| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 553,500 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 553,500 | 0 | A | T | 100.0% | 894.7 / NA | 371 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (199/172); total (199/172) | |||||||||||
| * | CP042583 | 553,501 | 0 | G | C | 99.7% | 865.6 / NA | 366 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (195/170); total (196/170) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 553,502 | 0 | T | A | 99.7% | 885.1 / NA | 366 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (195/170); minor base C (1/0); total (196/170) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 371 total aligned reads displayed.
ATACTGGGATAAAAGAATTCGAGCTCAGTAGTTCCTGGGGAATAAATAATCGTGATGATTTAATTCAGACTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑AGCGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGAGTCGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAAAGCCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATAGCTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTAGCCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTA > CP042583/553222‑553781 ||| ggATAAAAGAATTCGAGCTCTCATCATCCTGGGGAATAAATAATCGTGATGATTTAATTCAGACTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGc > 2:217658/1‑288 (MQ=255) ggATAAAAGAATTCGAGCTCTCATCATCCTGGGGAATAAATAATCGTGATGATTTAATTCAGACTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGc > 1:529071/1‑288 (MQ=255) aaaGAATTCGAGCTCTCATCATCCTGGGGAATAAATAATCGTGATGATTTAATTCAGACTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTcaaca > 1:1686186/1‑289 (MQ=255) tctcatcatCCTGGGGAATAAATAATCGTGATGATTTAATTCAGACTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACgg < 2:529071/280‑1 (MQ=255) aatCGTGATGATTTAATTCAGACTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTAt > 1:2597603/1‑280 (MQ=255) gatgatTTAATTCAGACTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCaatcgcgc < 1:3189528/288‑7 (MQ=255) aCTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGgt < 1:2575498/222‑1 (MQ=255) aCTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGgt > 2:2575498/1‑222 (MQ=255) aCTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCt > 1:768546/1‑288 (MQ=255) aCTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTc > 1:853915/1‑289 (MQ=255) tATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTAGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCAtt < 1:3135891/289‑1 (MQ=255) tCAGATGACTGATGATGTTTATGCCAATGATTTATCTGGCTAATATCTGAAATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCTTAAATTGCTGTTGGCTAGAG‑GTGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGGCTAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACTGGTCGGTGTGCTTAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGCCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTAc < 2:1686186/289‑1 (MQ=255) aGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGGCTATGTACGAGCTCACCATTACTa > 1:612700/1‑289 (MQ=255) gACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCaatcgcgcgt < 2:2629543/261‑9 (MQ=255) gACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCaatcgcgc > 2:1816048/1‑253 (MQ=255) gACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCaatcgcg < 1:1542923/258‑6 (MQ=255) gACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTc < 2:845674/262‑1 (MQ=255) gACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCa > 2:9083/1‑276 (MQ=255) tgatgaTGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGc < 2:553929/289‑1 (MQ=255) atgatgGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGCAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGATGAGAGTGTATGGCTGCAATCGTGAGTCTATGTACGAGCGCACCATTagctgtagcttat > 2:703105/1‑277 (MQ=255) atgatgGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGa > 1:1804481/1‑222 (MQ=255) tGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTcc < 2:1892727/289‑1 (MQ=255) aGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCt < 1:2839897/247‑1 (MQ=255) cTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCtattcgtta > 1:1454592/1‑283 (MQ=255) cTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCtattcgtt < 1:217658/288‑6 (MQ=255) ttagaacTGACATGGACTCGCTCATCGCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATGCGTTGCCCAACCCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCGGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGACGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCtattcgttag < 2:3319761/283‑8 (MQ=255) ttATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGAGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCtattcgttag < 1:966062/289‑8 (MQ=255) gACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCTATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGtc > 1:1507984/1‑287 (MQ=255) gACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCt > 2:1745713/1‑232 (MQ=255) gACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGa < 1:572412/254‑1 (MQ=255) ggCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCaatcg < 1:1247951/209‑4 (MQ=255) ggCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCaatcg > 2:1247951/1‑206 (MQ=255) ggCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGGCTTTACTg > 1:789694/1‑289 (MQ=255) tCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCaa < 1:2886715/289‑1 (MQ=255) ttCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAAtcttct < 1:869059/289‑1 (MQ=255) tCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTtctc > 1:2930756/1‑289 (MQ=255) ccccTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAg > 2:2851747/1‑213 (MQ=255) ccccTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCa > 1:2686391/1‑289 (MQ=255) cTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCa > 1:2293542/1‑277 (MQ=255) cTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCa < 2:2293542/277‑1 (MQ=255) aaGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGa > 2:2508635/1‑162 (MQ=255) aaGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTCGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGa < 1:2508635/162‑1 (MQ=255) ttGGAAAGCATTAATTGTTGGTGGC‑TCGGGGTGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGa < 2:3193771/287‑1 (MQ=255) gTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCaatcgcg < 1:1171063/189‑6 (MQ=255) tGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGgtg < 1:27440/139‑1 (MQ=38) tGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCt > 1:332998/1‑223 (MQ=255) tGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGaca > 1:2371781/1‑289 (MQ=255) tAATTGCTGGTGGC‑TCGGCGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGACTCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGCCTATGTACGATCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGTCTATTCGTTAGGGCGTCTCTACTGGCAATTTTTTCAGTGCGAAGAAAACACttcact > 1:703448/1‑284 (MQ=255) tAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCt < 1:102943/194‑1 (MQ=255) tAATTGCTGGTGGC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCt > 2:102943/1‑194 (MQ=255) tggtggC‑TCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCAt < 2:1217276/193‑1 (MQ=255) ggtggctcggagagaGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAacac > 1:3264431/10‑275 (MQ=255) ggtggctcggagagaGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAg > 2:402833/10‑288 (MQ=255) gtggctcggagagaGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTAGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCAATTCTGTAGGCCGTCTGTACTGGCAATCTTCTCAGTGAGAAGACAACCCTTCGCTAcgccatgc > 2:2348794/9‑284 (MQ=255) ggctcggagagaGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCGATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGgcgc < 1:2636295/283‑1 (MQ=255) ctcggagagaGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAA‑GGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTtctc > 2:1479606/5‑253 (MQ=255) agGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTTCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTAc > 1:136810/1‑289 (MQ=255) agGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGc > 2:2081839/1‑250 (MQ=255) aTTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCaatcgcg < 2:1645855/149‑6 (MQ=255) tttATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGATAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGgcgc < 1:2075830/270‑1 (MQ=255) ataCCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCta < 2:3085825/202‑1 (MQ=255) taCCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATca < 2:1371475/174‑1 (MQ=255) taCCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAgc > 1:210627/1‑289 (MQ=255) aCCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGaa > 1:1638294/1‑240 (MQ=255) aaTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAAACCTTCCCTACGCGAAGCGCTAACCCTGTACAAATACGATACCGCCgg > 2:758886/1‑289 (MQ=255) aaTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCACGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCgg > 2:645819/1‑289 (MQ=255) aTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGAACGCCCCggg > 2:2946432/1‑289 (MQ=255) tGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGt > 2:2751308/1‑289 (MQ=255) gCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTa < 1:2449825/289‑1 (MQ=255) gCCCAAACCGCGATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAAGGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTTTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGGGGCGCTAACCCTGTACAAATACGAGACCGCCGGGGGTCgca > 2:938643/1‑287 (MQ=255) aCCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAAcc < 1:2514743/252‑1 (MQ=255) ccGCTTTGGGGTGTGGGGAGGGGGGATTCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGa < 2:239731/289‑1 (MQ=255) aTGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAaga > 2:1787869/1‑287 (MQ=255) gCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGa < 2:1429431/232‑1 (MQ=255) cTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTtctc > 2:1661851/1‑203 (MQ=255) cTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTtctc < 1:1661851/203‑1 (MQ=255) tgGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAAcc < 2:2722249/238‑1 (MQ=255) ggggAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGc < 2:133360/204‑1 (MQ=255) ggggAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACaaa < 1:1732793/246‑1 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTAt > 1:909975/1‑93 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCt < 1:1383276/122‑1 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCtattcgttag > 1:159302/1‑164 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCtattcgttag < 2:159302/171‑8 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGt > 2:604207/1‑263 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGaa > 1:407037/1‑288 (MQ=255) ggggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCt > 2:507245/1‑226 (MQ=255) ggggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCt < 1:507245/226‑1 (MQ=255) ggggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGa > 1:1904349/1‑289 (MQ=255) ggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATg > 2:1522099/1‑141 (MQ=255) ggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCta > 1:1112335/1‑158 (MQ=255) ggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCta < 2:1112335/158‑1 (MQ=255) aaTCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTtctc > 2:185154/1‑188 (MQ=255) aaTCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGAt > 2:856530/1‑286 (MQ=255) cAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCg < 2:2457429/252‑1 (MQ=255) tCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACTAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTgg < 2:2917956/289‑1 (MQ=255) cGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTgg > 1:1848409/1‑288 (MQ=255) gAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTGTCTATGCCACGCTTCCCTGGCa > 1:75617/1‑289 (MQ=255) aaTGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCGTTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGc > 2:77065/1‑169 (MQ=255) gggTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAAccc < 1:1235069/199‑1 (MQ=255) gggTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGa < 1:653552/212‑1 (MQ=255) ||| ATACTGGGATAAAAGAATTCGAGCTCAGTAGTTCCTGGGGAATAAATAATCGTGATGATTTAATTCAGACTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGC‑AGCGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGAGTCGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAAAGCCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATAGCTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTAGCCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTA > CP042583/553222‑553781 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |