Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 503,581 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 503,581 | 0 | A | T | 99.7% | 815.3 / NA | 340 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (183/155); minor base C (1/0); total (185/155) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 503,582 | 0 | G | C | 99.1% | 801.8 / NA | 340 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base C (183/153); total (185/155) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.95e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 503,583 | 0 | C | G | 99.4% | 809.5 / NA | 340 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (185/153); minor base T (0/2); total (185/155) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.07e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 340 total aligned reads displayed.
TTGCAGGAAAACTCGGTTAACGGAGTGATCGAGTTAACATTGTTAAGTTAAATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGT‑GTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAAAGTGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGAGCGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGCCGGGGATGATCTGGCTGCTCGCTGGGGTGGTTCTCGCCGGTGCGGTGCAGGATTTCATG > CP042583/503302‑503862 ||| cGGTTAACGGAGTGATCGAGTTAACATTGTTAAGTTAAATATTGGTTTCAACCCCGATTTACATGGTTGCTGT‑GTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGtatc > 1:722032/1‑278 (MQ=255) gATCGAGTTAACATTGTTAAGTTAAATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGT‑GTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATGTTGGTGGCGTCGGTCTGTATCGATCGGATCGCTTACCGTTTTTAt > 2:3039425/1‑289 (MQ=255) tGTTAAGTTAAATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGT‑GTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCg > 1:2979248/1‑288 (MQ=255) ttaagttaaATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGT‑GTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTGACCGTTTTTAGGGGCGGTATATTGCCa > 2:84544/1‑289 (MQ=255) ttaaATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGT‑GTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAAt > 1:971226/1‑289 (MQ=255) gTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGT‑GTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCgg > 1:1012545/1‑289 (MQ=255) ccGATTTTCAT‑GTTGCAGGGGTTGTTAAGTGCAACAAAGATGATAAAGAAACAAAAGGTAACATCTCGATGGACAGGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCGGGACAGTGCTCTCGGTAATGGGAGCATTGGCTCGTGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGa < 2:1056544/289‑1 (MQ=255) ccGATTTACATGGTTGCTGT‑GTTGTTAAATTGTACAAAGAAGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGa < 2:3014918/289‑1 (MQ=255) ttGCTGT‑GTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGcc > 1:1069504/1‑289 (MQ=255) gt‑gtTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCt > 2:2417756/1‑219 (MQ=255) gt‑gtTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCt < 1:2417756/219‑1 (MQ=255) gt‑gtTGTTAAATTGGTCAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAAAATCGCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAAGCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTTTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCTCTGTGGTTTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCgg < 2:2727414/289‑1 (MQ=255) gttAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGtatctatc < 2:2739454/206‑1 (MQ=255) ttGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTa < 2:1617182/219‑1 (MQ=255) tGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGTATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAacg < 1:1935582/289‑1 (MQ=255) gTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGa < 1:2242950/258‑1 (MQ=255) gTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGa > 2:2242950/1‑258 (MQ=255) gTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAacga < 2:1903611/289‑1 (MQ=255) cAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACgg > 2:818876/1‑289 (MQ=255) aTGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTgg > 1:2918961/1‑289 (MQ=255) aaCAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTAt > 1:45372/1‑200 (MQ=255) aCAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAAGGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGGGTATGACGACAGCGGTGCGCCATAACGACGGGTGGGACTAtgtggag > 2:884596/1‑286 (MQ=255) aTGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTAt > 2:2927252/1‑194 (MQ=255) acGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTatat < 2:1100883/186‑1 (MQ=255) acGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTCTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTT‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTg > 2:244598/1‑253 (MQ=255) cGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCg > 1:1658978/1‑167 (MQ=255) cGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGt > 1:50506/1‑288 (MQ=255) cGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTc > 1:1301349/1‑289 (MQ=255) cGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCCACGGCCC‑AGAAAGGGCTGTTCGGTc > 2:1496471/1‑289 (MQ=255) cacaCGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTTCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGGGcctgttggtcc > 2:1221732/1‑278 (MQ=255) cacaCGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCa > 1:1966752/1‑288 (MQ=255) acaaGGATAACAACAATGAACAAATCAGGGAAAAACCTCGTCTGGGCAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCAcc < 2:1178807/289‑1 (MQ=255) ggATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAAAGACGGGCTGGACTATGTGCCGAGGGCAA‑AGAAAGTGCTGTTCGGGCACCAgtt > 2:1632136/1‑289 (MQ=255) aacaacTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTAt > 1:11789/1‑163 (MQ=255) aacTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGcc < 1:2867111/289‑1 (MQ=255) aacTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGcc < 1:2137914/289‑1 (MQ=255) tATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTAt > 2:616697/1‑204 (MQ=255) tATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTAt < 1:616697/204‑1 (MQ=255) tGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGtat > 1:913137/1‑130 (MQ=255) tGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTg > 2:3224663/1‑288 (MQ=255) tGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGc < 2:2378909/289‑1 (MQ=255) tGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGGATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTCTGGGCTGTATATCGCCAAAACTGTT‑CTTGCGGTCTACCCGACGCGTATGACCCCAGCGGTGCGCCATAACGCCGGGCTGGACTTGGTGCCGCCGGACA‑AGCAAGTGCTGTCTGCTCACCATGTTgtgtgccttg > 2:2307489/1‑279 (MQ=255) tGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTGCCCCTGGGAT‑CCTTGGCTTAAATTGGGGGGAAAAGAATCAAGGCCCGGTGGCTGGTGTTGGCGCGGGTCGGTACCTATTTAATCGCTACCCGTTTTATTGGGC‑GTATATTGCCAAAAATGGGTCGGCCGGTTGACCCGCCGCGTATCACCCCAGGGGTGCGCCTTACGGACGGGCTGGACTAGGTGCC‑TCGGGCACAGAAAGTGCGGTTCGTTCACCTTTTGGGGGCCCTTg > 2:19538/1‑288 (MQ=255) aacaaatcagggAAATACCTCGTCTGGACAGTGCGCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCg > 1:1819199/10‑289 (MQ=255) tACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGAc > 2:1306491/1‑179 (MQ=255) tACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGc > 1:2041811/1‑278 (MQ=255) tACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGc < 2:2041811/278‑1 (MQ=255) ccTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTg > 1:814616/1‑196 (MQ=255) tGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGt > 1:466757/1‑226 (MQ=255) tGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGt < 2:934183/236‑1 (MQ=255) tGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTg < 1:2092985/246‑1 (MQ=255) ctctctGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑CGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGGTGCCATTGCCGGTGCAGGTCCGCTGGTTGGGGCGGTACTggcgg > 2:492400/1‑289 (MQ=255) tctctGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTggcgg < 1:1116893/288‑1 (MQ=255) tctGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGcc > 1:3171883/1‑252 (MQ=255) ctGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTggg > 2:464609/1‑271 (MQ=255) tGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTAt > 1:2556646/1‑115 (MQ=255) tGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTAt < 1:3064770/162‑1 (MQ=255) tGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAg < 1:347007/254‑1 (MQ=255) gTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCTTAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCaaa > 1:1533098/1‑289 (MQ=255) aaTGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTAt > 2:2938201/1‑112 (MQ=255) aaTGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTAt < 1:2938201/112‑1 (MQ=255) aaTGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAACATGTG‑CTGGCGGTTGCACCGACGCGTATGACGCCACCCGTGCGCCAAAACGACCGGCAGGACTATGTGCCGAAGGACA‑AGAAAGTGCTGGTCAGTCAGCATTTTGAGGGCCTTGCGGGAGCAGGTCCGATGGTGGGGCCCGTCCTGGCGGCGCagggg > 2:2862460/1‑285 (MQ=255) gAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTc > 1:2361048/1‑252 (MQ=255) gCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGttttt < 2:2346373/103‑1 (MQ=255) gCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTCTGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGTCAC‑AGAAAGGGCTGTTGGGTCACCAGTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGTGCCGGTACTGGGGGCGCCAACggcgcca > 2:2556322/1‑283 (MQ=255) gCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAacga < 2:3311421/176‑1 (MQ=255) gCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGgcgc > 1:1494775/1‑277 (MQ=255) gCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTAc > 2:312903/1‑288 (MQ=255) gCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCAACATTTTGAGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCACATGGGCTa > 1:1874949/1‑287 (MQ=255) aTTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACggg > 1:3052478/1‑178 (MQ=255) aTTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGGTCCCATTTTTCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCCGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAACTGGGCCAccg > 2:1663978/1‑287 (MQ=255) tttGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGc < 1:3144572/289‑1 (MQ=255) ttGCTTTGTGATACATTGCTGTAAATCGTGGGGAAAAG‑ATCAACGCGCAGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCTCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATCTCGACAAAAATGTG‑CTGGCGGGTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATACCGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGcc < 2:2589695/289‑1 (MQ=255) ttGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTg > 1:2510018/1‑161 (MQ=255) gCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGCCgg > 1:56227/1‑289 (MQ=255) tctGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGCCgggg < 2:555271/289‑1 (MQ=255) cATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGt < 1:1431237/232‑1 (MQ=255) cATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGt > 2:1431237/1‑232 (MQ=255) cATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCCGGTGGGGCCGGTACTGGGTGCGCAACTTGGCTAACTGCCggggggtgtctgg > 2:3151698/1‑280 (MQ=255) cTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGCCGGGGATGATCTGgctgct > 1:3251354/1‑289 (MQ=255) cTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACCATGTGCCGACGGACC‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTTCGGCCATTGCCGGAGCAGGGCCGCGGGTGGGGCCGGTACTGGGGGCGCAAATGGGGTAGCGGCCggggtgtgcgggggctgc > 2:1082114/1‑275 (MQ=255) aaTCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTg > 2:1809248/1‑105 (MQ=255) aaTCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAg < 1:2315447/217‑1 (MQ=255) cGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGAc < 2:1476578/116‑1 (MQ=255) cGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGCCGGGGATGATCTGGCTGCTCGCTgggg < 1:1221732/289‑1 (MQ=255) cGTGGGGAACAG‑ATAAAAGCGCTGTGGATTGGGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTAGCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGCCGGGGATGATCTGGCTGCTCGCTgggg < 2:2139734/289‑1 (MQ=255) tGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTAt > 1:3034934/1‑73 (MQ=255) tGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGATCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGGGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGTGGCGCCAATGGGCTCCCTGGCGGGGGGGGTGTGGCGGCGCGCTgggggt > 2:2671674/1‑287 (MQ=255) tGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCtggt < 1:828479/225‑1 (MQ=255) tGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAATGCTGTTCGGTCCCCATTTTGCGGCCATTGCCGGGGCCGGTACGCTGGTGGGGCCGGTACTGGGGGGCCAAAGGGGGTCCCTGACGGGGGTTGTCTGGGTTCTCGCTgggggg > 2:677314/1‑287 (MQ=255) cAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGCCGGGGATGGTCTGGCGGCCCGCTGGggtgggtgcc > 2:1278618/1‑283 (MQ=255) aTCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGAcg > 1:2623525/1‑105 (MQ=255) aTCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATAGCCAAAAATGTG‑ATGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGCAAGAGCCGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGGGGGGCCGGTACTGGCGGCGCGACTGGGCGTCCTGGCGGGGGAGAAGTGGGCGCTCGCTGGggcggtgtcttcag > 2:2110374/1‑281 (MQ=255) aaCGCGCTGTGGATTGTGTTGGCGTCGTTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGCCGGGGATGATCTGGCTGCTCGCTGGGGTGGTTCTCGCcggtg < 1:1778068/289‑1 (MQ=255) aaCGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGCCGGGGATGATCTGGCTGCTCGCTGGGGTGGTTCTCGCcggtg < 2:760191/289‑1 (MQ=255) cgcgCTGTGGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACg < 1:128140/151‑1 (MQ=255) tgtgGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGa < 1:2788824/133‑1 (MQ=255) tgtgGATTGTGGTGGCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGCCGGGGATGATCTGGCTGCTCGCTGGGGTGGTTCTCGCcggtg > 2:3078786/1‑282 (MQ=255) tggggtggCGTCGGTCTGTATCTATCTTATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGCCGGGGATGATCTGGCTGCTCGCTGGGGTGGTTCTCGCcggtgcggtg < 1:2736550/277‑1 (MQ=255) tggtggCGTCGGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGCCGGGGATGATCTGGCTGCTCGCTgggg > 1:1618636/1‑258 (MQ=255) ||| TTGCAGGAAAACTCGGTTAACGGAGTGATCGAGTTAACATTGTTAAGTTAAATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGT‑GTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAAAGTGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTGTAATGGGAGCATTTGCTCTGGGATACATTGCTTTAAATCGTGGGGAACAG‑ATCAACGCGCTGTGGATTGTGGTGGCGAGCGTCTGTATCTATCTGATCGCTTACCGTTTTTATGGGCTGTATATCGCCAAAAATGTG‑CTGGCGGTTGACCCGACGCGTATGACGCCAGCGGTGCGCCATAACGACGGGCTGGACTATGTGCCGACGGACA‑AGAAAGTGCTGTTCGGTCACCATTTTGCGGCCATTGCCGGAGCAGGTCCGCTGGTGGGGCCGGTACTGGCGGCGCAAATGGGCTACCTGCCGGGGATGATCTGGCTGCTCGCTGGGGTGGTTCTCGCCGGTGCGGTGCAGGATTTCATG > CP042583/503302‑503862 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |