Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,753,697 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,753,697 | 0 | A | T | 99.1% | 818.2 / NA | 342 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (184/155); minor base G (1/2); total (185/157) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.96e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,753,698 | 0 | G | C | 99.7% | 818.0 / NA | 342 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (185/156); total (185/157) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,753,699 | 0 | C | G | 100.0% | 820.2 / NA | 342 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (185/157); total (185/157) |
Only 100 of 342 total aligned reads displayed.
TTACTATGCTCCCGTAAATTCCGATTGGATATCGGCTATGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGAGCTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGAGCTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGAGCCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCAGCGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGTTCTTCCCGTTACTGCTGGCCTA > CP042583/1753419‑1753977 ||| aCTATGCTCCCGTAAATTCCGATTGGATATCGGCTATGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGAtg‑t < 1:2435223/289‑1 (MQ=255) gTAAATTCCGATTGGATATCGGCTATGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATgg < 2:668455/289‑1 (MQ=255) tatCGGCTATGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCAAGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGcgcg < 1:2695185/288‑1 (MQ=255) tGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATgg < 1:308408/264‑1 (MQ=255) tGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTtgtg > 1:2556497/1‑288 (MQ=255) tGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGc < 1:892748/289‑1 (MQ=255) tCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAttgtg > 2:70532/1‑289 (MQ=255) tCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAttgtg > 1:1105717/1‑289 (MQ=255) tCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAttgtg > 1:2089216/1‑289 (MQ=255) tGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTCCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAttgtggt‑t > 1:1765527/1‑289 (MQ=255) ccTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACTTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAttg > 2:427134/1‑277 (MQ=255) ccTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAttgtggt‑tgtgg < 1:66234/286‑1 (MQ=255) ccTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTa > 2:820658/1‑289 (MQ=255) ccTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTa > 1:1050925/1‑289 (MQ=255) ccTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCCTTTAGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCACGATTGCTCAGAAAACATGTCATCATGGCCATGTTTTCGCAGCAAATGTATTTAAACGGTGTTATTAAGTGGTTTTGTCATCGCGTACTTTACATTACCTGTCCTGAAGGGATGAAAAGTTGAAAAAAACAGCAATATTGGCGTTAATAATG‑TTGGTTAAATTGTTTTTCTGGGCCGCGTAGTGTGTGCCA‑TGTGGTGTGTGTTTa > 2:1861768/1‑289 (MQ=255) ggCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAg < 2:2261847/288‑1 (MQ=255) ggTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGgcgc > 2:2134283/1‑237 (MQ=255) ggTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGgcgc < 1:2134283/237‑1 (MQ=255) gTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGgag > 2:1641186/1‑289 (MQ=255) gTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGgag > 1:2620895/1‑289 (MQ=255) gTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGgag > 1:3111100/1‑289 (MQ=255) tACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATgg > 2:1157022/1‑217 (MQ=255) ttttttCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCTGTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTggtcg < 2:3111100/288‑4 (MQ=255) gTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTggtcg < 2:2620895/289‑4 (MQ=255) gTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTggtcg < 2:2697164/289‑4 (MQ=255) ttttCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTggtcgta < 2:889934/289‑6 (MQ=255) cTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGTCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCTGGAGACATGGGCTGGTCGTATGCCTGt > 2:1325693/1‑288 (MQ=255) tGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCTATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCg > 2:3051654/1‑288 (MQ=255) tGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCg > 1:169266/1‑288 (MQ=255) gTTTTTGCAGCGTTTTCTGTGGGCTCGATTCATCAGAAAAAATTTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAATTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTg < 2:193876/289‑1 (MQ=255) gTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCt < 2:2089216/288‑1 (MQ=255) tCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTgtcgc < 1:3255836/289‑5 (MQ=255) gATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGtt < 2:1495287/289‑1 (MQ=255) gATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGtt < 1:374149/289‑1 (MQ=255) tcaGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTTTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTcc < 1:3286157/289‑1 (MQ=255) aGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCtt > 1:2175711/1‑289 (MQ=255) ttCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCaaa < 1:3030631/289‑1 (MQ=255) aCCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTgg < 2:3129097/254‑1 (MQ=255) cAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTggtcg < 1:1038300/203‑4 (MQ=255) aaaGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCt < 2:2175711/288‑1 (MQ=255) tAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTg < 2:169266/289‑1 (MQ=255) ggTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGgcgc < 2:742597/121‑1 (MQ=255) ggTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGgcgc > 1:742597/1‑121 (MQ=255) ggTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGtt > 2:1752639/1‑289 (MQ=255) ggTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGt > 1:3132996/1‑288 (MQ=255) ggTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGt > 2:679337/1‑288 (MQ=255) ggTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAATGCTGGCGGTATTGATGtt > 2:3169141/1‑289 (MQ=255) attattAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTgcgg < 2:2689611/207‑1 (MQ=255) attattAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTAGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGc > 1:1953037/1‑289 (MQ=255) aGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCt < 1:704828/173‑1 (MQ=255) gTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGtt > 1:822878/1‑222 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCt < 1:2577964/171‑1 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCt < 1:2352299/171‑1 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCt > 2:2352299/1‑171 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCt > 2:2577964/1‑171 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcgc > 2:1041281/1‑286 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcgc > 2:3103374/1‑286 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGGTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTCTGACTGTACCGCTATTGCTGCGCTCCTGTCGCCTATTCTGGTTGGCTCCATCACTGCCCGCTTTTCCTCGCCCCATAAAGAGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcgcgcc > 2:616146/1‑288 (MQ=255) aTTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑Tttgttg < 2:3149570/86‑1 (MQ=255) aTTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑Tttgttg > 1:3149570/1‑86 (MQ=255) tCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGt > 1:1748177/1‑289 (MQ=255) aTCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGa < 1:1568789/81‑1 (MQ=255) aTCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCt > 1:1665498/1‑161 (MQ=255) aTCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTa > 2:1054412/1‑259 (MQ=255) gcgTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTggtcg > 1:3162466/1‑160 (MQ=255) gcgTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTc > 1:452718/1‑289 (MQ=255) gcgTACCGTACATTACCTGTCATGAAGGAATGAAAAGATGAAAACAACAGAAAAGCTGTCGTTCATGATG‑GTGGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTGGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTAttt < 2:274711/288‑1 (MQ=255) ccTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcg > 2:2775616/1‑267 (MQ=255) aCATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCaa < 2:1441516/289‑1 (MQ=255) aTTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTggtcg < 2:3039775/152‑4 (MQ=255) ttACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGCCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAg > 1:228182/1‑289 (MQ=255) ccTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGAcc > 1:2725307/1‑289 (MQ=255) ccTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGAcc > 1:2791073/1‑289 (MQ=255) cTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGAcc > 1:1155087/1‑288 (MQ=255) gTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTaaa > 1:2824424/1‑112 (MQ=255) gTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTaaa < 2:2824424/112‑1 (MQ=255) gTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGtt > 1:78636/1‑190 (MQ=255) gTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGAc > 1:1606644/1‑205 (MQ=255) gTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCgctg > 2:2454968/1‑259 (MQ=255) gTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACt > 1:2915335/1‑289 (MQ=255) tCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGAtg‑t > 2:2555811/1‑52 (MQ=255) tCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTgtc < 2:3250925/176‑3 (MQ=255) cATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACtt > 1:2037434/1‑289 (MQ=255) cATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGctgctg > 1:1906937/1‑260 (MQ=255) aGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGAt > 1:1368390/1‑236 (MQ=255) aTTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcgcgc < 1:2491460/246‑1 (MQ=255) aTTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcgcg > 2:2863608/1‑245 (MQ=255) aTTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcgcg < 1:2863608/245‑1 (MQ=255) aTTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGtt < 1:1459262/289‑1 (MQ=255) aTTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGATAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATACTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGTCGCGCGGCTGATGTATTTCGCTTCACAACAGCCCACTTTTCCCGGGt > 2:2053440/1‑288 (MQ=255) ttAAAAGATGAAGACAACGGCAATGCTGTCGTTCATGTGGTTTTGTTGAATGGTTTATCGGGGGGGTGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTTGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGtt < 2:2037434/289‑1 (MQ=255) aaaaGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGttctt < 2:3315261/289‑1 (MQ=255) aTGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAt > 1:1010159/1‑73 (MQ=255) aTGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAt < 2:1010159/73‑1 (MQ=255) tGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAgg > 1:1208737/1‑232 (MQ=255) tGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAgg < 2:1208737/232‑1 (MQ=255) tGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGTTCTTCCCGt < 2:1543707/288‑1 (MQ=255) caGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGtt > 1:678279/1‑161 (MQ=255) caGCAAAGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGTTCTTCCCGTTACTGCTgg > 2:2487486/1‑288 (MQ=255) aaaGCTGTCGTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGTTCTTCCCGTTACTGCTGGCCTa < 2:1603036/288‑1 (MQ=255) ||| TTACTATGCTCCCGTAAATTCCGATTGGATATCGGCTATGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGAGCTTCATGATG‑TTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGT‑TGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGAGCTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGAGCCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCAGCGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGTTCTTCCCGTTACTGCTGGCCTA > CP042583/1753419‑1753977 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |