Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,979,665 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,979,665 | 0 | A | T | 99.8% | 964.1 / ‑6.0 | 401 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (196/204); minor base C (1/0); total (197/204) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,979,666 | 0 | G | C | 99.2% | 956.5 / NA | 401 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (195/203); minor base A (2/1); total (197/204) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.18e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,979,667 | 0 | T | A | 99.8% | 964.6 / NA | 401 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (196/204); minor base C (1/0); total (197/204) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 401 total aligned reads displayed.
CAACCGGCGCGGTATATTCCAAAGAGCTTTTAATGGAGATTGTGGAGATTGCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACAGTATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGAGCAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTAGTATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCAAACGCTTTAACATTCACGACGATCAGAAAATGGTGTTGGATTTCCTGTTGCAGGAAAAAGTTCTGTTGGTGCAAGGG > CP042583/1979387‑1979946 ||| cAACCGGCGCGGTATATTCCAAAGAGCTTTTAATGGAGATTGTGGAGATTGCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCt < 1:293575/289‑1 (MQ=255) aCCGGCGCGGTATATTCCAAAGAGCTTTTAATGGAGATTGTGGAGATTGCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCAAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCtgt > 2:2784755/1‑289 (MQ=255) ccGGCGCGGTATATTCCAAAGAGCTTTTAATGGAGATTGTGGAGATTGCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCt > 1:3285516/1‑286 (MQ=255) agagCTTTTAATGGAGATTGTGGAGATTGCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGAGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCaa > 1:2146435/1‑289 (MQ=255) agagCTTTTAATGGAGATTGTGGAGATTGCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCG‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCTTGCGCaa > 2:1809822/1‑289 (MQ=255) gCTTTTAATGGAGATTGTGGAGATTGCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAac < 1:2316180/287‑1 (MQ=255) cTTTTAATGGAGATTGTGGAGATTGCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGGAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAacac < 1:1396221/288‑1 (MQ=255) cTTTTAATGGAGATTGTGGAGATTGCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGAGCTGGTGTGCTACCGTTCCTGCGCAacac > 2:1837754/1‑288 (MQ=255) ttttAATGGAGATTGTGGAGATTGCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACg > 1:1144863/1‑288 (MQ=255) agattgtggagattgCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGa < 2:3304024/288‑1 (MQ=255) ggtgatttCACGTCATCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTTGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCt < 2:2146435/285‑1 (MQ=255) ggggatggcaactCAGCATAATCTCATTATTGTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTCCGACGACGCTGAGCATCACTCAGTTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCt < 2:3093719/276‑1 (MQ=255) ttgCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑Aggtg < 1:1248533/288‑1 (MQ=255) gCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACg < 2:1165713/265‑1 (MQ=255) aCGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGCCGAAAACGTACCGCCTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAAGCTACCTCGAAGGGCCGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCATTGTTCTAACGTTCATCCGCAACAACCCACTCAG‑CCCCGCTCAGGGGGTTa > 2:4300/1‑288 (MQ=255) gTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTgcg < 1:1878484/254‑1 (MQ=255) aGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCaga > 1:2579872/1‑288 (MQ=255) tcATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGa < 2:597178/289‑1 (MQ=255) cATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGaa < 1:1010361/289‑1 (MQ=255) ttATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGcc > 2:1883414/1‑219 (MQ=255) ttCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTgcg < 2:1151183/234‑1 (MQ=255) ttCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCAtt < 1:670592/246‑1 (MQ=255) ttCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCAtt > 2:670592/1‑246 (MQ=255) cGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGAT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCa < 1:1155626/234‑1 (MQ=255) tGAAATTTATGACAATACTCTCTACTACGACGCTGAGAATCACTCAATTGCTCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGTACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGAAGGCCTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTTAACGGGCCGACAAACCACGCCAAAGGCTACATCGAAAGCTTGGAAATGCTAGACTCAATTGACCCTG‑CTGCCAACGTTCCTTGGCAACACGCCAATCAGACCGCGCT‑AGGTCGTTAGCAGAGCCTCAGTGACTTTCTTATCCCttg > 2:3052585/1‑286 (MQ=255) tGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCt < 2:1500850/240‑1 (MQ=255) aaaaTTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATg < 2:2894975/289‑1 (MQ=255) aaTTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGa > 2:2858305/1‑288 (MQ=255) tACGACGACGCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTgcg < 1:2052112/204‑1 (MQ=255) cgccgCTGTGCATCACTCACTTGCGCCGCTGGCCCCTGACCTGCTGACCATTCCCTTTACCGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACcg < 2:540468/285‑1 (MQ=255) cgacgCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGTCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACcg < 1:721462/288‑1 (MQ=255) cgacgCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACcg < 1:651099/288‑1 (MQ=255) cgCTGAGCATCACTCAATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACcgcgcg > 1:24555/1‑289 (MQ=255) atcactcaaTTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGaa < 1:2771279/279‑1 (MQ=255) cactcaaTTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAacac < 2:3205139/186‑1 (MQ=255) cactcaaTTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAacac > 1:3205139/7‑192 (MQ=255) actcaaTTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCt > 1:907920/6‑208 (MQ=255) actcaaTTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCACAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑Ag > 1:2877033/6‑210 (MQ=255) actaaaTTGCGCCGATGGGACCTGACCTGCTGGCCAGTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGGGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGAt < 2:895791/284‑1 (MQ=255) ccgcTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCa > 1:2179205/1‑176 (MQ=255) ccgcTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGaa < 1:1302188/273‑1 (MQ=255) ccgcTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGaa > 2:1302188/1‑273 (MQ=255) cgcTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑Ag > 2:2215661/1‑198 (MQ=255) gctgACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTg < 1:2690051/289‑1 (MQ=255) ctgACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATg < 2:803204/232‑1 (MQ=255) ctgACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACATACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAacac > 1:467790/1‑162 (MQ=255) tgACCATTACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGaa < 1:1555721/289‑1 (MQ=255) ttACCTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGag > 2:2074899/1‑227 (MQ=255) ccTTTAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATg < 2:3255693/222‑1 (MQ=255) tttAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCgtggtg < 1:827957/289‑1 (MQ=255) tttAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCgtggtg < 1:2431496/289‑1 (MQ=255) tttAACGGACTGTAGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGGGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACCCGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCgtggtg < 2:2319120/289‑1 (MQ=255) tttAACGGACTGGCGAAAACGTACCGGGTTGCAGGCTTCCGTGAGGGGTGGGTGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACAGCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCgtggtg < 2:2745271/289‑1 (MQ=255) tttAACGGACTGGCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGGCAGGGGTGGCTGGTGTTGAACGGGCAGAAAAAACACGCCAAATGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCACTGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCgtggtg < 2:365144/289‑1 (MQ=255) ttAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑Ag < 2:1694232/168‑1 (MQ=255) tAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGt < 2:1588948/236‑1 (MQ=255) tAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTgcg < 1:1660285/289‑1 (MQ=255) tAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTgcg < 2:2183641/289‑1 (MQ=255) tAACGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTgcg < 1:1831875/289‑1 (MQ=255) aaCGGACTGTCGAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑Aggtgg > 2:1667636/1‑170 (MQ=255) actgtcgaaaaCGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCt < 2:1412331/152‑1 (MQ=255) actgtcgaaaaCGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATg > 2:340553/8‑212 (MQ=255) ctgtcgaaaaCGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGtata > 1:2823069/7‑289 (MQ=255) tcgaaaaCGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCgg > 2:2381791/4‑197 (MQ=255) aaCGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGgt > 1:1544612/1‑193 (MQ=255) aCCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGTTGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTgcg < 1:555649/269‑1 (MQ=255) aCCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCt > 1:1066627/1‑271 (MQ=255) cgcgTTGCAGGCGTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCg < 1:2276769/289‑1 (MQ=255) gCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGa > 1:2214201/1‑130 (MQ=255) ggCTTCCGTCCGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCaaa < 1:2656280/288‑1 (MQ=255) cTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCaaa < 1:1604203/286‑1 (MQ=255) ccGTCGGGAGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAACACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCAAACGCttt < 2:24555/289‑1 (MQ=255) ccGTCATTGATGGATGTTGTTGAACGGTCCAAAAAAACACGCCAAACGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCCCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCAAACGCttt < 1:2529008/289‑1 (MQ=255) cGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGaa < 2:509964/204‑1 (MQ=255) ggggTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGag > 1:345699/1‑178 (MQ=255) tgtTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGt < 1:416577/183‑1 (MQ=255) tgtTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATGCAGACAGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGTCGGTGGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGtatct > 1:1767604/1‑242 (MQ=255) ttGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCAAACGCTTTAAAATTCACGACGATCAGa > 1:2123613/1‑289 (MQ=255) aaCAGGCCAAAAAAAAACGCCAAAAGTTAAATTGAAGGTCTGGAGATGCT‑GGCTTCAATGCGCCGGTTTGCTAACTTTCCTGCGAAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCAAACGCTTTAACATTCACGACGATCAGaaaa < 2:2977180/289‑1 (MQ=255) cGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCAAACGCTTTAACATTCACGACGATCAGAAAATg > 1:3129006/1‑289 (MQ=255) gCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGGCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCAAACGCTTTAACATTCACGACGATCAGAAAATGgtg > 1:1686441/1‑289 (MQ=255) gCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTg < 2:988711/77‑1 (MQ=255) gCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGaa > 1:1997801/1‑127 (MQ=255) gCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTCTTTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCgtggtg < 1:3312240/225‑1 (MQ=255) gCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATg < 2:2002735/155‑1 (MQ=255) gCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACcgcgcg < 2:686692/172‑1 (MQ=255) gCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGt < 2:1464819/173‑1 (MQ=255) gCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGt > 1:1464819/1‑173 (MQ=255) gCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCgtggtg > 1:3067575/1‑224 (MQ=255) gCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTgcg > 1:2508559/1‑226 (MQ=255) gCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTgcg < 2:2508559/226‑1 (MQ=255) gCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGa < 1:992512/249‑1 (MQ=255) ttACATCGGAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGGGCCTGGGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGGCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCAAACGCTTTAACATTCACGACGATCAGAAAATGGTGTTGGATTTCCTGTTGCAGGa < 2:2555688/287‑1 (MQ=255) aGGTCTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACcg < 2:2623133/138‑1 (MQ=255) cTGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCAAACGCTTTAACATTCACGACGATCAGAAAATGGTGTTGGATTTCCTGTTGCAGGAAAAAGTTCTGTTgg > 1:976037/1‑289 (MQ=255) tGGAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGCC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGAt > 1:1494543/1‑148 (MQ=255) gAAATGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACcg < 2:911298/131‑1 (MQ=255) actGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAAAACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCAAACGCTTTAACATTCACGACGATCAGAAAATGGTGTTGGATTTCCTGTTGCAGGAAAAAGTTCTGTTGGTGCa < 2:2306441/286‑1 (MQ=255) aaTGCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCAAACGCTTTAACATTCACGACGATCAGAAAATGGTGTTGGATTTCCTGTTGCAGGAAAAAGTTCTGTTGGTGCa < 2:1026864/288‑1 (MQ=255) gCT‑GGCTTCAATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCa < 1:323862/212‑1 (MQ=255) ||| CAACCGGCGCGGTATATTCCAAAGAGCTTTTAATGGAGATTGTGGAGATTGCACGTCAGCATAATCTCATTATCTTCGCCGATGAAATTTATGACAAAATTCTCTACGACGACGCTGAGCATCACAGTATTGCGCCGCTGGCACCTGACCTGCTGACCATTACCTTTAACGGACTGAGCAAAACGTACCGCGTTGCAGGCTTCCGTCAGGGGTGGATGGTGTTGAACGGGCCGAAAAAACACGCCAAAGGCTACATCGAAGGTCTGGAAATGCT‑GGCTAGTATGCGCCTGTGTGCTAACGTTCCTGCGCAACACGCCATTCAGACCGCGCT‑AGGTGGTTATCAGAGCATCAGTGAATTTATTACCCCTGGCGGTCGTC‑TTTATGAGCAGCGTAACCGCGCGTGGGAACTGATCAACGATATTCCGGGCGTTTCCTGCGTGAAACCTCGTGGTGCGCTGTATATGTTCCCGAAAATCGACGCCAAACGCTTTAACATTCACGACGATCAGAAAATGGTGTTGGATTTCCTGTTGCAGGAAAAAGTTCTGTTGGTGCAAGGG > CP042583/1979387‑1979946 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |