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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,805,879 | 0 | C | G | 99.8% | 1074.6 / NA | 450 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (216/232); total (217/233) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.83e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 450 total aligned reads displayed.
TATGCAGGCATTTTCATTGCTTCCCTGCTACCGGTAACCATTCCGGGCAGCATCATCGGGATGCTGATCCTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGATTCGCTATATGGCGCTATTGTTTGTGCCGATTGGCGTAGGCGTCATGCAATATTTTGATTTGCTCCGCGCACAGTTTGGCCCGGTAGTGGTTTCCTGTGCAGTCAGTACGCTGGTGGTTTTTCTGGTGGTGAGCTGGAGTAGCCAACTGGTACACGGTGAACGTAAAGTCGTAGGTCAGAAAGGAAGTGAAGAATGATGGCGAATATCTGGTGGAGTTTACCGCTGACATTGATTGTCTTTTTTGCCGCCCGCAAACTGGCGGCACGGTATAAGTTTCCCTTGCTTAACCCGTTGCTGGTAGCAATGGTGGTGATCATTCCTTTTTTAATGCTGACTGGCATCTCTTACGACAGCTACTTTAAAGGTAGCGAAGTGCTAAACGATCTGCTGCAACCGGCGGTCGTCGCGCTGGCCTATCC > CP042583/1805601‑1806156 ||| gCATTTTCATTGCTTCCCTGCTACCGGTAACCATTCCGGGCAGCATCATCGGGATGCTGATCCTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGATTCGCTATATGGCGCTATTGTTTGTGCCGATTGGCGTAGGCGTCATGCAATATTTTGATTTGCTCCGCGCACAGTTTGGCCCGGTAGTGGTTTCCTGTGCAGTCAGTACGCTGGTGGTTTTTCTGGTGGTGAGCTGGAGTTCGCAACTGGTa > 1:1608488/1‑281 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |