Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,954,769 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,954,770 | 0 | G | C | 100.0% | 182.5 / NA | 78 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (34/44); total (34/44) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,954,771 | 0 | T | A | 100.0% | 184.0 / NA | 78 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (34/44); total (34/44) |
CGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCAAGTTGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTAGCCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAACAGTTTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATAGTCTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGAGCAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACATGCCGATCTTCAGCAATACTTAAGCCAAAGTTGCGGTGCATTTGTGTGCATGGCAGCCCAGGAAGTGATTGAACAAAGGGAAAGCAATTCTGACAGCGCCCCCTATACGT > CP042583/1954490‑1955015 ||| cGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGAGCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTAACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCAGCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAACTCATTGCGTg < 1:2298446/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |