| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,765,541 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,765,541 | 0 | A | T | 99.7% | 854.1 / NA | 355 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (184/170); minor base G (1/0); total (185/170) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,765,542 | 0 | C | G | 99.7% | 854.5 / NA | 355 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (184/170); minor base T (1/0); total (185/170) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,765,543 | 0 | T | A | 99.7% | 855.1 / NA | 355 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (184/170); minor base C (1/0); total (185/170) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 355 total aligned reads displayed.
CATATGTACTCTTGTTATTACCGCTCGCTTTATAGTCGCTGTAATACTGACTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTACTTAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCACTTGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACT > CP042583/1765261‑1765822 ||| cATATGTACTCTTGTTATTACCCGACGCTTTATAGTCGCTGTAATACAGACTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCAACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACa > 1:2553452/1‑289 (MQ=255) gTACTCTTGTTATTACCCGACGCTTTATAGTCGCTGTAATACTGACTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGtt > 1:579851/1‑288 (MQ=255) ctctTGTTATTACCCGACGCTTTATAGTCGCTGTAATACTGACTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCtt > 1:662340/1‑289 (MQ=255) gTTATTACCCGACGCTTTATAGTCGCTGTAATACTGACTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCggg > 1:1904179/1‑289 (MQ=255) ccctacgctTTATAGACGCTTTAATAATGACTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAGTACCCCGCTCCCAGTTTTCAGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCtt < 2:1335181/284‑1 (MQ=255) cgctTTATAGTCGCTGTAATACTGACTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTACTGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATTATTCTTGCGGTTTGTCTTCaaaa > 2:1375673/1‑287 (MQ=255) tCGCTGTAATACTGACTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCat > 2:219570/1‑289 (MQ=255) gCTGTAATACTGACTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACaataat < 2:1169363/282‑1 (MQ=255) gCTGTAATACTGACTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCatat > 1:602217/1‑289 (MQ=255) cTGTAATACTGACTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATAtt > 1:2895469/1‑289 (MQ=255) aaTACTGACTCAGCTAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGGTATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTcc < 2:1466672/288‑1 (MQ=255) aCTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCAt > 2:943647/1‑289 (MQ=255) aCTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCAt > 1:1018015/1‑289 (MQ=255) aCTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCAt > 2:107986/1‑289 (MQ=255) cTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATAACCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCAtt < 1:2101236/289‑1 (MQ=255) ggTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATaa > 1:2482501/1‑289 (MQ=255) gTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACaataat > 2:502864/1‑254 (MQ=255) taAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAatat < 2:2044482/289‑1 (MQ=255) cGCATTAATCCCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCGCTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATg < 1:2206748/289‑1 (MQ=255) tAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATa > 2:3069241/1‑289 (MQ=255) tACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACt > 1:366408/1‑288 (MQ=255) ccccGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGcc < 2:2482501/289‑1 (MQ=255) cccGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCa < 2:1297435/253‑1 (MQ=255) cGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACaataat < 1:2045303/233‑1 (MQ=255) cGCTCCCAGCTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGCGACGAAAAACCCCGACATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAACTGTTACACATTGCTTACCGCTGCCGACGTTATCGCTATGACTGCCTAACCGCTTGATAACTTCCCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGCCTTTAACAATCATCTCATATTTCCCGCGCCTTTCCTTATTGACCTAATCATCCATCGCATACTGcccat > 2:1602381/1‑287 (MQ=255) cTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGAc > 2:3123381/1‑261 (MQ=255) cTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAatat > 1:92350/1‑269 (MQ=255) aGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAggg > 1:1370204/1‑289 (MQ=255) tttCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAggg < 1:852566/286‑1 (MQ=255) tttCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGt < 1:107986/287‑1 (MQ=255) aGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGt > 1:1855051/1‑266 (MQ=255) cTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCcgcg < 1:994148/218‑1 (MQ=255) tCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATAttt > 1:1746762/1‑288 (MQ=255) ttcttcCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTatcat < 2:850179/269‑1 (MQ=255) ccACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAatat < 1:397973/228‑1 (MQ=255) gCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCggg < 1:291406/165‑1 (MQ=255) gCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAatat > 1:3104746/1‑220 (MQ=255) cTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGATTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCAtt < 1:1596331/289‑1 (MQ=255) ttcGGGACACGGAAATCGAGACGAAAACCCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTc < 2:2208753/287‑1 (MQ=255) cGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAatat > 1:1313864/1‑215 (MQ=255) gggACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCAc < 2:366408/289‑1 (MQ=255) acacTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTa < 2:672304/289‑1 (MQ=255) cacTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTAt < 2:2724124/289‑1 (MQ=255) gagaCGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATgg < 1:668600/289‑1 (MQ=255) aCGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTg > 1:3270991/1‑145 (MQ=255) atatCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCTCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCgg < 1:3314076/203‑1 (MQ=255) cccAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTatcatc < 2:1609678/217‑1 (MQ=255) aGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCt < 1:2576710/110‑1 (MQ=255) aGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCt > 2:2576710/1‑110 (MQ=255) aGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAatat > 2:901996/1‑171 (MQ=255) cTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACAGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGGCATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCtt < 2:2753274/289‑1 (MQ=255) ccACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTa > 1:2615775/1‑153 (MQ=255) cACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCttt > 2:2699085/1‑232 (MQ=255) aCCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATg > 2:2911950/1‑169 (MQ=255) aCCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCa > 2:3156545/1‑217 (MQ=255) aCCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCa < 1:3156545/217‑1 (MQ=255) aCCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATaaa < 2:455963/249‑1 (MQ=255) aCCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAAt > 2:1866544/1‑288 (MQ=255) aCCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAAt > 1:2774344/1‑288 (MQ=255) gAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACaataat < 2:3190807/121‑1 (MQ=255) gAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACaataat > 1:3190807/1‑121 (MQ=255) gAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCAc < 1:2342281/234‑1 (MQ=255) gAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCAc > 2:2342281/1‑234 (MQ=255) aaCAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCg > 2:74071/1‑160 (MQ=255) aaCAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGc > 2:631933/1‑289 (MQ=255) aaGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCTAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAAt < 2:2553452/289‑1 (MQ=255) gTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTatcatc > 2:3033787/1‑190 (MQ=255) ttGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAAc > 2:2378634/1‑289 (MQ=255) aTGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCa < 2:548908/239‑1 (MQ=255) aaaCATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCggg < 1:2752873/84‑1 (MQ=255) gCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAatat < 2:3294398/132‑1 (MQ=255) cTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGt > 1:1184074/1‑289 (MQ=255) aCCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGctga < 1:1271485/279‑4 (MQ=255) cGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCTGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAg > 1:2808393/1‑224 (MQ=255) cGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGaa > 2:588527/1‑171 (MQ=255) cGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCa < 2:2001059/179‑1 (MQ=255) cGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCa > 1:3020353/1‑179 (MQ=255) cGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTttctt < 1:2012159/231‑1 (MQ=255) tGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCAc > 2:2660750/1‑198 (MQ=255) tGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCAc < 1:2660750/198‑1 (MQ=255) gCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCAtt > 1:3065509/1‑288 (MQ=255) gCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCAt > 2:1955619/1‑287 (MQ=255) gCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCAt > 1:735132/1‑287 (MQ=255) ttAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCtt < 2:2781306/172‑1 (MQ=255) tAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAAt > 2:2770810/1‑289 (MQ=255) tAACCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTAAACATAGTCAGCCCCTGCAAt > 2:2980455/1‑289 (MQ=255) aaCCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAAtt > 2:3324981/1‑289 (MQ=255) aCCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGcc > 1:531113/1‑111 (MQ=255) aCCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCt > 2:2862270/1‑173 (MQ=255) aCCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCt < 1:1491930/206‑1 (MQ=255) aCCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCa < 2:635338/209‑1 (MQ=255) aCCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTgggg < 1:1978589/258‑1 (MQ=255) aCCGCTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTACTGCAATTa > 1:782961/1‑289 (MQ=255) cTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAAtt > 2:1583313/1‑289 (MQ=255) cTTGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAAtt > 2:1264181/1‑289 (MQ=255) tGATAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGaa > 1:2365387/1‑135 (MQ=255) aTAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGt < 1:2716414/289‑1 (MQ=255) tAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGt < 2:3265418/288‑1 (MQ=255) tAACTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGt < 1:219570/288‑1 (MQ=255) aCTTCTCTTGATAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCAc < 2:1904179/289‑1 (MQ=255) ||| CATATGTACTCTTGTTATTACCGCTCGCTTTATAGTCGCTGTAATACTGACTCAGATAATAAGAGGTATAAAACGCATTAATACCCCGCTCCCAGTTTTCCGGTGGAACATAGCCACTTTCCAGTTCTTCCACCCAGGCCTGCGGGACACTGAAATCGAGACGAAAAACCCCGATATCCCAGGTATAGCTCCCACCCTGAACAAGTTGCTCAAATGTTAAACATTGCTTACCGCTGGCGAAGTTATCGCTATTAATGCCTAACCGCTTGATAACTTCTCTACTTAAACATGTTTCTTGCGGGTTGTCTTTAACAATAATCTCATATTTCCCGCGCCATTGCTTATTGACATAAATATCGATGTCATACTGCCCCGGTAAGGGTTGATTATCATCAAGACGAATATTTGCAACCTGCTGGTCTTTCATTCCACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCACTTGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACT > CP042583/1765261‑1765822 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |