Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 588,991 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 588,991 | 0 | A | T | 100.0% | 586.9 / NA | 244 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (101/143); total (101/143) | |||||||||||
* | CP042583 | 588,992 | 0 | C | G | 99.2% | 576.7 / NA | 244 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (100/141); minor base T (1/1); total (101/143) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 588,993 | 0 | T | A | 100.0% | 591.0 / NA | 244 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (101/143); total (101/143) |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GACATCGTCAGCGATGGGTAAAGCCCGCACGCCTGCGAATTCAGGGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAATTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGACTTTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCACTATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCGATACCCAATACCGGTTTCAGTAATAAAATGGCGAGGCCGGGCCGGATCCTGTTCCAGTTTTTGTCGCAGATGCCCCATATAATTACGCAAATAGTTGCTGTG > CP042583/588712‑589269 ||| aTCGTCAGCGATGGGTAAAGCCCGCACGCCTGCGAATTCAGGGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTa < 1:1322884/289‑1 (MQ=255) gTAAAGCCCGCACGCCTGCGAATTCAGGGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACTGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGAt < 1:1966788/288‑1 (MQ=255) aGCCCGCACGCATGCGAATTCAGGGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGCGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTCCTAACTGATTCAtt > 1:1126434/1‑289 (MQ=255) ccGCACGCCTGCGAATTCAGGGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCa < 2:2673398/289‑1 (MQ=255) ccGCACGCCTGCGAATTCAGGGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCa < 2:1512133/289‑1 (MQ=255) gCACGCCTGCGAATTCAGGGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCAc > 2:1201915/1‑288 (MQ=255) cACGCCTGCGAATTCAGGGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGc > 1:591006/1‑289 (MQ=255) gCGAATTCAGTGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGTGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTa < 2:3068948/289‑1 (MQ=255) gAATTCAGGGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACt < 1:304373/289‑1 (MQ=255) aaTTCAGGGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACt < 2:3103506/288‑1 (MQ=255) tCAGGGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCt < 1:795345/289‑1 (MQ=255) aGGGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCt > 2:1050798/1‑287 (MQ=255) gCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCtt < 2:591006/288‑1 (MQ=255) gCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCtt < 2:2783996/288‑1 (MQ=255) tCCAAATTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCGGCTATGCGTAACGAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCAGCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTg < 1:1241420/274‑1 (MQ=255) aaCTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGgt < 1:822132/289‑1 (MQ=255) aaCTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGgt > 1:3310231/1‑289 (MQ=255) aCTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACg < 2:283441/254‑1 (MQ=255) aCTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACg > 1:283441/1‑254 (MQ=255) tGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTACTTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTCACCGGTAAGAGTTCGGTCTGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTTAATCTTCAGTATTTACTAACTGACTCATTTCACGCATCGATACTTGCTCCTtgttt > 2:1241420/1‑272 (MQ=255) tcGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTatgatg < 1:3199060/289‑1 (MQ=255) gTGGCAACCGGGGGTGACCAGTTCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAg < 2:539193/289‑1 (MQ=255) gTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTatgatg < 2:3237213/287‑1 (MQ=255) gTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTatgatg > 1:3237213/1‑287 (MQ=255) tGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGgt < 2:1903586/273‑1 (MQ=255) cAACCGGGGGTGACCAGATCCGGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCCGTCCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAATTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGaa < 2:901755/288‑1 (MQ=255) ccGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGt < 2:1274470/289‑1 (MQ=255) aTCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAg > 2:884182/1‑198 (MQ=255) tCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCtt > 2:2377595/1‑240 (MQ=255) tCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACAtttttt < 1:1725564/288‑1 (MQ=255) tCCTGCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGACATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACAtttttt < 1:2615932/288‑1 (MQ=255) gCTATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTa > 1:2488562/1‑244 (MQ=255) tATGCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTa < 1:886375/224‑1 (MQ=255) gCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTa > 2:2250811/1‑287 (MQ=255) gCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAg < 1:2317063/289‑1 (MQ=255) gCGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAg < 1:377855/289‑1 (MQ=255) cGTAACTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGt > 1:515656/1‑188 (MQ=255) ctAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAg > 2:1761060/2‑182 (MQ=255) ctAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTa > 1:1825412/2‑215 (MQ=255) ctAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTtgtg < 1:1412781/227‑1 (MQ=255) ctAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTtgtg > 2:1412781/2‑228 (MQ=255) aCCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACg < 2:2537274/232‑1 (MQ=255) aCCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACg > 1:2537274/1‑232 (MQ=255) tATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTtgtg < 1:2972606/220‑1 (MQ=255) tATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTtgtg > 2:2972606/1‑220 (MQ=255) tcaatcaGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTcc < 1:1957931/213‑1 (MQ=255) atcaGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCtt < 1:2660890/212‑1 (MQ=255) tcaGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTatgatg < 2:333728/236‑1 (MQ=255) cagACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAg < 2:1565104/164‑1 (MQ=255) cagACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCtt > 1:1494400/1‑207 (MQ=255) cagACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCtt < 2:1494400/207‑1 (MQ=255) aCCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGgt > 1:2448861/1‑216 (MQ=255) ccGGAACCATAGGCAAGCGAACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTAt < 2:2450390/289‑1 (MQ=255) cGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTatg < 1:1066595/221‑1 (MQ=255) cGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAg > 2:2635585/1‑257 (MQ=255) tAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGaa < 2:480448/221‑1 (MQ=255) gcgcACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTaa > 1:695950/1‑241 (MQ=255) gcgcACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTaa < 2:695950/241‑1 (MQ=255) gcgcACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACtt > 1:197242/1‑289 (MQ=255) cgcACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTatgatg > 1:455280/1‑208 (MQ=255) cgcACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGaa < 1:1876053/213‑1 (MQ=255) cgcACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGaa > 2:1876053/1‑213 (MQ=255) cACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCt < 1:1272043/177‑1 (MQ=255) cACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACg > 1:715798/1‑191 (MQ=255) cACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACAtttttt < 2:817301/229‑1 (MQ=255) cACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTa < 2:448747/237‑1 (MQ=255) cccATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCtt < 2:2075771/179‑1 (MQ=255) cccATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCtt > 1:2075771/1‑179 (MQ=255) cgtttttttcttcgcTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAAGCTTTATTAACCGGGAAGGGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTAGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTACTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATa < 2:202198/274‑1 (MQ=255) gtCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGgt < 2:1078595/173‑1 (MQ=255) gtCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGgt > 1:1078595/1‑173 (MQ=255) cACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCtt > 2:1092299/1‑159 (MQ=255) gATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCg > 2:760224/1‑271 (MQ=255) tAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGAc > 1:833552/1‑230 (MQ=255) aGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTAc > 1:2153882/1‑152 (MQ=255) aGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCg < 2:3308768/266‑1 (MQ=255) gCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACAtttttt > 2:77844/1‑179 (MQ=255) gCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACAtttttt < 1:77844/179‑1 (MQ=255) aTCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCGATACCCAATACCGGTTTCAGTAATAAAATGGCGAggccgg > 2:2951540/1‑289 (MQ=255) ttattaACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCg < 2:822816/245‑1 (MQ=255) aaCCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCg < 2:2514686/104‑1 (MQ=255) tAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATAtt < 1:1515117/166‑1 (MQ=255) agagTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATa > 2:1962170/1‑227 (MQ=255) ttCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTaa < 1:2185725/72‑1 (MQ=255) ttCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGAc > 2:2710020/1‑189 (MQ=255) cGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCtt < 1:2054303/103‑1 (MQ=255) cGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCtt > 2:2054303/1‑103 (MQ=255) cGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCa < 1:1429817/214‑1 (MQ=255) ttGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCa > 1:101786/1‑78 (MQ=255) gtgGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATa > 1:967762/1‑210 (MQ=255) gtgGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCGATACCCAATACCGGTTTCAGTAATAAAATGGCGAGGCCGGGCCGGATCCTGTTCCAGTTTTTGTCGCAGATGc > 1:2363561/1‑288 (MQ=255) ggCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGgt > 2:3113592/1‑102 (MQ=255) ggCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGgt < 1:3113592/102‑1 (MQ=255) ggCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCGATACCCAATACCGGTTTCAGTAATAAAATGGCGAGGCCGGGCCGGATCCTGTTCCAGTTTTTGTCGCAGa > 2:2170397/1‑283 (MQ=255) tCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCGATACCCAATACCGGTTTCAGTAATAAAATGGCGAGGCCGGGCCGGATCCTGTTCCAGTTTTTGTCGCAGATGCCCCatat > 1:1692564/1‑289 (MQ=255) aCCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCGATACCCAATACCGGTTTCAGTAATAAAATGGCGAGGCCGGGCCGGATCCTGTTCCAGTTTTTGTCGCAGATGCCCCATATAATTACg < 2:197242/289‑1 (MQ=255) gATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTTCTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCGATACCCAATACCGGTTTCAGTAATAAAATGGCGAGGCCGGGCCGGATCCTGTTCCAGTTTTTGTCGCAGATGCCCCATATAATTACGCAAATAGTTg < 1:1195286/289‑1 (MQ=255) ttGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCg < 2:3164983/187‑1 (MQ=255) ttGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCg > 2:1793060/1‑187 (MQ=255) ttGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCGATACCCAATACCGGt < 1:2727305/202‑1 (MQ=255) ||| GACATCGTCAGCGATGGGTAAAGCCCGCACGCCTGCGAATTCAGGGCGTTGTGTCCAACTTACTGGATCTCGTGGCAACCGGGGGTGACCAGATCCTGCTATGCGTAATTAACCATTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGACTTTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCACTATCTTCAGTATTTACTAACTGATTCATTTCACGCATCGCTACTTGCTCCTTGTGTGCTACGGTGTCATTTATGATGAGGAATTGTATGGAACATTTTTTAAATATTAAGTTCCTTATATTTGAATAAAAAATGACTTTATCCATACATTGCCACTTTTTTCAAAGCATAAACCGATACCCAATACCGGTTTCAGTAATAAAATGGCGAGGCCGGGCCGGATCCTGTTCCAGTTTTTGTCGCAGATGCCCCATATAATTACGCAAATAGTTGCTGTG > CP042583/588712‑589269 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |