Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 597,040 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 597,040 | 0 | G | C | 99.4% | 762.1 / NA | 324 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base C (157/165); total (158/166) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 597,041 | 0 | C | G | 99.7% | 768.7 / NA | 324 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (157/165); minor base A (0/1); total (158/166) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 597,042 | 0 | T | A | 99.4% | 766.3 / NA | 324 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (158/164); minor base G (0/2); total (158/166) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
AAAACTTTCAGCTTCCCCCGATGCGGCGCGGCAGTTTGTTCCAGCAGACGATCGGGGTCGGGACGTAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCGCTTGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCGCTCGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCGCTACCGCGCACCGTATCACCTTCACGAATCAAGCTACCATTGGCCTGCCAGGGAAACCACCAT > CP042583/596764‑597319 ||| aaacCTTTCAGCTTCCCCCGATGCGGCGCGGCAGTTTGTTCCAGCAGACGATCGGGGTCGGGACGTAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCAcc < 1:1205904/289‑1 (MQ=255) cgcggcAGTTTGTTCCAGCAGACGATCGGGGTCGGGACGTAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCgg > 2:1312157/1‑274 (MQ=255) gcAGTTTGTTCCAGCAGACGATCGGGGTCGGGACGTAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATc < 1:2085147/288‑1 (MQ=255) tCCAGCAGACGATCGGGGTCGGGACGTAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCg > 2:1715749/1‑289 (MQ=255) agACGATCGGGGTCGGGACGTAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCg < 1:3119198/288‑1 (MQ=255) agACGATCGGGGTCGGGACGTAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGACATCCGGGTTAGCGGCCCg < 1:1962429/288‑1 (MQ=255) ggACGTAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGt > 1:505364/1‑289 (MQ=255) ggACGTAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCCCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCCGCAACGCGt > 2:2739785/1‑289 (MQ=255) tAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCg > 1:1637898/1‑287 (MQ=255) tAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGc > 2:1551009/1‑289 (MQ=255) tAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGCTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCAAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCTAGCCCGCTTGACGATGCCGGCACCAGTTCAACCGGAACGCCCGAGCTGGCATCCGGGGTAGCGGCCCGCAATGCAGAAACGCGCGCgg > 2:1760400/1‑288 (MQ=255) tAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATAAATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCgg > 1:516529/1‑288 (MQ=255) ggTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCa < 1:988751/218‑1 (MQ=255) cGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTg > 2:1424315/1‑277 (MQ=255) cGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGtt > 1:671116/1‑289 (MQ=255) cGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGtt > 1:2134335/1‑289 (MQ=255) cGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCCCGCTTGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACCCGttgagcaagtagtt > 2:1871398/1‑276 (MQ=255) cttCATCAAGTTTACCCAGCGGCGGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGGATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATc < 2:1978772/288‑1 (MQ=255) tcaAGTTTTTCCGTCGCTCGATTGAGTTAAAAAATGTTGACAACAGGATGACTGATAGATTCCACCAGCGTGTTTTGGCTGTCTTTTGCGATCAGTTGCGTGCGCGGTTCAACACTGGGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGACCGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCt < 2:2892011/289‑1 (MQ=255) tcaAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCt < 1:1871398/289‑1 (MQ=255) aGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCCGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGGAATGCCGCAACCCGGGCGGCTCTTAGTTTATCCCGCCTAGGGTTAATGACCGCCAgtgtg > 2:5628/1‑284 (MQ=255) aGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGAACAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTa < 1:1381775/250‑1 (MQ=255) ttcacacaTGTTTACACCCGCCTGGACGTTATATTTCACCTGTGGTTGTTGGCTGTATTTTGGGATCAATTGCGTGAGCTGTTAAACGCGGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTGGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTGGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCt < 2:1637898/281‑1 (MQ=255) ttCAACATGTTTGAAAACCGGCGGCCCGTTATATTTATGCAGCGGTTGATGGCTGGTGTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTAGGA‑TTACGCGCTTGCGACACGCGTGGGATGTGCCAGGCCGCCGCTGGCGGGGTGATATTATGGTCCAGCCCGCTGGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAACTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCt < 2:3320189/288‑1 (MQ=255) ttCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCt > 1:1535051/1‑288 (MQ=255) tccacaaTGTTGTAATGCGGCGGGCCGATCTATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTGGCGAGCCGGTGCGTGATCGGTTAAACGC‑GCGACTTCCGCGCGTTCGCCACGCGTGGGATTTGCGAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTGCAGGCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTGCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTcc < 2:2478594/286‑1 (MQ=255) tCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCt < 1:1001364/287‑1 (MQ=255) tCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTcc < 1:2586289/289‑1 (MQ=255) acaaTGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCCGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGc > 2:764042/1‑239 (MQ=255) acaaTGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGc < 1:1715749/289‑1 (MQ=255) tGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGc < 1:5628/289‑1 (MQ=255) aCAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGTTTTGCCAGGCGGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTGGCCGATGCCGTCACCGGTTCACCCGGACCGCTCCCGCTGGCATCCGGGTTGGCGCCCCGTAACCCGGAAACCCGGCGGGTTATTGGTTTACCCACCCCTGGGTTACTGACCGCAATATGCCTcccccctaagcccc > 2:3223539/1‑281 (MQ=255) aCAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCAc > 1:3052437/1‑167 (MQ=255) cAACCGGCTGGCGGTGATATTTCACCAGCGGCTGTGTGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGGGCTGTGCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCt < 2:2134335/288‑1 (MQ=255) cAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCt < 2:671116/288‑1 (MQ=255) aaCCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCtgt > 1:1067991/1‑289 (MQ=255) cGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCCCAGGGTTACTTACCGCCAGATTGCTCCCGCCATACGCCCGTggg > 2:2656604/1‑288 (MQ=255) cGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCCCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTGACTGACCGCCAGCTTCCTCCCGCCAGATGCCtggcg > 2:2942298/1‑285 (MQ=255) gCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAGCGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCa > 2:312897/1‑245 (MQ=255) gCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAg < 1:2423532/163‑1 (MQ=255) gCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAg > 2:2423532/1‑163 (MQ=255) gCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGc < 1:3257194/187‑1 (MQ=255) gCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAggg > 1:2870784/1‑248 (MQ=255) gCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGa < 2:3009869/263‑1 (MQ=255) atatatTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCg > 2:1331224/1‑197 (MQ=255) cAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGTAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCa > 2:516772/1‑226 (MQ=255) cAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTa > 1:338827/1‑209 (MQ=255) cAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGtt > 1:906182/1‑289 (MQ=255) cGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTgcc > 1:2983442/1‑288 (MQ=255) tgGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTAGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTgccgacggg < 2:420308/288‑8 (MQ=255) tGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCt < 1:1314454/235‑1 (MQ=255) tGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGaaaa > 1:180225/1‑289 (MQ=255) ttCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGt < 2:326957/172‑1 (MQ=255) ttCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTaa > 1:1459352/1‑284 (MQ=255) ttCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGACATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAACAt > 1:2470057/1‑287 (MQ=255) aaCGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGc < 1:1916733/289‑1 (MQ=255) gcgcattcgccgcTTTGGTCACGCGTGGGGTTGTCGAGGCAGCCGCTGGCGGGGTGGTATTATTGCCCAGCCCGCTTGCCGGGGCCGTCACCATTTCAATCGGAACGCTCGCCCTGGCATCCGAGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTAGCCAGCTCAGGGTTACTAACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGAt < 2:505364/279‑1 (MQ=255) aga‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCg > 2:480778/1‑134 (MQ=255) aga‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCa < 2:1462912/204‑1 (MQ=255) aga‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGa > 1:3280808/1‑206 (MQ=255) aga‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTa > 1:64032/1‑289 (MQ=255) aga‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTa > 1:1172715/1‑289 (MQ=255) aga‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCATAATGCAGCAACGCGTGCGGCTa > 2:1176092/1‑157 (MQ=255) ccgcgCTTTCGCAACGCGGGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATgcc < 2:946212/288‑2 (MQ=255) aCGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTTATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATgcc < 1:2297650/289‑2 (MQ=255) cTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCg > 2:2690056/1‑238 (MQ=255) ttCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGcc < 1:1141950/120‑1 (MQ=255) ttCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGcc > 2:1141950/1‑120 (MQ=255) tCGCCACGCGTGGGTTTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGACCGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACcgcg < 1:1760400/289‑1 (MQ=255) ggCCACGCGTTGGGTTTGCCGGGCCGCGGCTTGCGGGGTGATAGTATGGTCCAGCCCGCTTGGCGATGCCGTCACCAGTTCGACCGGAACGCGCGCGTGGGTATCCGGGTTAGGGGCGCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTGTCCAGATCAGGGTTACTGACCGCCAGGTTGCTCCCGCCAGAGGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCACGATTAATGCCGAACCgcgc < 2:2388291/288‑1 (MQ=255) cGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCgcgc < 1:2775009/289‑1 (MQ=255) cgTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTa > 1:2509911/1‑288 (MQ=255) cgTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTa < 2:180225/288‑1 (MQ=255) gTGGGATTGGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTATc < 1:2942298/289‑1 (MQ=255) ttGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCgcgc < 2:234701/274‑1 (MQ=255) ttGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCgcgc > 1:234701/1‑274 (MQ=255) tGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTa < 1:2703828/279‑1 (MQ=255) gCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTATCACCTTCACg < 1:2656604/289‑1 (MQ=255) cgcTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGAt > 1:959408/1‑246 (MQ=255) cgcTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGATTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTATCACCTTCACGAATCaacga > 2:1595115/1‑285 (MQ=255) atatTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGc > 2:2300398/1‑214 (MQ=255) atatTATTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTATCACCTTCACGAATCAACGAACCATTGGCCTGc > 1:1655389/1‑288 (MQ=255) tattatTGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTATCACCTTCACGAATCAACGAACCATTGGCCTGcc < 1:3214874/288‑1 (MQ=255) tGTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTATCACCTTCACGAATCAACGAACCATTGGCCTGCCAGGGaa > 1:2213515/1‑288 (MQ=255) tGTCCAGCACGCGTGCCAATGCCGGCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCGGGCATCCGGGTTAGCGGCACGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACAGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTATCACCTTCACGAATCAACGAACCATTGGCCTGCCAGGGaaa < 2:2847937/289‑1 (MQ=255) gTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGc > 1:2846481/1‑147 (MQ=255) gTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTTTAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGACGAACCGCGCACCGTATCACCTTCACGAATCAACGAAACATTGGGCTGCCCGGGaac > 2:3066880/1‑287 (MQ=255) gTCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATgccga < 2:224088/234‑4 (MQ=255) tCCAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTACCACCTTCACGAATCAACGAACCATTGGCCTGCCAGGGAAacc > 2:2098937/1‑289 (MQ=255) ccAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTATCACCTTCACGAATCAACGAACCATTGGCCTGCCAGGGAAacc > 2:2870503/1‑288 (MQ=255) cAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATc > 2:256962/1‑102 (MQ=255) cAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCgcgc < 1:501613/238‑1 (MQ=255) cAGCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTATCACCTTCACGAATCAACGAACCATTGGCCTGCCAGGGAAacca > 2:1229167/1‑288 (MQ=255) gCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATta < 1:1598292/152‑1 (MQ=255) gCCCGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTATCCCCTTCACGAATCAACGAACCATTGGCCTGCCAGGGAAaccacc > 2:2819293/1‑288 (MQ=255) cccGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGc > 1:459165/1‑84 (MQ=255) cccGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTcc < 2:622115/131‑1 (MQ=255) cccGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAggg < 1:236590/156‑1 (MQ=255) cccGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTg < 1:2260182/164‑1 (MQ=255) cccGCTTGCCGATGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCCGACGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCCGAACCGCGCACCGTATCACCTTCACGAATCAACGAACCATTGGCCTGCCAGGGAAACCACCAt > 1:2903453/1‑289 (MQ=255) ||| AAAACTTTCAGCTTCCCCCGATGCGGCGCGGCAGTTTGTTCCAGCAGACGATCGGGGTCGGGACGTAAGGGTTCGTTATTCATCAAGTTTATCCAGCGCCAGATTGAGTTCAACAATGTTGACAACCGGCTGGCCGATATATTTCACCAGCGGTTGTTGGCTGTATTTTGCGATCAGTTGCGTGAGCTGTTCAACGCTGAGA‑TTACGCGCTTTCGCCACGCGTGGGATTTGCCAGGCCGCCGCTTGCGGGGTGATATTATTGTCCAGCCCGCTTGCGCTTGCCGTCACCAGTTCAACCGGAACGCTCGCGCTGGCATCCGGGTTAGCGGCCCGTAATGCAGCAACGCGTGCGGCTATTAGTTTATCCAGCTCAGGGTTACTGACCGCCAGATTGCTCCCGCCAGAAGCCTGTGGATTATAGGGCATTTCTGCCGTTGCGCTCGGGCGACCATGAAAATAGCCGTTGCCGGTAAAATTCTGCCCGATTAATGCGCTACCGCGCACCGTATCACCTTCACGAATCAAGCTACCATTGGCCTGCCAGGGAAACCACCAT > CP042583/596764‑597319 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |