| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,842,823 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,842,823 | 0 | A | T | 100.0% | 798.9 / NA | 332 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (166/166); total (166/166) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,842,824 | 0 | G | C | 99.4% | 785.4 / ‑6.5 | 332 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base C (166/163); minor base T (0/2); total (166/166) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,842,825 | 0 | C | G | 100.0% | 792.5 / NA | 332 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (166/166); total (166/166) | |||||||||||
Only 100 of 332 total aligned reads displayed.
GGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGAGCATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCGATCTGTTAACCGCACCAGTCTATGAA > CP042583/1842544‑1843104 ||| ggTGATGATCGTCCACATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACACGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGAttcttc < 2:250068/289‑1 (MQ=255) agctgcacgatacaccGCATATTGTTCAGACCATCGAACAAGCCCGGCAACTATGCGTACAGTCCGGCGCACGTCAGGCCCTATTAAACACCCTCAAAGTTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCAGATAAAGCGCACCTTCGTCCGCACTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTTACGCTAAGTTAACTCACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGCCCATCCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAGAACCACGTCGATTCTTCATCTGtt < 2:697392/275‑1 (MQ=255) tCTGCCCGATAACCCGCATTTTGGGCAGGCCAGCGAACAAGACTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGtt < 2:3137985/288‑1 (MQ=255) aaCCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAg > 2:1843550/1‑289 (MQ=255) cATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCACTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCa > 1:2537637/1‑289 (MQ=255) ccATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCTTCCAATCCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATggg < 2:1313232/288‑1 (MQ=255) ccATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATggg < 2:1531328/288‑1 (MQ=255) cGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTa < 1:1843550/289‑1 (MQ=255) aaGCCTTGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGtt < 2:1782856/250‑1 (MQ=255) cgcACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGt < 2:2308498/279‑1 (MQ=255) cgcACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGt > 1:2308498/1‑279 (MQ=255) gcgcTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATg < 2:2740832/239‑1 (MQ=255) ccTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGAttcttc > 2:3049806/1‑191 (MQ=255) ccTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTc > 1:1269430/1‑256 (MQ=255) ccTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCTGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAgcggc > 2:2863785/1‑289 (MQ=255) ccTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAgcggc > 2:3300857/1‑289 (MQ=255) ccTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAgcggc > 1:1611583/1‑289 (MQ=255) ccTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAgcggc > 1:1552852/1‑289 (MQ=255) ccTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAgcggc > 2:1352617/1‑289 (MQ=255) ccTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGAGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAgcggc > 1:2474495/1‑289 (MQ=255) tCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGtt < 1:2121390/196‑1 (MQ=255) tCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGtt > 2:2121390/1‑196 (MQ=255) tCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTTCTTTGCTCGCCGATAGCGgcgc > 1:3236399/1‑289 (MQ=255) aCGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTAGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGaaa < 2:407229/289‑1 (MQ=255) tCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGAt > 1:2433838/1‑288 (MQ=255) tGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATccc < 1:1369181/289‑1 (MQ=255) tAAAGCTGATGAAGCCCACTTTCTTCCGCCCTGCCCTTCTCTTTTCTGCGATTTTTAGGCCGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGCGTATTGAGGAGCCGTTGTGACCCGGTCCAACCTCGTCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAGCGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAAGGAAGTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCcggcg < 2:1635732/288‑1 (MQ=255) tAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCcggcg < 1:470028/288‑1 (MQ=255) aGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGtgct < 2:1596355/288‑1 (MQ=255) tCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGttt > 2:3269576/1‑289 (MQ=255) ccGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTa < 1:2029042/289‑1 (MQ=255) ctctCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGa < 1:1748572/198‑1 (MQ=255) tctcCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCTGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGACTTTGGGGAAGTCGGAATTGATGCTGACTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCAGTGGCTGCGTTAATGGCTTACCCa > 2:2578988/1‑289 (MQ=255) tctcCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCcg > 1:32817/1‑256 (MQ=255) ctcCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCGGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACAACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCAt < 1:1105396/289‑1 (MQ=255) tcCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCAt > 2:753959/1‑288 (MQ=255) tcCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATg > 2:2367855/1‑289 (MQ=255) cccTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCa > 1:1048872/1‑289 (MQ=255) cccTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCa > 1:1440874/1‑289 (MQ=255) cTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAgg < 1:849712/289‑1 (MQ=255) tctcTTTTCTGCCTTTTTTCGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTa < 2:2080349/289‑1 (MQ=255) ttCTGCCTTTTTTAGCTAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTTCTCGCCGATTGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCTTTAATGGTTGCACCATGCTGGTCCGGttt > 2:1162987/1‑288 (MQ=255) ttCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTg > 1:2720265/1‑289 (MQ=255) ttCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTg > 1:3049732/1‑289 (MQ=255) tCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGa < 2:488502/289‑1 (MQ=255) tGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCTGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAAt < 1:2863785/289‑1 (MQ=255) tttAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTAc < 2:1945516/289‑1 (MQ=255) gATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGt < 2:824452/143‑1 (MQ=255) gATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAgg > 1:739770/1‑289 (MQ=255) cAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATggg < 2:6169/129‑1 (MQ=255) cAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTa > 2:2202671/1‑134 (MQ=255) cAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGa > 1:337068/1‑201 (MQ=255) cAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAg > 2:2466939/1‑288 (MQ=255) cAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAg > 1:316327/1‑288 (MQ=255) tACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCttgtt > 1:2061281/1‑289 (MQ=255) tACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCttgtt > 1:1945654/1‑289 (MQ=255) ccAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGgcgc < 1:614589/182‑1 (MQ=255) ccAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGgcgc < 2:895358/182‑1 (MQ=255) ccAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTa > 2:2817350/1‑243 (MQ=255) ccAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCACATACAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCGGAAAGAGACCCCTGTCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGATTACCCATGCAGGGAGGGCTGAATACCGTACTGCGTCAGGGAACACACGACTGCTTGTTGa > 2:2647196/1‑289 (MQ=255) agagTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGtgc > 1:1143765/1‑214 (MQ=255) tATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGtt < 2:1728562/83‑1 (MQ=255) tGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTCGGGTTGAAACCCTTACTGCGTCAGGGCAAACCAGACCACGTGTTGAAAGAGCCg > 2:121796/1‑288 (MQ=255) tGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTTCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTGCTTGATAAAGcag > 2:2184814/1‑286 (MQ=255) aGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGt > 1:2417720/1‑74 (MQ=255) aGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGt < 2:2417720/74‑1 (MQ=255) aGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTa > 2:1406302/1‑229 (MQ=255) aGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCtt < 1:1474227/270‑1 (MQ=255) aGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCggg > 1:2266457/1‑289 (MQ=255) ccGTTGTGACCTGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGt > 1:308012/1‑130 (MQ=255) ccGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCAt < 1:897277/220‑1 (MQ=255) ccGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCgg > 1:2608566/1‑286 (MQ=255) ccGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGACAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCgg > 1:798030/1‑286 (MQ=255) gTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGGTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTgg > 1:95996/1‑289 (MQ=255) tgtgACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTggg < 1:2014990/288‑1 (MQ=255) tgtgACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTggg < 2:2954343/288‑1 (MQ=255) gtgACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACTGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGcc < 1:2367855/289‑1 (MQ=255) gtgACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGa > 2:925121/1‑277 (MQ=255) ccAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATcc < 1:372041/289‑1 (MQ=255) cAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGc < 1:277543/140‑1 (MQ=255) gACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAACCCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGtt < 2:1115169/193‑1 (MQ=255) gACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGGTGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAgg > 2:1877158/1‑212 (MQ=255) gACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGc > 1:1003843/1‑181 (MQ=255) gACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGc < 2:1003843/181‑1 (MQ=255) aaCCTCATCACCGATTTTTCCGGAAGCGGAAAAACCCAGTGGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGa < 2:1059256/289‑1 (MQ=255) aCCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTa > 1:563609/1‑209 (MQ=255) aCCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTa < 2:563609/209‑1 (MQ=255) ccTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTc > 1:690972/1‑133 (MQ=255) catcaCGGTGTTTCTCGGCAGACGGAAATCCACGTCGATTCTTCATTTGTTAGCCCAAGAAGATCCCAACGAAAAGTGAGCGGTACTGGTTAATGGATATAGGGAAGTCGGAATTGGTGGTGGTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCCGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCAAGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCCGGGAAAACCAGACCGATTGTTGTTAGGGCCGACCGGGCTGGGCCATTCGAAACAGATCCTc < 2:1662820/289‑1 (MQ=255) atcaCCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGtgct < 2:2046484/178‑1 (MQ=255) atcaCCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg > 1:2845125/1‑289 (MQ=255) atcaCCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg > 1:2094948/1‑289 (MQ=255) atcaCCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg > 1:815751/1‑289 (MQ=255) atcaCCGGGTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCCCg > 2:320702/1‑289 (MQ=255) gTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATagag < 2:2018823/248‑1 (MQ=255) cGGCAGCGGGAAAGCCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGCTCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCGATCTGTTAACCGCa < 1:2647196/289‑1 (MQ=255) cAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCGATCTGTTAACCGCAcc < 1:1875422/288‑1 (MQ=255) ggAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGAc < 1:2198772/218‑1 (MQ=255) ggAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGa < 1:1661738/237‑1 (MQ=255) aaCCACGTCGATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCGATCTGTTAACCGCACCAGTCTATGaa < 1:1352617/289‑1 (MQ=255) ||| GGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGAGCATTCTTCATCTGTTAGCCCATAAAGATCCCAACGAAAAATGGGCGGTACTGGTTAATGAATTTGGGGAAGTCGGAATTGATGGTGCTTTGCTCGCCGATAGCGGCGCATTGCTGAAAGAGATCCCCGGCGGCTGCATGTGCTGCGTTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCGATCTGTTAACCGCACCAGTCTATGAA > CP042583/1842544‑1843104 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |