Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,730,919 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,730,919 | 0 | A | T | 99.7% | 884.5 / NA | 369 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (194/174); minor base G (0/1); total (194/175) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,730,920 | 0 | G | C | 99.5% | 860.6 / NA | 369 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base C (193/172); total (194/175) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,730,921 | 0 | C | G | 99.2% | 855.1 / NA | 369 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base G (191/173); total (194/175) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.07e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 369 total aligned reads displayed.
GGGCATTTTTGATATGGGTACTGAGTGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGAGCCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTAGCATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGAGCCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTACAGTCAGG > CP042583/1730641‑1731198 ||| ttttGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCcgc > 1:53224/1‑289 (MQ=255) ttttGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCcgc < 1:999397/289‑1 (MQ=255) tgtcagAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGAtcccccctcgct > 2:2980051/6‑284 (MQ=255) aaTCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTAc > 1:3180666/1‑289 (MQ=255) aTCCATCGGCGCTCTGGCGCTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTAcg < 1:1738383/289‑1 (MQ=255) tCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCcgcg > 1:2212030/1‑289 (MQ=255) tctGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCgtacgtac < 2:2212030/289‑1 (MQ=255) aCTGTTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCtgat < 1:165692/288‑1 (MQ=255) aCTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCtgat < 2:1219892/288‑1 (MQ=255) aCTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCtgat < 1:577005/288‑1 (MQ=255) aCCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGAt < 1:2071458/226‑1 (MQ=255) ccACCCTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGc < 1:1794433/289‑1 (MQ=255) cacaCTATCTGCTGCGCCATCGCAACCAACGGGTGCTTTTTGAGTCGCTGCACACGTTAGACATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATTACGTGGCCACCGttttt > 1:255591/1‑286 (MQ=255) tCTGATGCGCCATCGCAACCAACGGTTGCTGTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGGAATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTGGATGCTGTACCTGTCGGAGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTGGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGCTCTGCATTACCACGGTGATGATGTTGTCGCTGCTGATGGCAACGGATCCGTCCCTTCCTGCTACGCCGCGTGCGTAGCTTGTGAGCTATACGCCGTGGCCAACGtctttcgtgagcac > 2:1290672/1‑279 (MQ=255) ctgctgCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGcgtacgt < 1:1375441/244‑1 (MQ=255) tgcGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGCCGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGGGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCCGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTCCGTACCTGATGAGCCATATGCCGGCGCCACCGGTTTTGCTGATCCcgctgc > 2:270597/1‑288 (MQ=255) ccATCGCAACCCCCGGTTGCTTTTTTGGTCGCTGCTAACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGGTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGcc < 2:3085463/289‑1 (MQ=255) cATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGATTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCGACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCa > 1:743123/1‑289 (MQ=255) cATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCTCGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGGTACCGTTTTTGTGGATCCTGCGCCCCGCCa > 2:427750/1‑289 (MQ=255) cATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATgg > 2:139978/1‑199 (MQ=255) cATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCGCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGGACCTGATGAGCCATAAGCCGTGGCTACCGTCTTTTCTGCTCCCTCTGCCCGcc > 2:890044/1‑288 (MQ=255) aTCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCaa < 1:45171/289‑1 (MQ=255) cccccCGTTTGGTTTTTGCGTCGCTGCTCACGTGGGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAAcatcat < 2:1865086/288‑1 (MQ=255) cACGGTTGCTTTTTGGGTCGCTGCTAACGTTAGCCATCACGCTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGGTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGAc < 2:1102338/289‑1 (MQ=255) ggTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCa < 2:3180666/288‑1 (MQ=255) cTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGAtccctcc > 2:1640597/1‑195 (MQ=255) ttttGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATg < 1:2031121/289‑1 (MQ=255) gcTGCTCACGTTAGCCATCACACTGCCGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGTGCTCTCCCTGCTTGCCACTCCGCGTACTTAACTCACGAGCCATATGCCGTGCCTTCCGTTTTTGCCGATCCTTCTGCCCCGCAACCTCCTTACCATgcggctgtggc > 2:1920405/2‑274 (MQ=255) ccATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCac > 1:2963320/1‑288 (MQ=255) tCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCata > 1:1017626/1‑204 (MQ=255) acacTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAAcat > 1:3226882/1‑245 (MQ=255) acacTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCCACCGTTTTTGCTGATCCATCTGCCCGCCCACATCATGACCATGGGGTCGTATTCCTTTCGTGCGGCACGCCAAaaca > 2:16654/1‑289 (MQ=255) gTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTa < 1:2146883/205‑1 (MQ=255) gTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTa > 2:2146883/1‑205 (MQ=255) gTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAAcatca > 1:826802/1‑239 (MQ=255) aGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCtg > 1:360618/1‑180 (MQ=255) aGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGaaacca > 2:1791814/1‑286 (MQ=255) gctttcgaTGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAAc > 2:2250750/8‑288 (MQ=255) gctttcgaTGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACACTTCCGAAAGCGAAAc > 1:2364373/8‑288 (MQ=255) tttcgaTGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCa < 2:1039534/284‑1 (MQ=255) tCTGCCGTGTGCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGAGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCCACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAAcgcg < 2:3041373/289‑1 (MQ=255) gCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGAt < 2:1997533/124‑1 (MQ=255) gCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCctgctg > 1:3124992/1‑199 (MQ=255) cGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTAcgcc < 2:2086361/142‑1 (MQ=255) cGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGa > 1:287701/1‑289 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTAcgc < 2:300742/138‑1 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTAcgc > 1:300742/1‑138 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCtgat > 1:2635809/1‑154 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCggta > 2:978135/1‑237 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGaa < 1:978135/239‑1 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAAcg > 1:2856298/1‑279 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAata > 2:498002/1‑289 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCCACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAata > 1:3041373/1‑289 (MQ=255) ttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATgg < 2:2474871/210‑1 (MQ=255) ttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATgg > 1:2474871/1‑210 (MQ=255) tCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGAc < 2:3220744/199‑1 (MQ=255) attattGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGTCCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa < 2:773494/289‑1 (MQ=255) attattGGTCGGTGGTTGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTACTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa < 2:361518/289‑1 (MQ=255) tgtgCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTTCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCg < 1:1320562/289‑1 (MQ=255) tgtgCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCg < 1:2790290/289‑1 (MQ=255) cTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAAc > 1:161623/1‑255 (MQ=255) tGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa > 1:3297903/1‑279 (MQ=255) ttGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGc > 2:711984/1‑139 (MQ=255) ttGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGc < 1:3066652/209‑1 (MQ=255) ttGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAAc > 1:497965/1‑239 (MQ=255) ttGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTgg > 1:3254398/1‑289 (MQ=255) ttGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTgg > 1:1907475/1‑289 (MQ=255) gtgGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTggg < 2:2400851/285‑1 (MQ=255) gtgGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTggg > 1:2400851/1‑285 (MQ=255) gAGGGCCCTGCGCCTGCCACGAATTGAGGACATGTTGAGCGTCCTTACCACGGTGATAAGGGTGTCGCTGATGATCGCAGCGTAGCCGTCACTGCTTGCTACACCACGTACGTACCTGATGAGCCTTATGTCGTTGATACAGTTTTTGCTGAGCCCGCTGCCCGCCAACATCACGAGCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCTGAATGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGa < 2:743123/288‑1 (MQ=255) gAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATAtt < 2:633099/257‑1 (MQ=255) gcgcCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGc > 2:1345578/1‑147 (MQ=255) gcgcCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGc < 1:1345578/147‑1 (MQ=255) gcgcCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa > 2:2876096/1‑267 (MQ=255) gcgcCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAggg > 2:557126/1‑289 (MQ=255) gcgcCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAggg > 1:1513003/1‑289 (MQ=255) cGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATg > 1:2311466/1‑175 (MQ=255) cGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATg < 2:1481049/175‑1 (MQ=255) tttttGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAgcgc > 1:1968936/1‑286 (MQ=255) tCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGt < 1:1417809/288‑1 (MQ=255) ccTTACCACGGTTATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGTTCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGcc < 1:854876/281‑1 (MQ=255) ccTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCgg < 1:1045129/161‑1 (MQ=255) ccTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGttt < 2:2342399/286‑1 (MQ=255) ccTTACCACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTtctc > 1:2583607/1‑289 (MQ=255) tACCACGGTGTTTAGGGTGTCGCTGATGATGCCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCa < 2:1723868/258‑1 (MQ=255) tACCACGGGGGTGAGGGTGTCGCTGACGACGGCCGCGGATCCCGCCCTGCTTGCTGCGCCGCGTACGTGACTGCTGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCggg < 2:2623990/289‑1 (MQ=255) ccACGGTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTa < 2:3310575/289‑1 (MQ=255) ccACGGTGATGATGGTGTCGCGGCTGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTa < 1:710469/289‑1 (MQ=255) gTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGa > 2:2829415/1‑152 (MQ=255) gTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGaa > 1:1171770/1‑191 (MQ=255) gTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGaa < 2:1171770/191‑1 (MQ=255) gTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGa < 1:2245176/236‑1 (MQ=255) gTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACCAAGCGCTCGGCCAGTTTCCCGGGTACCGt > 2:3268172/1‑288 (MQ=255) gTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTTCCAGTTTCTCGGGTACAGTc > 1:1211685/1‑289 (MQ=255) gTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCCGCAAACCAACAAAGCGCCCTGCCAGTTTCCCGGGTACAggc > 2:593708/1‑287 (MQ=255) gTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCCATCGGTCTGGCGATAGTGGGTCACGAGGGACAATGGCTGCACACCAACAAAGCGCTCTGCCATGTTCCCgggcggtc > 2:854876/1‑282 (MQ=255) tgatgaTGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGa < 1:642645/169‑1 (MQ=255) tgatgaTGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTGTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGAGTTAGTGGGCACCGAGGGACa > 1:1116552/1‑241 (MQ=255) atgatgGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa > 2:2575510/1‑214 (MQ=255) atgatgGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTtct > 2:834682/1‑275 (MQ=255) ||| GGGCATTTTTGATATGGGTACTGAGTGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGAGCCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTAGCATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGAGCCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTACAGTCAGG > CP042583/1730641‑1731198 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |