Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 612,814 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 612,814 | 0 | A | T | 99.5% | 904.3 / NA | 379 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (193/183); minor base G (2/0); total (196/183) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 612,815 | 0 | C | G | 99.7% | 905.3 / NA | 379 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (195/183); minor base T (1/0); total (196/183) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 612,816 | 0 | T | A | 99.5% | 899.0 / NA | 379 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base A (194/182); total (196/183) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
ATGTCATTCTCTTTTCCTTAATTAATGACAAGGTAAAATCAGGCGTTTGGTCGTGTCTTCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGACTTTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCC > CP042583/612535‑613094 ||| ttCTCTTTTCCTTAATTAATGACAAGGTAAAATCAGGCGTTTGGTCGTGTCTTCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGGGATTTGTAACCTATc > 2:506107/1‑289 (MQ=255) tctcTTTTCCTTAATTAATGACAAGGTAAAATCAGGCGTTTGGTCGTGTCTTCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATcg < 1:1124388/289‑1 (MQ=255) aattaatGACAAGGTAAAATCAGGCGTTTGGTCGTGTCTTCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCaacc > 2:578572/1‑286 (MQ=255) aatGACAAGGTAAAATCAGGCGTTTGGTCGTGTCTTCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGt > 1:1754/1‑289 (MQ=255) aagTAAAATCAAGCGTTTGGTAGTGTCTTCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCACCTTTGCTCCACCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGACTGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTtg < 2:872711/287‑1 (MQ=255) ggTAAAATCAGGCGTTTGGTCGTGTCTTCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTtga > 2:419760/1‑289 (MQ=255) tAAAATCAGGCGTTTGGTCGTGTCTTCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTtgat < 2:1274306/288‑1 (MQ=255) aaaaTCAGGCGTTTGGTCGTGTCTTCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTtgatg < 2:1213685/288‑1 (MQ=255) ggCGTTTGGTCGTGTCTTCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACATTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGACCGGGAAGCCTGAGATTTGTACCCTATCGCGCTTTCAACAAATGTTCCCTTGTAGAGGttttg > 2:366015/1‑288 (MQ=255) ggCGTTTGGTCGTGTCTTCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGCCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGCTTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGttt > 1:442962/1‑287 (MQ=255) tCTTCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGCCGTTTTCTGCAACTGTTACg > 2:2929315/1‑288 (MQ=255) ttCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCg < 2:1489839/289‑1 (MQ=255) cGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCggg < 1:661021/287‑1 (MQ=255) cGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTa < 2:268569/289‑1 (MQ=255) tCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGt < 1:2929315/289‑1 (MQ=255) cTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGACGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGGGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGAGGTTTTCTTCAATTGTTACGCCGTCTGTTAAg > 2:2195174/1‑287 (MQ=255) aGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGtcattca > 1:2719334/1‑289 (MQ=255) caacTTTGCTCACCCCAGACCCCGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCCCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCa < 2:947261/286‑1 (MQ=255) cTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCAt > 1:497416/1‑222 (MQ=255) tGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTgg < 1:1943759/289‑1 (MQ=255) aGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTa > 2:1202556/1‑289 (MQ=255) ggTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCa < 2:1570337/266‑1 (MQ=255) ggTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCa > 1:1570337/1‑266 (MQ=255) ggTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCa < 1:2551510/266‑1 (MQ=255) ggTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGaa > 1:2629351/1‑289 (MQ=255) ggTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGaa > 1:2759438/1‑289 (MQ=255) ggTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCATTGATGACGTTTACTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCAGGTTCTCCGCCACGTTGGAAGGCGGGTAACTGGaa > 2:774184/1‑289 (MQ=255) ggTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACGGACCGCTGGCGTTGCGTAGGATGACGCTAACGTCTGTACCGGAACGGGAAGCCAGTGTTTTGTAACTGATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGAAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGGCATGCATGTTCACCGCCACTGTGGACGGCTGGTAACTGGaa > 2:1313995/1‑289 (MQ=255) ttGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGa < 1:3091305/264‑1 (MQ=255) aTTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGc > 2:2522214/1‑213 (MQ=255) tttCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAAc > 2:2078555/1‑270 (MQ=255) tttCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAAc > 2:1527702/1‑270 (MQ=255) tttCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAAc < 1:1527702/270‑1 (MQ=255) cacCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGcc < 1:1226522/289‑1 (MQ=255) cTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCg < 1:582755/210‑1 (MQ=255) ccAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAAtggttg > 1:1418843/1‑289 (MQ=255) ggCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGgtg > 1:3310566/1‑289 (MQ=255) cATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGtt > 2:2242231/1‑167 (MQ=255) tGTCCTGCCTCGCCAACCAGACCCACGTTAATGTCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACACAGGTGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGt < 2:176822/289‑1 (MQ=255) tccttcctCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGc > 2:896257/1‑183 (MQ=255) tccttcctCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGc < 1:896257/183‑1 (MQ=255) tccttcctCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCa > 1:384697/1‑265 (MQ=255) ccttcctCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCaa > 1:2238169/1‑265 (MQ=255) cttcctCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCgag > 1:3035157/1‑289 (MQ=255) aaggaacagaaCCATACCCACGCTAAGGCCGCTGTCCTCCTGGCGGATATCCGAACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCgaga < 2:62733/280‑1 (MQ=255) cctCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGt < 2:1943697/201‑1 (MQ=255) cctCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCgagctg > 1:2915797/1‑286 (MQ=255) gCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGTTATCCGCACCGAGGGGAGGCAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGtcattc < 1:2284856/202‑1 (MQ=255) gCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACg < 2:2614822/166‑1 (MQ=255) gCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACg > 1:2614822/1‑166 (MQ=255) cccACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCa > 1:889924/1‑252 (MQ=255) cccGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAata < 2:307749/287‑1 (MQ=255) cGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAata > 1:2663973/1‑287 (MQ=255) gCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAata > 1:208744/1‑286 (MQ=255) aTGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATcgc > 2:16245/1‑119 (MQ=255) aTGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATcgc < 1:16245/119‑1 (MQ=255) aTGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGt < 2:463501/178‑1 (MQ=255) tGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGACTATCTGCCa > 1:1332800/1‑288 (MQ=255) cTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCa > 1:2192393/1‑288 (MQ=255) ccTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCt < 1:286733/289‑1 (MQ=255) ccTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACCTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCt < 2:749350/289‑1 (MQ=255) gCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGcc > 1:3283936/1‑252 (MQ=255) gCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGcc < 2:3283936/252‑1 (MQ=255) ggATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGc > 1:801875/1‑175 (MQ=255) atatCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATc < 1:2070386/288‑1 (MQ=255) atCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAgg < 1:1907494/289‑1 (MQ=255) ccGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCg < 1:954503/289‑1 (MQ=255) cGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGt < 2:3024414/289‑1 (MQ=255) aCCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCGATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTgg < 1:1202556/288‑1 (MQ=255) aggggagggAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGtt > 2:2047817/1‑155 (MQ=255) aggggagggAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTg < 2:2720050/239‑1 (MQ=255) aggggagggAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCAt > 1:251403/1‑289 (MQ=255) ggggagggAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCAt < 1:419760/288‑1 (MQ=255) agggaACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATtggtg > 2:2358913/1‑289 (MQ=255) gggaACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTCACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAAATTGCACTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTTCGCACCCACAGGCGTGGTGTATtgtagg > 2:2626294/1‑285 (MQ=255) gaACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGa > 2:1075830/1‑288 (MQ=255) aCTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGa > 1:1002854/1‑286 (MQ=255) tGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCa < 1:1271701/151‑1 (MQ=255) aCCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCaa < 2:1894138/191‑1 (MQ=255) aCCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTgcg > 2:1050635/1‑288 (MQ=255) ccGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCa > 1:235501/1‑148 (MQ=255) ccGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTgcgg < 1:318417/288‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGTGTCGTTTGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCGAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTgcgg < 2:3199790/288‑1 (MQ=255) tGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGGTGGGAACTGGGAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGATATTGCTCTGAACCGGAATATCTTACACGCCATTGGGGCTAACTGTCAGGACTGGTTCATTTGCGGAGACgcggccttc > 2:1436237/1‑285 (MQ=255) tGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATg > 1:181655/1‑289 (MQ=255) tGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAAtg < 1:2497044/288‑1 (MQ=255) cGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGc < 1:2441311/253‑1 (MQ=255) tttgatggCGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCCGTGATTTGTAACCTATCGGGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCa < 2:2903516/287‑1 (MQ=255) tATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGgtg > 2:3165135/1‑193 (MQ=255) tATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAAtgctgc > 2:444036/1‑288 (MQ=255) tATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCa < 2:181655/289‑1 (MQ=255) atgatgACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGTTTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGGTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCa < 2:2277459/288‑1 (MQ=255) atgatgACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCa < 2:1711198/288‑1 (MQ=255) atgatgACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCa < 1:237180/288‑1 (MQ=255) cGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTg > 2:2492796/1‑289 (MQ=255) tAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGt < 2:2832209/289‑1 (MQ=255) tttACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCa > 2:1365903/1‑241 (MQ=255) tttACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCa < 1:1365903/241‑1 (MQ=255) ggAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGaa < 1:1050635/289‑1 (MQ=255) cGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCAt < 2:2143741/218‑1 (MQ=255) ||| ATGTCATTCTCTTTTCCTTAATTAATGACAAGGTAAAATCAGGCGTTTGGTCGTGTCTTCCAGACGTTCTGGCAGATGAATAATGCAGCTTTGCTCACCCCAGACCACGGTAAACAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGACTTTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCC > CP042583/612535‑613094 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |