| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,725,477 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,725,477 | 0 | A | T | 99.7% | 781.2 / NA | 330 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base T (160/169); total (160/170) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,725,478 | 0 | G | C | 99.7% | 783.7 / NA | 330 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (159/170); minor base T (1/0); total (160/170) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.85e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,725,479 | 0 | C | G | 100.0% | 785.5 / NA | 330 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (160/170); total (160/170) | |||||||||||
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
TGGTGACGCAAATTGTGGTACTGGACGCCATTTTCAGTCTCGACAGTGTGATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCAGCGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGAGCCGCCACGATATTGAGCA > CP042583/1725199‑1725757 ||| tggtgACGCAAATTGTGGTACTGGACGCCATTTTCTCACTCGACTCAGTGATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTAGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGTCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGtgatga > 2:1560082/1‑288 (MQ=255) gtgACGCAAATTGTGGTACTGGACGCCATTTTCTCACTCGACTCAGTGATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCg > 1:1873570/1‑289 (MQ=255) gCAAATTGTGGTACTGGACGCCATTTTCTCACTCGACTCAGTGATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGgc > 1:2758121/1‑288 (MQ=255) aaTTGTGGTACTGGACGCCATTTTCTCACTCGACTCAGTGATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCt > 2:470112/1‑288 (MQ=255) gtgGTACTGGACGCCATTTTCTCACTCGACTCAGTGATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATc < 1:407419/289‑1 (MQ=255) cTGGACGCCATTTTCTCACTCGACTCAGTGATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTgg < 2:1598057/289‑1 (MQ=255) gACGCCATTTTCTCACTCGACTCAGTGATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTa > 1:772424/1‑289 (MQ=255) gCCATTTTCTCACTCGACTCAGTGATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCt > 1:1835960/1‑289 (MQ=255) cATTTTCTCACTCGACTCAGTGATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGCTGATCGAGGCGCTCACGTACGTGGCTATCtta > 2:2882220/1‑288 (MQ=255) cATTTTCTCACTCGACTCAGTGATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGa < 2:503702/264‑1 (MQ=255) tcactcgccgcagtgATTGCGGCCGTCGGGTTGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGc < 2:842524/277‑1 (MQ=255) agtgATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTtttctt > 1:1250123/2‑289 (MQ=255) cgccgTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAAc < 1:504900/289‑1 (MQ=255) gccgTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAAcc > 1:2440157/1‑289 (MQ=255) ccgTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGTTGATCGAGGCGCTCAACAAGTTGGCTAACTTTAACCGGCGGCGTTTTCCTTACGCTAACCa > 2:817910/1‑289 (MQ=255) cgTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGCTGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGTCAAcccg > 2:1721116/1‑287 (MQ=255) cgTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGTGGCGCTCAAGCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCAACGTTTTCTTTCGCCTAACCAg > 2:2471478/1‑289 (MQ=255) cgTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCa < 2:794155/288‑1 (MQ=255) gTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGcc > 1:3224906/1‑289 (MQ=255) cgcccATTTACTGGACTGGTTGGCCGCCGTGGTGATCGTTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAg < 2:1873570/286‑1 (MQ=255) cGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAg < 2:3224906/289‑1 (MQ=255) gTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGc < 2:2927173/227‑1 (MQ=255) gTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGc > 2:2433730/1‑227 (MQ=255) gTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCg > 2:892896/1‑256 (MQ=255) gTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGaa > 1:2665899/1‑288 (MQ=255) gTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAg > 1:2205377/1‑289 (MQ=255) gTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCCGCGCCCACGGACCACCGaa > 2:2663516/1‑288 (MQ=255) gTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGAAGCTGCGCCAGCGGACTACCGaga > 2:200226/1‑287 (MQ=255) atgGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTaa > 2:208679/1‑289 (MQ=255) ggCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCg > 1:69325/1‑278 (MQ=255) gCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATc > 1:338904/1‑196 (MQ=255) ccTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTtttct < 2:930790/219‑1 (MQ=255) gacagTTGGTGTCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGTTCGTTATTCGCTGCGTAAGCTTTCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGATGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGGCGTTTTCTTTCCGCTAACCGGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAaagaag < 1:2393483/284‑1 (MQ=255) aTGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTAAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGCCTACCGAGGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGTAAAAaggagagg > 2:3078/1‑287 (MQ=255) tGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATg < 1:976491/288‑1 (MQ=255) tGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATg < 1:493365/288‑1 (MQ=255) aTGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGa > 1:2572972/1‑287 (MQ=255) aTGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAAc > 2:3001933/1‑289 (MQ=255) aTGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGGTTCTCGGTGATGATCGATGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCATACGCCGCGCCAGCGGACTACCTACGCGGTAATGCTCCTGCTTCGCGGGCAAAAAGAAGCTTCGGacc > 2:2253560/1‑287 (MQ=255) ggCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTGACCGGTCACCCGACGTTCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTg < 2:1448384/289‑1 (MQ=255) ccAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTgg > 1:2892345/1‑288 (MQ=255) cAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTtttct < 1:727615/204‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTtttct > 2:727615/1‑204 (MQ=255) cAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGa < 2:1835960/288‑1 (MQ=255) gCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAAt > 2:3029276/1‑170 (MQ=255) gCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGc > 2:2160881/1‑208 (MQ=255) cAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGCTTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGCTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAACGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCCGCTTAGGGGGCAAACAGAAATTGCGGAACTgcggtc > 2:2393483/1‑283 (MQ=255) cGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAAc < 1:2135945/289‑1 (MQ=255) ttAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCggg > 1:2497750/1‑255 (MQ=255) aCGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGt < 1:1386182/289‑1 (MQ=255) cGCAATTTGTTAACAGTCAACCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTc < 1:2283330/289‑1 (MQ=255) aaTTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCa < 1:200226/288‑1 (MQ=255) aTTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCAt > 1:1702147/1‑288 (MQ=255) tGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCtg < 2:2439251/289‑1 (MQ=255) cccGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTgg < 1:3059700/146‑1 (MQ=255) cgaTCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCaacacccgca > 2:682771/1‑280 (MQ=255) ttATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACGGGACGCCGAAACCGAGTCCATGCCGGTGGATGATGGTAACCAGCAGag > 2:1510758/1‑288 (MQ=255) tctGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTaa < 1:1901556/289‑1 (MQ=255) ctGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTaa > 2:1325729/1‑288 (MQ=255) tGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCa < 2:1645247/215‑1 (MQ=255) tGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGGACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCtg < 1:1508953/258‑1 (MQ=255) tGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCTGAAACCGCGTCCATGCtggtg < 2:1257304/261‑1 (MQ=255) tGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGa > 1:1016319/1‑263 (MQ=255) tGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAAt > 1:1610340/1‑288 (MQ=255) tGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGAT‑‑‑GGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGt < 1:864346/247‑1 (MQ=255) gCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTgg > 2:2566891/1‑126 (MQ=255) ttAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCTTGGTAACcagca > 2:1663510/1‑275 (MQ=255) gCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGACGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGa > 2:1362863/1‑289 (MQ=255) gtCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCGGAAGGTTGCGGCGTCGTCATTCCGGAAGGATACCTGTACGCGGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAGCCGGCGACGTGTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGTCTGCTTAGCGGGCTAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGaa < 2:1894057/287‑1 (MQ=255) cTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATACGCAGGAAcggc > 1:2538678/1‑289 (MQ=255) tGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAAcggcg < 1:906246/289‑1 (MQ=255) tgatTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGgatgat < 1:932339/289‑1 (MQ=255) tGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAATGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAg > 2:1812576/1‑289 (MQ=255) tGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGa > 1:1297208/1‑288 (MQ=255) gCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGgcg > 2:2823640/1‑89 (MQ=255) gCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATg < 1:2955540/201‑1 (MQ=255) tAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTa > 1:1455574/1‑289 (MQ=255) cccTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAATGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGTATGATTGAGCGGGTACt < 1:1347664/288‑1 (MQ=255) cTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACt < 1:640866/287‑1 (MQ=255) ttCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTa < 2:945114/289‑1 (MQ=255) cgtagtacttCCGACAGACTGCCTCTACGCTGCACTTGTTCTCTCGGTTAGGATCGGCGCGCTCGATAAGTTGCTTATCTTTAACCGGGGTCGTTTTCTTTCAGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGACGCGGTAATGCGCCTGCTTAGGGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAACCCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAAACCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTc < 2:2538678/281‑1 (MQ=255) tCGTCATTCCGAAATGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTcag < 1:1812576/289‑1 (MQ=255) tCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTcag < 1:3078/289‑1 (MQ=255) cGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCa < 2:1078616/197‑1 (MQ=255) cATTCCGAAAGTCTACCGGTACGCTGCAAGTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGTCGCTCACGCAGTTGGCTAGCTGTAACCGGCGACGTTGTCTGGCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGGCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTcagcag < 2:334208/288‑1 (MQ=255) ccGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTa < 2:1131239/289‑1 (MQ=255) aaaGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGGACTTAATCGTAACCAGCGTACCGTCAGCAGACTTATGa > 2:1677943/1‑289 (MQ=255) tACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACgtcg < 1:1721116/288‑4 (MQ=255) aCCTGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACgtcgc > 1:2855986/1‑284 (MQ=255) tGTACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACgtcgcgcca < 1:817910/289‑9 (MQ=255) tACGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCCACg > 2:2735360/1‑289 (MQ=255) aCGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCCACGa > 2:2312399/1‑289 (MQ=255) aCGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCCTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGcc < 1:1119046/161‑1 (MQ=255) cGCTGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACcagca < 1:1657650/198‑1 (MQ=255) tGCCATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCCACGatat < 1:1560082/288‑1 (MQ=255) ccATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACcagca > 1:2434241/1‑193 (MQ=255) ccATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTcagcag < 1:1158981/262‑1 (MQ=255) ccATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATg < 1:209569/269‑1 (MQ=255) ccATTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCCACGATATTGa > 2:1183575/1‑289 (MQ=255) aTTGGTTTCTCGGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACcagca < 1:1665366/191‑1 (MQ=255) ||| TGGTGACGCAAATTGTGGTACTGGACGCCATTTTCAGTCTCGACAGTGTGATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGATGGCCAGCAAGCCGTTAACGCAATTTGTTAACAGTCACCCGACGATCGTTATTCTCTGCTTAAGCTTCCTGTTGATGATTGGCTTTAGCCTGGTGGCAGAAGGTTTCGGCTTCGTCATTCCGAAAGGCTACCTGTACGCTGCCATTGGTTTCAGCGTGATGATCGAGGCGCTCAATCAGTTGGCTATCTTTAACCGGCGACGTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGAGCCGCCACGATATTGAGCA > CP042583/1725199‑1725757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |