New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP042583 | = 1921059 | 442 (1.230) | 42 (0.120) | 13/454 | 21.1 | 9.8% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | CP042583 | = 1921231 | 336 (0.950) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATAGGTGGTTACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP042583/1920769‑1921059 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gattTCCCTGATAAGGCAGTAAAATTTCTTAATAAAGAGTAATGTTACTGCAGGATGGCGTTCATGCGCCATCCTGTCTCATATCAAATTTTTCCAATCGCCACTAATTGTTCCATGCACATTTGTAGTAAAAACAGTGGACTGCCTTCTACCGGCTTTTCTTTAGCCAGCAAGCTAATCTGTCGATAGAAAGTTGGTTCGAGAGGAACGGAACACAATTCACCTGCAATGCTTTTCAGCGTTAACTCTGGTTGTAAGGCGATGCCTAATCCCTGTCGAATAAAATTCATCG < CP042583/1921231‑1920944 ATAGGTGGTTACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGA > 1:2498126/1‑289 TGGTTACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGCATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCg < 2:2692035/289‑2 GTTACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgtt > 1:816985/1‑286 GTTACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgtt > 2:819818/1‑286 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GTTACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgtt > 1:2264604/1‑286 GTTACCTGAGGAAAAGCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACAACGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGAAGAGATTCCACCAGCTACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTACTCAGGCGGATACAGCGAAGAATTTTATTCGACAGGGATTATGCATCGCCTTACAACAAGAGTTAAGGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTTCCGACCCAACTTTCTATCCACAGCTTTCgtt > 2:1603085/1‑286 TTACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttg < 2:1708808/289‑5 TTACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttg > 1:1294794/1‑285 TTACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgtt > 2:619505/1‑285 TTACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTAACCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCTACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgtt > 1:2676856/1‑285 ttCCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGGATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttg < 2:2976976/286‑5 TACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttg < 2:2086358/288‑5 TACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttg < 1:2504082/288‑5 TACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgtt > 1:2269224/1‑284 TACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgtt > 2:646342/1‑284 TACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgtt > 1:2044713/1‑284 AGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCCCTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttgctggcta > 2:1609198/1‑278 AGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttgctggcta > 1:1007336/1‑278 AATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttg > 1:2336155/1‑249 AATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttg < 2:2336155/253‑5 GAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttgctggc < 1:146160/255‑10 GAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttgctggc > 2:146160/1‑246 ACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgtt < 1:788238/185‑4 ACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgtt > 2:788238/1‑182 CGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttg < 1:2465331/163‑5 CGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttg > 2:2465331/1‑159 CGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttg < 1:2959761/163‑5 CGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttg > 2:2959761/1‑159 CGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttg > 2:2041619/1‑118 CGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCgttg < 1:2041619/122‑5 CGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCCCTGATAAGGCAGTAAAATTTCTTAATAAAGAGTAAT > 1:2818128/1‑124 CGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCCCTGATAAGGCAGTAAAATTTCTTAATAAAGAGTAAT < 2:2818128/124‑1 CAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCCCTGATAAGGCAGTAAAATTTCTTAATAAAGAGTAATGTTACTGCAGGATGGC < 2:482489/105‑1 CAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATTTCCCTGATAAGGCAGTAAAATTTCTTAATAAAGAGTAATGTTACTGCAGGATGGC > 1:482489/1‑105 ATTTCCCTGATAATGCAGTAAAATTACTTAATAAAGAGTACTGTTACTGCAGGATGGCGTTCATGCGCCGTCCTGTCTCATATCAAATTTTTCCAATCGCCACTAATTGTTCCATGCACATTTGTAGTAAAAACAGTGGACTGCCTTCTACCGGCTTTTCTTTAGCCAGCAACGAAATCTGTCGATAGAAAGTTGGTTCGAGAGGAACGGAACACAATTCACCTGCAATGCTTTTCAGCGTTAACTCTGGTTGTAAGGCGATGCCTAATCCCTGTCGAATAAAATTCAT < 2:2757868/289‑1 ATTTCCCTGATAAGGCAGTAAAATTTCTTAATAAAGAGTAATGTTACTGCAGGATGGCGTTCATGCGCCATCCTGTCTCATATCAAATTTTTCCAATCGCCACTAATTGTTCCATGCACATTTGTAGTAAAAACAGTGGACTGCCTTCTACCGGCTTTTCTTTAGCCAGCAACGAAATCTGTCGATAGAAAGTTGGTTCGAGAGGAACGGAACACAATTCACCTGCAATGCTTTTCAGCGTTAACTCTGGTTGTAAGGCGATGCCTAATCCCTGTCGAATAAAATTCA > 2:1311752/1‑288 TTCCCTGATAAGGCAGTAAAATTTCTTAATAAAGAGTAATGTTACTGCAGGATGGCGTTCATGCGCCATCCTGTCTCATATCAAATTTTTCCAATCGCCACTAATTGTTCCATGCACATTTGTAGTAAAAACAGTGGACTGCCTTCTACCGGCTTTTCTTTAGCCAGCAACGAAATCTGTCGATAGAAAGTTGGTTCGAGAGGAACGGAACACAATTCACCTGCAATGCTTTTCAGCGTTAACTCTGGTTGTAAGGCGATGCCTAATCCCTGTCGAATAAAATTCATCG < 1:1550036/289‑1 TTCCCTGATAAGGCAGTAAAATTTCTTAATAAAGAGTAATGTTACTGCAGGATGGCGTTCATGCGCCATCCTGTCTCATATCAAATTTTTCCAATCGCCACTAATTGTTCCATGCACATTTGTAGTAAAAACAGTGGACTGCCTTCTACCGGCTTTTCTTTAGCCAGCAACGAAATCTGTCGATAGAAAGTTGGTTCGAGAGGAACGGAACACAATTCACCTGCAATGCTTTTCAGCGTTAACTCTGGTTGTAAGGCGATGCCTAATCCCTGTCGAATAAAATTCATCG < 1:1613606/289‑1 TTCCCTGATAAGGCAGTAAAATTTCTTAATAAAGAGTAATGTTACTGCAGGATGGCGTTCATGCGCCATCCTGTCTCATATCAAATTTTTCCAATCGCCACTAATTGTTCCATGCACATTTGTAGTAAAAACAGTGGACTGCCTTCTACCGGCTTTTCTTTAGCCAGCAACGAAATCTGTCGATAGAAAGTTGGTTCGAGAGGAACGGAACACAATTCACCTGCAATGCTTTTCAGCGTTAACTCTGGTTGTAAGGCGATGCCTAATCCCTGTCGAATAAAATTCATCG < 2:2247396/289‑1 TTCCCTGATAAGGCAGTAAAATTTCTTAATAAAGAGTAATGTTACTGCAGGATGGCGTTCATGCGCCATCCTGTCTCATATCAAATTTTTCCAATCGCCACTAATTGTTCCATGCACATTTGTAGTAAAAACAGTGGACTGCCTTCTACCGGCTTTTCTTTAGCCAGCAACGAAATCTGTCGATAGAAAGTTGGTTCGAGAGGAACGGAACACAATTCACCTGCAATGCTTTTCAGCGTTAACTCTGGTTGTAAGGCGATGCCTAATCCCTGTCGAATAAAATTCATCG < 1:2153724/289‑1 ATAGGTGGTTACCTGAGGAAAATCTTAATGAAACGTGTCGTATTAATGAATTTCTTTTGCCACTACTAGCTTGACACCGCTTTTACCCTTCATTTGCAGCGCATAGATTCCACCAGCCACTACCACTAATAGTGCGCCCAGCAGATAAAATGTGAATTTAATCAGGCGGATACAGCGATGAATTTTATTCGACAGGGATTAGGCATCGCCTTACAACCAGAGTTAACGCTGAAAAGCATTGCAGGTGAATTGTGTTCCGTTCCTCTCGAACCAACTTTCTATCGACAGATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP042583/1920769‑1921059 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gattTCCCTGATAAGGCAGTAAAATTTCTTAATAAAGAGTAATGTTACTGCAGGATGGCGTTCATGCGCCATCCTGTCTCATATCAAATTTTTCCAATCGCCACTAATTGTTCCATGCACATTTGTAGTAAAAACAGTGGACTGCCTTCTACCGGCTTTTCTTTAGCCAGCAAGCTAATCTGTCGATAGAAAGTTGGTTCGAGAGGAACGGAACACAATTCACCTGCAATGCTTTTCAGCGTTAACTCTGGTTGTAAGGCGATGCCTAATCCCTGTCGAATAAAATTCATCG < CP042583/1921231‑1920944 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |