| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 634,313 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 634,313 | 0 | A | T | 100.0% | 885.1 / NA | 367 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (193/174); total (193/174) | |||||||||||
| * | CP042583 | 634,314 | 0 | G | C | 99.7% | 871.8 / NA | 367 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (193/172); minor base T (0/1); total (193/174) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 634,315 | 0 | C | G | 99.5% | 874.9 / ‑5.9 | 367 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (191/174); minor base T (2/0); total (193/174) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 367 total aligned reads displayed.
ATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGAGCCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGCGCCGCTGGCAATCGAAGGTCT > CP042583/634036‑634593 ||| gATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCt < 1:3304221/289‑1 (MQ=255) aTCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGC‑‑GTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTg > 1:2500552/1‑288 (MQ=255) aCCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGAc < 2:29131/289‑1 (MQ=255) tGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCt < 2:2156995/289‑1 (MQ=255) ttttGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCTCCTGACGCTCGGTTTGGCGTTctt > 2:472018/1‑287 (MQ=255) cgTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCa > 2:1038273/1‑289 (MQ=255) aCGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTGGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCGTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCAGGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTGACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTAGGGAAAc > 1:2741381/1‑289 (MQ=255) gTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCCCTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACgg > 1:1659646/1‑289 (MQ=255) gTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACgg > 1:2672395/1‑289 (MQ=255) gTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACgg < 2:1519344/289‑1 (MQ=255) gggATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCt > 1:1321677/1‑252 (MQ=255) gggATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTc < 1:2808200/289‑1 (MQ=255) ggATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATTTAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCa < 2:2746966/227‑1 (MQ=255) ggATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCt > 1:2190924/1‑289 (MQ=255) ggATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCt > 2:2184763/1‑289 (MQ=255) aTCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTAc > 1:463424/1‑289 (MQ=255) aTCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTAc > 2:2236868/1‑289 (MQ=255) cAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGAc > 2:933104/1‑211 (MQ=255) tttGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACcg < 1:1624105/210‑1 (MQ=255) aGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGTTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCCCTTCCTTTTTGTCCCATTGACGCCCGGTATGCCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAACCGGTCTACGTcccttc > 2:1967876/1‑284 (MQ=255) aGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGaaa > 1:810391/1‑272 (MQ=255) gTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAATGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCTCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCCCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATCATGGAAACGGCCTACGTCCTCTCCGTCAAACAGATTaat > 2:2515364/1‑289 (MQ=255) tttGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGaaa > 1:1577625/1‑256 (MQ=255) ttctttACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTTTGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGa > 2:2394176/1‑288 (MQ=255) ttctttACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGa > 1:1865471/1‑288 (MQ=255) ttctttACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGa > 2:63356/1‑288 (MQ=255) gTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACcg > 2:1720069/1‑169 (MQ=255) gCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAgttgt < 2:3308279/288‑1 (MQ=255) cATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGttt > 2:2319938/1‑289 (MQ=255) caTGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTtgtg > 1:2602469/1‑175 (MQ=255) caTGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTtgtg < 2:2602469/175‑1 (MQ=255) caTGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTa < 2:1915685/191‑1 (MQ=255) tGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCa > 1:3254186/1‑288 (MQ=255) tATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCctg < 2:1607905/197‑1 (MQ=255) tATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTtat > 2:784444/1‑245 (MQ=255) tgatgaAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACcg > 1:1015341/1‑145 (MQ=255) tgatgaAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGaaa > 2:1473674/1‑211 (MQ=255) tgatgaAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTAc < 1:910281/219‑1 (MQ=255) tttaaatggtTCAAAAAAATTTCGATTTGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGct < 2:3029807/281‑1 (MQ=255) gaAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTtat > 2:552576/1‑239 (MQ=255) aaGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTTCGGCAAACCGCTTTATAAATATATGACCATGGTCTGGGGCAGGTTGTTTGGTACCAACTTGTCTCTgg > 2:2448248/1‑289 (MQ=255) aGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGAc > 2:2956151/1‑136 (MQ=255) aGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTggg > 1:623408/1‑289 (MQ=255) gtgtTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTTTGCCACTGACCCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATAACCAATTTCTGGGCCAAGTTGTTTGGTATCAATTTCGCTCTGGgt > 1:953699/1‑289 (MQ=255) gtgtTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCctgct < 1:3021990/189‑1 (MQ=255) gtgtTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGc < 2:1647098/192‑1 (MQ=255) gtgtTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGaaa < 2:2725719/203‑1 (MQ=255) gtgtTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGaaa > 2:1390719/1‑203 (MQ=255) gtgtTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGata > 1:2452315/1‑242 (MQ=255) gtgtTAAAAAAATTTTCTATTGGGGCATGCGGGTGACCTTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGgt < 2:2284739/289‑1 (MQ=255) ttCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGtgtg > 2:3280241/1‑289 (MQ=255) tCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAAc > 1:1767/1‑200 (MQ=255) tCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAAc < 2:1767/200‑1 (MQ=255) aTTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGt < 1:696798/289‑1 (MQ=255) aTTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGt < 1:635872/289‑1 (MQ=255) tttCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTc < 2:3218672/289‑1 (MQ=255) gCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAAc > 1:393081/1‑180 (MQ=255) aTGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTc < 1:2125595/188‑1 (MQ=255) aTGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTc > 2:2125595/1‑188 (MQ=255) tGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGaaa > 1:1724410/1‑176 (MQ=255) tGCGGGTGACCCTTTCTAACGGGGTTTACTCTCGGGGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTc < 2:1104180/289‑1 (MQ=255) tgACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGAtt < 1:2414344/199‑1 (MQ=255) aCCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCgg > 2:2620419/1‑289 (MQ=255) tttCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCCCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGTCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGTTGGGGCTATGGGTCTGAACATGGAGTTCCATTTCGGGAca > 2:2810421/1‑288 (MQ=255) tCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACg > 1:1025075/1‑128 (MQ=255) ggTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAAATTCGCTTGGGGTGTGGCTACCGTTCTGCCCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTcgt > 2:3114409/1‑287 (MQ=255) gTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGaa > 2:600410/1‑152 (MQ=255) gTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGa < 1:148092/151‑1 (MQ=255) gTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCtt < 1:2319938/288‑1 (MQ=255) ttCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTg < 2:417285/115‑1 (MQ=255) ttCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCt > 1:2796743/1‑120 (MQ=255) ttCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGaaa < 2:696310/152‑1 (MQ=255) ttCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAAc > 2:3064863/1‑153 (MQ=255) aCTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTAt < 1:1170267/289‑1 (MQ=255) ctcGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTAt < 2:1581346/286‑1 (MQ=255) tCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTa > 1:2640776/1‑232 (MQ=255) ttCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTa > 1:2266466/1‑289 (MQ=255) cATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATg > 1:772281/1‑242 (MQ=255) aTGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACcgcg < 2:881709/65‑1 (MQ=255) aTGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCt < 1:1397381/97‑1 (MQ=255) aTGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATgg > 1:3075186/1‑105 (MQ=255) aTGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTcc < 1:586866/272‑1 (MQ=255) aTGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCa < 1:3038061/274‑1 (MQ=255) gAGCAAGGGGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCg > 1:984123/1‑205 (MQ=255) gAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTc < 2:1175252/226‑1 (MQ=255) cATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc > 1:2237188/1‑288 (MQ=255) cATGACGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACt < 1:1680902/191‑1 (MQ=255) tgatgTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACt < 1:492220/261‑1 (MQ=255) ttAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAg < 2:953880/168‑1 (MQ=255) ttAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATg < 1:1255031/216‑1 (MQ=255) ttAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATg > 2:1255031/1‑216 (MQ=255) ttAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCa < 2:1678062/254‑1 (MQ=255) ttAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGCGCCGCTGGCaa > 1:2384786/1‑289 (MQ=255) aGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGCGCCGCTGGCAATc > 2:768764/1‑289 (MQ=255) atatAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCa < 2:2666317/126‑1 (MQ=255) tataGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGCGCCGCTGGCAATCGaa < 1:2953583/289‑1 (MQ=255) aGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCaaa > 1:2153035/1‑124 (MQ=255) aGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTaa > 1:2570054/1‑228 (MQ=255) aGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTcc > 1:1931394/1‑244 (MQ=255) tCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAgttgt > 2:2461389/1‑162 (MQ=255) ||| ATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGAGCCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGCGCCGCTGGCAATCGAAGGTCT > CP042583/634036‑634593 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |