Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 625,953 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 625,953 | 0 | A | T | 99.7% | 830.9 / NA | 346 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (189/156); minor base G (0/1); total (189/157) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.54e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 625,954 | 0 | G | C | 100.0% | 823.8 / NA | 346 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (189/157); total (189/157) | |||||||||||
* | CP042583 | 625,955 | 0 | T | A | 100.0% | 838.4 / NA | 346 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (189/157); total (189/157) |
Only 100 of 346 total aligned reads displayed.
CCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTAGTAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATGGCCTCC > CP042583/625677‑626225 ||| gTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCg > 1:1204801/1‑289 (MQ=255) aTAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTg > 2:2802851/1‑289 (MQ=255) gcaagagcgcaagccGACAAGCGAGTCCGGGTGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGt < 2:91361/275‑1 (MQ=255) cGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACg < 1:9726/277‑1 (MQ=255) cGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACg > 2:9726/1‑277 (MQ=255) aTGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGc < 1:233551/283‑1 (MQ=255) aTGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGt > 2:1630754/1‑289 (MQ=255) tGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGt < 1:2004314/288‑1 (MQ=255) ttAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGa < 2:3158488/289‑1 (MQ=255) tAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGt > 1:897799/1‑248 (MQ=255) tAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGaa > 1:1534440/1‑289 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGACTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGCGGGTAGTGAAATTGCAGGTTCACGCTGGCGGCCGCGGTCAAGCGGGCGCTGTGACGGTTGTa > 2:3225351/1‑289 (MQ=255) cGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAaagaag > 1:2195168/1‑288 (MQ=255) gggTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTggg > 2:2173129/1‑215 (MQ=255) gACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGTTAAAGCGGGCGGGGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACAtgc > 2:665201/1‑287 (MQ=255) aCCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATTTCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGt < 2:1194688/245‑1 (MQ=255) aTGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCtttt > 1:544306/1‑289 (MQ=255) cGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAActg > 1:615808/1‑289 (MQ=255) aTACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGcc > 2:2927838/1‑180 (MQ=255) aTACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAActg > 1:3208786/1‑287 (MQ=255) tACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCa < 2:485648/255‑1 (MQ=255) tACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCa > 1:485648/1‑255 (MQ=255) aaTATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGc < 1:1934543/288‑1 (MQ=255) cGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTc < 1:2802851/289‑1 (MQ=255) gTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCgg > 2:34362/1‑168 (MQ=255) tAACAGATAAAGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATc < 1:791971/289‑1 (MQ=255) tAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTA‑CAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCa > 2:1588318/1‑289 (MQ=255) aaaaGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCa > 2:2996986/1‑184 (MQ=255) aaaaGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCa < 1:2996986/184‑1 (MQ=255) aaaaGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGTAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCa > 2:2350751/1‑289 (MQ=255) aaaaGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCa > 1:1851421/1‑289 (MQ=255) aaCGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGc < 2:1884931/147‑1 (MQ=255) aaCGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGc > 1:1884931/1‑147 (MQ=255) aaCGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGAt > 1:1123672/1‑289 (MQ=255) aaCGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGGCTGGTAACGTATCAAACAGAt > 1:2099403/1‑289 (MQ=255) ttACTGAAGGATGGACAGAACACATAAACTTACAGGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCaa < 1:353191/289‑1 (MQ=255) ggATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCaa > 1:1954202/1‑288 (MQ=255) tGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGt < 2:3111495/252‑1 (MQ=255) tGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTa < 2:1735645/263‑1 (MQ=255) tGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAAc < 2:3083138/286‑1 (MQ=255) ggACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGt < 2:2599973/289‑1 (MQ=255) ggACAGAACACATGAACTTACATGAATAGCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGt < 2:2449846/289‑1 (MQ=255) aCAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAACTCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGAAAGCGTCTGGTAACGTAGCAAACAGAAGCCAATGGCCAACCGGGTa > 2:1074821/1‑289 (MQ=255) aCAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTa > 2:2941026/1‑289 (MQ=255) aGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAAc < 2:712519/289‑1 (MQ=255) aaCACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAgcggg < 1:1012740/178‑1 (MQ=255) aaCACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGc < 1:310466/239‑1 (MQ=255) aaCACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTCACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCa < 1:2558712/201‑1 (MQ=255) aaCACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTCACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCa > 2:2558712/1‑201 (MQ=255) aTGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGGGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGCTGCCAAGGGCCAACCGGTTAACCAGaac > 2:2711807/1‑286 (MQ=255) cTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCgg < 2:2092323/117‑1 (MQ=255) cTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCtg > 2:3274695/1‑149 (MQ=255) cTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCtg < 1:3274695/149‑1 (MQ=255) cTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAAc > 2:3032399/1‑269 (MQ=255) cTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGtt > 1:2865312/1‑289 (MQ=255) aCATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGt < 2:1146110/270‑1 (MQ=255) ggCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGcc < 2:1392240/244‑1 (MQ=255) aaaaCAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTa < 1:2626619/223‑1 (MQ=255) aaaaCAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTa > 2:2626619/1‑223 (MQ=255) acTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTaaa < 1:1806048/289‑1 (MQ=255) ttttGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAagag < 2:1851421/289‑1 (MQ=255) tGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGc > 1:2137071/1‑203 (MQ=255) gCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGt > 1:762425/1‑289 (MQ=255) aTGGGTTACGAGCACCGGTGGTTTATGCCTGTCCTACTCCGCGAGAAGCAGAAGAGTCCGCTTCAACAAGCGTGGCCGGTCCGTGGGTAGGGAAAGGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCgg < 2:517401/289‑1 (MQ=255) aTGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCgg < 1:2956059/289‑1 (MQ=255) cTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGa < 2:1527390/134‑1 (MQ=255) aCCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGa < 2:2252222/131‑1 (MQ=255) aCCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAag > 1:3030961/1‑269 (MQ=255) aCCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCgtt > 1:1607958/1‑289 (MQ=255) ccAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAgcggg > 1:1741767/1‑122 (MQ=255) ccAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATc < 1:3122324/202‑1 (MQ=255) cAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGatat > 1:2401519/1‑259 (MQ=255) cAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGatat < 2:2401519/259‑1 (MQ=255) aCCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCa < 2:1309083/209‑1 (MQ=255) aCCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCa > 1:1309083/1‑209 (MQ=255) ggTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAAAGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGt < 2:2195168/289‑1 (MQ=255) gTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAgcggg > 2:1948018/1‑113 (MQ=255) gTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTa > 2:595601/1‑289 (MQ=255) gTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCAAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATGTCGGTGCAGTTGTTGACCGTa > 1:2885768/1‑289 (MQ=255) tGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTa > 1:1409443/1‑185 (MQ=255) tGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCcg > 2:745478/1‑288 (MQ=255) ccTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCcgtcg > 1:2932496/1‑289 (MQ=255) actactCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTgg < 1:276167/289‑1 (MQ=255) actCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGCATCTCGGTGGCGTTGTTGACAGCAGTACCcatcgcgggggct > 2:1790331/1‑281 (MQ=255) ctCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAagca < 1:997794/221‑1 (MQ=255) ctCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGGGTGGTCtt > 1:2670759/1‑289 (MQ=255) tCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGt < 2:788175/268‑1 (MQ=255) tCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCttt < 1:1191338/289‑1 (MQ=255) tCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCttt < 1:690736/289‑1 (MQ=255) cgcgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCg > 1:1721943/1‑157 (MQ=255) cgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAgcggg < 2:1977156/89‑1 (MQ=255) cgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCa > 1:776306/1‑151 (MQ=255) cgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCa < 2:776306/151‑1 (MQ=255) cgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGAcc > 1:2236040/1‑262 (MQ=255) cgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGtgtg < 2:2038863/279‑1 (MQ=255) cgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGtgtg > 1:2038863/1‑279 (MQ=255) cgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATg > 1:428000/1‑288 (MQ=255) cgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATg > 1:1082441/1‑288 (MQ=255) cgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCTCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATGGc < 1:3064880/288‑1 (MQ=255) aaGCAGAGGAGGCCGCTTCAAAAATGGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTATAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATGGCCt < 2:3309135/288‑1 (MQ=255) ||| CCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTAGTAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATGGCCTCC > CP042583/625677‑626225 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |