Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,819,348 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,819,348 | 0 | A | T | 99.7% | 938.3 / NA | 389 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 1,819,349 | 0 | G | C | 100.0% | 933.9 / NA | 389 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 1,819,350 | 0 | C | G | 100.0% | 938.9 / NA | 389 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (203/186); total (203/186) |
Only 100 of 389 total aligned reads displayed.
TTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGAGCCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACAGTATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTAGCGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCG‑CCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCTGCGTATTCAGCCGGGATATGATCACAGTTACT > CP042583/1819073‑1819627 ||| gTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGa > 1:1216642/1‑289 (MQ=255) ggacgggACACCAGCCGGCGCGGCGAAAAGGTTTCCAACGCCGCTGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCGTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAAt < 2:953100/282‑1 (MQ=255) cacCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGc < 2:550063/289‑1 (MQ=255) cAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTagc < 2:2642539/289‑1 (MQ=255) tACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCCGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGt < 2:2783862/288‑1 (MQ=255) aGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCTGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGATTCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACaaa > 2:1572371/1‑289 (MQ=255) ggCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTTGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCAt > 1:1254717/1‑289 (MQ=255) 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atAACGCCACCCCATCGCCGGGGGCGACGCATTACCGGAGTTATGTTTATCTGCGCGATGACTTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAg < 2:1955042/288‑1 (MQ=255) tAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGcc > 2:117213/1‑198 (MQ=255) tAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTagcag < 2:1363343/246‑1 (MQ=255) tAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGt > 1:2676410/1‑289 (MQ=255) aCGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGGAc > 1:1955042/1‑289 (MQ=255) aCGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCAc < 1:1040853/289‑1 (MQ=255) aCGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCAc < 1:2873595/289‑1 (MQ=255) aCGAAACGGCCGGGGGGGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGGGGGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCAc < 2:3215794/289‑1 (MQ=255) cGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGttt > 1:1087342/1‑233 (MQ=255) 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CP042583/1819073‑1819627 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |