| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 619,950 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 619,952 | 0 | C | G | 99.8% | 956.3 / NA | 400 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (197/202); minor base T (1/0); total (198/202) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 400 total aligned reads displayed.
GCGAAACTGAAACTCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTAAGCGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACAGCCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCAGCGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGAAAGGGCTTGAGCAGTTGAAAGTGATCCGCGAGCGTCTGAAAAAT > CP042583/619671‑620228 ||| tgacaactCACTCCCCTGGGTAAAGAGGTTCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGTGCTTTCCCGTACCTTCGCGCACGTCGATCCGGTGAGAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTACCGACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGCAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGCGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCtgg < 2:612311/285‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |