| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 1,765,982 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 1,765,983 | 0 | C | G | 100.0% | 754.9 / NA | 313 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (162/151); total (162/151) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,765,984 | 0 | T | A | 100.0% | 755.4 / NA | 313 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (162/151); total (162/151) | |||||||||||
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
AATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCACTTGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTAATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACTTTGACATTATTAGCTTTGACATCGCTAATCGTCACCCAATTAGCACTGTCATTTTTTATCACCAAACCATTGCCACTGCGATTTACCAGCAATTTTTTAAATGTCGCTTTATTTACCGGAGCAATACCCGCTGGCCGGTAAAACAACTTAATTCTGTTTTGCATCGCAAACTTCAGTGCATTCTTACCTTCTTGCTCTGGACTATTTGGTGGAATATCCAGAACATTCAGATAAAAAATGCTTTCTTTATTAGTGGGCAGTTTATTCGGCATAATTTTGATTTTTACTTGCTGCCCGGAATTTGCCCCTATTTTTGCCACTGGT > CP042583/1765702‑1766261 ||| ggTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTAATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACTTTGACATTATTAGCTTTGACATCCGAAATCGTCACCCAATTAGCTGAGTCAtttttt > 2:613412/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |