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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (170/153); minor base C (1/0); total (171/153) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
CGCAGATCCGGCGTTTCGACGGTTTTCGGGGTAAATTCAGCAGTCGGGCTAACGAAACCAATCTGCCCGTGATACGGCTTGTCCGGGCGACCATCGGTATAAAGCAGCACTTTGCGCCCCGGCTGGGCCTGGTCAAGATTACGTTCATCAACATAAGCGCGCACCCACACCGGACGCGTTAGACTAAC‑GGTAAACACCGTGCCACCTTCATTGAGGACCGTGCCTGGCTCCACCGCGCGCGTTAACAGCGTGCCATCAGACGGGGCTATCAACGTACTGTCCTGTAAATTCAACTCCGCCTGCGCCAGTTGCGCCTGCGCCTGTTCGAGGCTGGCTTTCGCCTGAGCGATGTCCTGTTCACGGTTACCGGAACGGTACTGACGCAATTTATCCTGTG‑CACTTTTCAGCGTTGCCTGCGCCTGGTCGCGGCTGGAGCGGGCATTTTCCAGGTCATTTGCGCTAATAGTGCGGCTTTTCCACAACCCTTGCTGGCGGTTATAGAAGTTCTGCGCATAGTCATAGGCGGCTTGCGCCTGTTTCACCGCTGCGGCGGCCTG > CP042583/691956‑692512 ||| cGCAGATCCGGCGTTTCGACGGTTTTCGGGGTAAATTCAGCAGTCGGCGAAACGAAACCAATCTGCCCGTGATACGGCTTGTCCGGGCGACCATCGGTATAAAGCAGCACTTTGCGCCCCGGCTGGGCCTGGTCAAGATTACGTTCATCAACATAAGCGCGCACCCACACCGGACGCGTTAGTGAAAC‑GGTAAACACCGTGCCACCTTCATTGAGGACCGTGCCTGGCTCCACCGCGCGCGTTAACAGCGTGCCATCAGACGGGGCTATCAACGTTGAGTCCTGTAAAt < 1:1671565/289‑1 (MQ=255) 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CGCAGATCCGGCGTTTCGACGGTTTTCGGGGTAAATTCAGCAGTCGGGCTAACGAAACCAATCTGCCCGTGATACGGCTTGTCCGGGCGACCATCGGTATAAAGCAGCACTTTGCGCCCCGGCTGGGCCTGGTCAAGATTACGTTCATCAACATAAGCGCGCACCCACACCGGACGCGTTAGACTAAC‑GGTAAACACCGTGCCACCTTCATTGAGGACCGTGCCTGGCTCCACCGCGCGCGTTAACAGCGTGCCATCAGACGGGGCTATCAACGTACTGTCCTGTAAATTCAACTCCGCCTGCGCCAGTTGCGCCTGCGCCTGTTCGAGGCTGGCTTTCGCCTGAGCGATGTCCTGTTCACGGTTACCGGAACGGTACTGACGCAATTTATCCTGTG‑CACTTTTCAGCGTTGCCTGCGCCTGGTCGCGGCTGGAGCGGGCATTTTCCAGGTCATTTGCGCTAATAGTGCGGCTTTTCCACAACCCTTGCTGGCGGTTATAGAAGTTCTGCGCATAGTCATAGGCGGCTTGCGCCTGTTTCACCGCTGCGGCGGCCTG > CP042583/691956‑692512 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |