Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 555,697 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 555,697 | 0 | G | C | 99.2% | 637.3 / NA | 268 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 555,698 | 0 | C | G | 100.0% | 644.0 / NA | 268 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (128/140); total (128/140) | |||||||||||
* | CP042583 | 555,699 | 0 | T | A | 100.0% | 647.3 / NA | 268 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (128/140); total (128/140) |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
ACGCCGCATCAAAATCGGTGATCACCCGGCCGATCTCTTCTCGCTCGTCACCCAGCGCCCGCGCCCACAACTCTTCCAGTTTGGCTTTAAAGGTGCGATTGATGAGCATATCGCGCGGATAAATTTTCAATGCGGATAACCGCGTCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATGCTCTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATACTATCCTGTTCCGGGTGCATGGTACTATAAGTTTCTACACGGCTCACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGGCTGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAAGCTGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAA > CP042583/555417‑555975 ||| gcATCAAAATCGGTGATCACCCGGCCGATCTCTTCTCGCTCGTCACCCAGCGCCCGCGCCCACAACTCTTCCAGTTTGGCTTTAAAGGTGCGATTGATGAGCATATCGCGCGGATAAATTTTCAATGCGGATAACCGCGTCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGccc < 2:2950063/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |