Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,676,038 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,676,038 | 0 | A | T | 100.0% | 1080.2 / NA | 445 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (217/228); total (217/228) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,676,039 | 0 | C | G | 100.0% | 1073.7 / NA | 445 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (217/228); total (217/228) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,676,040 | 0 | T | A | 99.8% | 1075.6 / NA | 445 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base A (217/227); total (217/228) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 445 total aligned reads displayed.
AGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTACTATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAAACTAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTGCCATCAGAAACGGCATCGATGACATAACCCGCTTCGGAAAGCCCCTGCGTTACCCATTCCTGGGTCCTT > CP042583/1675763‑1676317 ||| aagTCCACCGATTTGTTATCACTATCCAAGTTGATTCCGCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAAGTTCGCCAGCTCTGAAGGCCAGTAGCCTAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCATTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTGGCACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTTATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTACCCGAACCCTTACCAGCAACTCATAAATTGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCAATTg < 2:1996202/287‑1 (MQ=255) tCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGccc < 2:482245/289‑1 (MQ=255) cACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCa < 1:2966998/289‑1 (MQ=255) cACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCa < 1:222604/289‑1 (MQ=255) tGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAGTTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCa > 2:862251/1‑288 (MQ=255) aCTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAg > 1:3128723/1‑282 (MQ=255) aCTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGAAAATATTTTGCCCCACTGTCCAGcccctg > 1:2339536/1‑285 (MQ=255) ttGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACT‑ATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCa > 1:1816016/1‑270 (MQ=255) ccAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCct < 2:2938359/268‑1 (MQ=255) tAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCa < 2:2563983/289‑1 (MQ=255) tAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCa < 1:2009556/289‑1 (MQ=255) tAACCGTTCTAGGTATAATTGCTCCAGCTCTTGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCa < 2:342375/289‑1 (MQ=255) cGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTa > 2:262285/1‑280 (MQ=255) ttCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAAc > 2:2300435/1‑289 (MQ=255) cTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTTTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGACACCCTTGCAGTAAGGCAAATAACac > 2:1436778/1‑288 (MQ=255) cTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCAt < 1:2457813/256‑1 (MQ=255) cTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAg > 2:2462634/1‑289 (MQ=255) ataATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGttt > 2:3048876/1‑289 (MQ=255) cGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGtttgctttgc < 1:272965/289‑1 (MQ=255) ccAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCAt < 1:2874344/241‑1 (MQ=255) ccAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCAt > 2:2874344/1‑241 (MQ=255) cAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGt > 2:557656/1‑289 (MQ=255) aGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTa > 2:2589824/1‑181 (MQ=255) aGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTa < 1:2589824/181‑1 (MQ=255) aGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACa > 2:1649936/1‑231 (MQ=255) aGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACa < 1:1649936/231‑1 (MQ=255) tAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACa > 2:1169959/1‑229 (MQ=255) tAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACa < 1:1169959/229‑1 (MQ=255) aaCTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTgccag < 1:2848405/288‑1 (MQ=255) cTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAg < 2:2030025/195‑1 (MQ=255) cTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAg > 1:2030025/1‑195 (MQ=255) aaaCTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGccatcc < 2:3203542/289‑1 (MQ=255) ttGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCg < 1:1463399/289‑1 (MQ=255) cgTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCa > 2:739421/1‑222 (MQ=255) tgtAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTcc < 2:612588/172‑1 (MQ=255) tgtAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTcc > 1:612588/1‑172 (MQ=255) tACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCct > 2:1517129/1‑173 (MQ=255) aCTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGa < 1:1940602/289‑1 (MQ=255) cTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGcc > 1:1704982/1‑169 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAg < 2:2761492/164‑1 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCAt > 1:1050985/1‑181 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAgg < 2:1485907/204‑1 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGa > 1:1433568/1‑289 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGa > 1:1636368/1‑289 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGa > 2:2073446/1‑289 (MQ=255) atTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCt < 2:1974988/192‑1 (MQ=255) atTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTgccagc > 2:2797054/1‑254 (MQ=255) tGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACg > 2:2701339/1‑234 (MQ=255) tCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCa > 1:2551999/1‑150 (MQ=255) tttgtcaacatATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCCCTGATTTCTAATGTTAAATTCAAAGCATGATGTTGCCTTAATGGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCAt < 2:2367521/279‑1 (MQ=255) gCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGAt > 2:1400288/1‑279 (MQ=255) cacaCTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGt < 1:127526/204‑1 (MQ=255) cacTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGa < 2:2204075/172‑1 (MQ=255) tATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCtt < 1:316820/289‑1 (MQ=255) tATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCtt < 2:1222112/289‑1 (MQ=255) tATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCtt < 1:2768608/289‑1 (MQ=255) tATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCt > 1:1774035/1‑288 (MQ=255) tGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCa > 2:648379/1‑185 (MQ=255) tGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATcc > 1:471558/1‑261 (MQ=255) gACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGAt < 1:922721/120‑1 (MQ=255) gACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGccat > 1:789474/1‑237 (MQ=255) gACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGAt > 1:415220/1‑268 (MQ=255) cTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAgcg < 1:874034/289‑1 (MQ=255) aCAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTgccagc > 1:1379954/1‑229 (MQ=255) aCAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCaa > 1:2256319/1‑289 (MQ=255) aCAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCaa > 2:689150/1‑289 (MQ=255) agagTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCata < 1:2680946/247‑1 (MQ=255) agagTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCata > 2:1874112/1‑247 (MQ=255) agagTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCata < 1:1874112/247‑1 (MQ=255) agagTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAAACATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCgg > 1:2409818/1‑240 (MQ=255) tCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGtttgctttgc > 2:2429822/1‑194 (MQ=255) tCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAAc > 1:1578528/1‑204 (MQ=255) tCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCgg < 1:2094094/236‑1 (MQ=255) tCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATc < 2:1720365/258‑1 (MQ=255) tCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAatca < 2:1831498/270‑1 (MQ=255) tCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATa < 1:1512002/287‑1 (MQ=255) cATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTgccagcc < 1:55964/222‑1 (MQ=255) aGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAAc > 1:663813/1‑194 (MQ=255) aGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCAtc > 1:346616/1‑286 (MQ=255) ccGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGTTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAg > 2:2115619/1‑154 (MQ=255) ttgaaTTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATCAAGCCCATCCCAGCCATCAGAAACGGCATc > 2:1280600/5‑289 (MQ=255) ttgaaTTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTGCCATCAGAAACGGCATc > 1:3278014/5‑289 (MQ=255) gaaTTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATc > 2:3119130/3‑228 (MQ=255) gTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGcc < 2:533969/251‑1 (MQ=255) ccTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCAt < 1:544994/215‑1 (MQ=255) ccTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGa > 2:1638796/1‑235 (MQ=255) ccTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTGCCATCAGAAACGGCATCGATGACATAACCCGCTTCGGaa > 1:2430051/1‑289 (MQ=255) ccTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTGCCATCAGAAACGGCATCGATGACATAACCCGCTTCGGaa > 2:1052434/1‑289 (MQ=255) cTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTGCCATCAGAAACGGCATCGATGACATAACCCGCTTCGGaa < 1:2617507/288‑1 (MQ=255) tgCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGtttgctttg > 2:314375/1‑134 (MQ=255) gCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATa < 2:416719/50‑1 (MQ=255) gCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTGCCATCAGAAACGGCATCGATGACATAACCCGCTTCGGAAAGCCCCTGCg < 1:2172478/289‑1 (MQ=255) gCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTGCCATCAGAAACGGCATCGATGACATAACCCGCTTCGGAAAGCCCCTGCg > 1:3110255/1‑289 (MQ=255) cccGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAatat < 1:3035495/186‑1 (MQ=255) tGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTGCCATCAGAAACGGCATCGATGACATAACCCGCTTCGGAAAGCCCCTGCGtt > 2:1785540/1‑280 (MQ=255) gCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCAt < 1:1000543/76‑1 (MQ=255) gCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCAt > 2:1000543/1‑76 (MQ=255) cAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTGCCATCAGAAACGGCATCGATGACATAACCCGCTTCGGAAAGCCCCTGCGTTACCCATTCCTgg < 2:1581861/289‑1 (MQ=255) gCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAAt < 2:912580/185‑1 (MQ=255) aCTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTGCCATCAGAAACGGCATCGATGACATAACCCGCTTCGGAAAGCCCCTGCGTTACCCATTCCTGGGTCCt < 1:689150/289‑1 (MQ=255) ||| AGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTACTATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAAACTAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTGCCATCAGAAACGGCATCGATGACATAACCCGCTTCGGAAAGCCCCTGCGTTACCCATTCCTGGGTCCTT > CP042583/1675763‑1676317 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |