| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 555,799 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 555,799 | 0 | A | T | 100.0% | 752.1 / NA | 311 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (157/154); total (157/154) | |||||||||||
| * | CP042583 | 555,800 | 0 | C | G | 99.7% | 742.3 / NA | 311 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (156/154); minor base T (1/0); total (157/154) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 555,801 | 0 | T | A | 99.7% | 746.7 / NA | 311 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (156/154); minor base C (1/0); total (157/154) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
CATATCGCGCGGATAAATTTTCAATGCGGATAACCGCGTCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATGCTCTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATACTATCCTGTTCCGGGTGCATGGTACTATAAGTTTCTACACGGCTCACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGGCTGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAAGCTGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCAGCGCGACAATGGTGCTCGGATCGTAACTTTGATACGGTAATTTGCCAAACAGACGCACGGCGATTCGCTGCACCAG > CP042583/555523‑556080 ||| atatCGCGCGGATAAATTTTCAATGCGGATAACCGCGTCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTc < 1:967426/287‑1 (MQ=255) tatCGCGCGGATAAATTTTCAATGCGGATAACCGCGTCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCgg > 2:377435/1‑289 (MQ=255) gcgcgGATAAATTTTCAATGCGGATAACCGCGTCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGc < 1:10747/289‑1 (MQ=255) aTTTTCAATGCGGATAACCGCGTCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGttgaat < 1:1851626/289‑6 (MQ=255) aaTGCGGATAACCGCGTCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGttt < 1:1794380/289‑1 (MQ=255) aaTGCGGATAACCGCGTCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGtt > 2:1020667/1‑288 (MQ=255) tAACCGCGTCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACgc < 1:2702001/289‑2 (MQ=255) aCCGCGTCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACgcga < 1:1020667/289‑4 (MQ=255) tCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGTTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACgcgacacgg > 1:1734634/1‑280 (MQ=255) tCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACgcgacacgg > 2:910968/1‑280 (MQ=255) ccGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTaca < 1:371970/277‑1 (MQ=255) cgccccgctTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTCCCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGca < 2:462113/282‑1 (MQ=255) cGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGca < 2:1262850/289‑1 (MQ=255) cGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGca < 2:1855089/289‑1 (MQ=255) cGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGca < 1:2301451/289‑1 (MQ=255) cGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGca < 2:274667/289‑1 (MQ=255) ctctTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAgtg < 1:910968/289‑1 (MQ=255) tCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCg > 1:2728184/1‑289 (MQ=255) cgcgcTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCaata > 2:3018109/1‑289 (MQ=255) gcgcTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCaata < 2:7227/288‑1 (MQ=255) cTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCa > 2:2073660/1‑217 (MQ=255) gtgGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGaa < 1:2591302/289‑1 (MQ=255) tgGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGaaa > 2:3174182/1‑289 (MQ=255) aTCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTcc > 2:2958529/1‑201 (MQ=255) aTCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCt > 2:1538678/1‑289 (MQ=255) cACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTgg < 1:3018109/289‑1 (MQ=255) tctGGACTTAGCGCTCCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAAATTCAAGAAACCCGTTGATATCATAACTAAAGAGAATATCAATAGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTAAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTATCCCTGATAGACGTTCATCGTCATTGAATCCTGTTCCgg > 2:2119208/1‑198 (MQ=255) tctGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGGGGTGTTTCGTTAAATAATCGCCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCgg > 2:1778031/1‑289 (MQ=255) aaCGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGttgaa < 1:333142/202‑5 (MQ=255) aaCGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACggg > 2:2429733/1‑225 (MQ=255) gCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACg < 1:1538678/289‑1 (MQ=255) cGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCaacgagt > 1:3100248/1‑274 (MQ=255) cGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAat > 2:2195351/1‑289 (MQ=255) gTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAata > 2:2010849/1‑289 (MQ=255) atctgaaGCAGCCCGGTGGAATCATAACTAAATCGAATATCAATAGAGTGATAAGGCCCGGTTTTATTTAACGTCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTTTGGTTGTGTCCCGGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTCCACGCGACACGGGGACATGGGGGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAg < 2:1623106/284‑1 (MQ=255) cTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGt < 2:1734634/289‑1 (MQ=255) aGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGccc > 2:1581961/1‑240 (MQ=255) aCCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTAc < 1:525144/289‑1 (MQ=255) tGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTc < 1:1993152/289‑1 (MQ=255) tGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTc < 1:2010849/289‑1 (MQ=255) tCATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCaacgagta < 1:1281454/254‑7 (MQ=255) cATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGCTTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTACCTTCAACGCCCAACGAGGAAGGGCAAATATCAGTGCGGATTACTCCTTCAata > 2:1167006/1‑287 (MQ=255) cATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGttt < 2:2650701/159‑1 (MQ=255) cATAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGca > 2:1139582/1‑177 (MQ=255) tAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACg > 1:2334066/1‑240 (MQ=255) tAACTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACg < 2:2334066/240‑1 (MQ=255) aaCTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGtt > 2:956976/1‑132 (MQ=255) aaCTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGca > 1:2789094/1‑174 (MQ=255) aaCTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGca < 2:2789094/174‑1 (MQ=255) aCTAAAGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCa < 1:1240585/289‑1 (MQ=255) aaGCGAATAGCAATCGACTGATAAGCCCCGGATTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAATTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACATTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACCCGGGCACAGTGGTGTTCCGTTCAATCATCGGCGAGAAAATGCCGGACACGCCCTGGCGGTTATCTTCAACGCCCCACACGTCAGGGCAAATATCAGTTCGGATTAACTCTTCAATTCCGTCACTg > 2:1983061/1‑288 (MQ=255) aGCGAATATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGccc < 2:3126545/215‑1 (MQ=255) aaTATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGca < 2:2169930/164‑1 (MQ=255) aaTATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGca > 1:2169930/1‑164 (MQ=255) aaTATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGGGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTaa > 2:516138/1‑288 (MQ=255) aaTATCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGt > 1:2146213/1‑255 (MQ=255) atatCAATCGACTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGt < 1:451215/254‑1 (MQ=255) atcaatcgactGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCaa < 1:1636546/215‑1 (MQ=255) aatcgactGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAg < 1:2433567/283‑1 (MQ=255) atcgactGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATgg < 2:2707037/122‑1 (MQ=255) atcgactGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGtt > 1:1225877/6‑212 (MQ=255) actGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGcc > 2:3274449/2‑220 (MQ=255) tGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACgcga > 2:831321/1‑140 (MQ=255) aTAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTc < 1:809135/255‑1 (MQ=255) aTAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTc > 2:809135/1‑255 (MQ=255) aGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAat < 2:584116/231‑1 (MQ=255) ccGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGc < 2:1389734/223‑1 (MQ=255) ccGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGc > 1:1389734/1‑223 (MQ=255) gTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCaacgagt < 2:336963/214‑6 (MQ=255) tgttagtcAATGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTGTTCTCCCTGATAGCCGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGcc < 2:1304783/283‑1 (MQ=255) cttcAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCCTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCGGCGCCCAg > 2:1443370/1‑288 (MQ=255) ttcAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCAgcg < 1:2387021/289‑1 (MQ=255) aCGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTAc > 1:721791/1‑229 (MQ=255) aTCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCaa > 1:2831678/1‑230 (MQ=255) aTCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCaa < 2:2831678/230‑1 (MQ=255) cGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTACCTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCAGCGCGACAATGGTGCt < 1:2455698/289‑1 (MQ=255) gtgacacccacctGAATGTTGTTTTTATCTTTGTTGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAAACGTAATTGAATCCTTGTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGTTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGTGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCAGCGCGACAATGGTGCt < 2:604678/280‑1 (MQ=255) ttCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCAGCGCGACAATg < 1:594300/277‑1 (MQ=255) tCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTTGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGACTCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACAAGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTTCTGCGCCCAGCGCGACAATGGTGCTCGGATCGt < 1:2994894/289‑1 (MQ=255) caccaGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTAc < 2:684977/210‑1 (MQ=255) caccaGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCAGCGCGACAATGGTGCt > 1:1600511/1‑279 (MQ=255) accaGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCAGCGCGACAATGGTGCTCGGATCGTAAc < 1:846654/289‑1 (MQ=255) gAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCaacgagta > 2:3309678/1‑175 (MQ=255) tgttgtTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGca > 2:2610573/1‑102 (MQ=255) gttTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACgc < 1:583715/88‑2 (MQ=255) tttAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAgtggtg < 1:2859943/103‑1 (MQ=255) ttAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAg < 1:2269791/225‑1 (MQ=255) tgtgGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGc < 1:1580724/168‑1 (MQ=255) tgtgGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAg < 2:2534918/218‑1 (MQ=255) tgtgGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGa < 2:3060016/228‑1 (MQ=255) tgtgGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGa > 1:3060016/1‑228 (MQ=255) ttCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAgg < 1:2550683/212‑1 (MQ=255) cTGATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCAGCGCGACAATGGTGCTCGGATCGTAACTTTGATACGGTAATTTGCCAAACAGACGCACGGCg < 1:3174182/289‑1 (MQ=255) gATAGACGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCGGCGCGACAATGGTGCTCGGACCGTAACTTTGATACGGTAATTTGCAAAACAGACGCACGGCgct > 1:949655/1‑287 (MQ=255) aCGTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCAGCGCGACAATGGTGCTCGGATCGTAACTTTGATACGGTAATTTGCCAAACAGACGCACGGCGATTc > 1:1476226/1‑286 (MQ=255) gTTAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTAcc < 1:329015/166‑1 (MQ=255) tAACCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCAGCGCGACAATGGTGCTCGGATCGTAACTTTGATACGGTAATTTGCCAAACAGACGCACGGCGATTCGCTGCa > 2:1686052/1‑288 (MQ=255) aaCCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTc < 1:2099807/168‑1 (MQ=255) aaCCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCAGCGCGACAATGGTGCTCGGATCGTAACTTTGATACGGTAATTTGCCAAACAGACGCACGGCGATTCGCTGCAcc > 1:324683/1‑289 (MQ=255) aCCGTAATTGAATCCTGTTCCGGGTGCATGGTTGAATAAGTTTCTACACGCGACACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGCGAGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAACGAGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCAGCGCGACAATGGTGCTCGGATCGTAACTTTGATACGGTAATTTGCCAAACAGACGCACGGCGATTCGCTGCACCa > 1:2214403/1‑289 (MQ=255) ||| CATATCGCGCGGATAAATTTTCAATGCGGATAACCGCGTCCGACTCTCTTCAATCTGCTGCGCGCTCAATGTTACCGGGCTGTGGTTAATCACTCTGGACTTAACGCTGCCGTCTTCCAGAAGCACGTCAACTTCAAGCAACCCGTTGATATCATAACTAAAGCGAATATCAATGCTCTGATAAGCCCCGGTTTTCTTCAACGGCACATCGAAGGATTCCACCAGAATGTTGTTTTTAACTTTGTGGTTTTCTCCCTGATAGACGTTAACCGTAATACTATCCTGTTCCGGGTGCATGGTACTATAAGTTTCTACACGGCTCACGGGCACAGTGGTGTTTCGTTCAATAATCGGGCTGAAAATGCCGGAAACGCCCTGGCGGTTAACTTCAACGCCCAAGCTGTAAGGGCAAATATCAGTGAGGATTACCTCTTCAATATCTTCACTGCGTAAGCGGCAGGCGGCCTGGATTGCTGCGCCCAGCGCGACAATGGTGCTCGGATCGTAACTTTGATACGGTAATTTGCCAAACAGACGCACGGCGATTCGCTGCACCAG > CP042583/555523‑556080 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |