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* | CP042583 | 587,042 | 0 | T | A | 99.7% | 921.2 / NA | 385 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (208/176); minor base G (0/1); total (208/177) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 385 total aligned reads displayed.
CGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATGAATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTAGTTCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGCAGGAACACTACAACGAACTGGCAAAACGCTTTGGTGCGCCGA > CP042583/586760‑587319 ||| tCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTGGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATGAATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCgtg < 1:2634096/288‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |