| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 1,954,418 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (197/211); total (197/211) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,954,420 | 0 | C | G | 99.8% | 975.4 / NA | 408 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (196/210); minor base A (0/1); total (197/211) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 408 total aligned reads displayed.
CTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTAAGCATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAAAGTCATGATAGTGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTAGCAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGAGCCTTAGTAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCAAGTTGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACA > CP042583/1954148‑1954692 ||| taataTTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCtttt > 2:2248182/1‑285 (MQ=255) taataTTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAat < 2:293158/289‑1 (MQ=255) tttagTTAGGGTATGATAAATTTTGGAAAGAAGCTTAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATTAGACCATATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAAGCGGGCAAATATCGCAACCAACTCCCCCCTCGAAGCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGAGCATTATCGGTGATGAAATTCCTCTGATATCTGAAAAACAGTCGCGTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga < 2:2731868/285‑1 (MQ=255) cGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCACAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATTAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGaa > 2:2345121/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |