCCAGTGTATGTGTGCCACGGCTGTC > CP042583/497418‑497975 ||| gCATCTGCCCTTGTGCTGATTCTGGCGTCCAGAGATTGGCACTGTGTGCAGCGGCAGTATAGACAATGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTGCGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTgc > 1:1192622/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |