| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 699,596 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 699,596 | 0 | A | T | 99.3% | 642.9 / NA | 281 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (122/154); minor base G (0/2); total (125/156) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 699,597 | 0 | G | C | 99.3% | 649.5 / NA | 281 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (124/153); total (125/156) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 699,598 | 0 | C | G | 99.3% | 651.6 / NA | 281 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (123/156); total (125/156) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.97e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
GGAACAAGAAGCGAAATTAGTTGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATAGTCATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACAGC‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGC > CP042583/699322‑699877 ||| ggAACAAGAAGCGAAATTAGTTGCCGATCATCTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCgg < 1:2867506/288‑1 (MQ=255) aaaTTAGTTGCCGGTCATTTAATCGCGGCAAACCGGGCAGGGCATAATTCACATGGTATTGGCAAGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGAGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATGGGCCGTATCGGTTACt < 1:725915/289‑1 (MQ=255) aaTTAGTTGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACt < 1:430117/288‑1 (MQ=255) aaTTAGTTGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACt < 1:2895188/288‑1 (MQ=255) ttAGTTGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGAAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTggg < 1:1955022/289‑1 (MQ=255) ttcggatactttAATCGCGACAAACCGTGAAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATGCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTAACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAg < 2:2309187/280‑1 (MQ=255) tGCCGCTCTTTTAACGGCGGAAAACCGGGACGGGCAGGATTCACAGGGTGTTAGCATGATCCCAATCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAg < 2:1802828/289‑1 (MQ=255) aTCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAgtg > 1:557261/1‑289 (MQ=255) aTCCCGGCAAACCGGGAAGGGACTGATTCGACTGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATCTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAgcgg < 2:2074777/289‑1 (MQ=255) ggCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCCCGGTATTGCCGCCGTGGCGCCACATAACTCG‑CACCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGGAACGTGTGCAGTCGCgggg > 2:727031/1‑289 (MQ=255) cAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCAAATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGCGCAGTGTGCAGCGGCGGGGtt > 1:236078/1‑289 (MQ=255) gCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCa < 1:2603158/288‑1 (MQ=255) gCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCa < 1:2025642/288‑1 (MQ=255) cATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGt > 1:1112675/1‑228 (MQ=255) tATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGCAAGCGTATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGt < 1:1851690/288‑1 (MQ=255) tATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGt < 1:839662/288‑1 (MQ=255) gaTTGGCCTGATCCCCAGCTATGTACGCTCCGGGAGTCAGGGGAACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGt < 2:830485/287‑1 (MQ=255) tGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATAAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGACGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGt < 1:2537409/289‑1 (MQ=255) ggCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACt > 1:2326101/1‑229 (MQ=255) gATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCa > 1:228225/1‑289 (MQ=255) aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑catcat > 1:336012/1‑204 (MQ=255) aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTggg < 2:2916628/226‑1 (MQ=255) aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGGGCAGTTTGCAGCGGCGGGGTTTGGCCTCATCCACTTTGTTAGCGTGGGCGGTATTCCaa > 2:459936/1‑289 (MQ=255) aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCa > 1:2496147/1‑263 (MQ=255) aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGt > 1:778692/1‑278 (MQ=255) aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCaa > 1:1902553/1‑289 (MQ=255) aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCaa > 1:1525402/1‑289 (MQ=255) aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCaa > 1:383880/1‑289 (MQ=255) ccAAGCTATATACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCACCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑gg < 1:157387/289‑1 (MQ=255) tATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCGCATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTcgcg < 2:383880/288‑1 (MQ=255) tGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGcc < 2:892733/200‑1 (MQ=255) tGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCg > 1:1831817/1‑289 (MQ=255) tCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGt < 1:3030079/260‑1 (MQ=255) tCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACg > 1:2149743/1‑289 (MQ=255) tCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCCCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGGTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGGTCGCG‑CGTTcccc > 2:1323264/1‑286 (MQ=255) tGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCCTTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCGGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACAT‑ACATCGCATCATCTCGCCCGTATCGGTTACTTGGCGGAGCAGCTTGCAGCGGCGGGGTTCGTCCCTATCCCCTTTGTTACCGTGGTCGGGATTCCCAT‑GGTTGGCCCCTTCCCCGGt > 2:3128265/1‑288 (MQ=255) tGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAgcgg < 2:2840343/223‑1 (MQ=255) tGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCa < 2:3117395/242‑1 (MQ=255) aGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTa < 1:95401/193‑1 (MQ=255) aGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGt > 1:2724027/1‑250 (MQ=255) aGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGAACGCGCCTTTGGTCCGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGACTGAGAAAGCGCATCACCACGGTCTTGCCGTCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATAACGGCCGTATCGGGTACTGGGCCGCGGCGTGTGCAGCGGCGGGGGCTGGTTCCATCCCCTTTGTTTGCGGGGCAGGTGTTCCCAT‑TGTCGCTCCCGTCCCCggctcgca > 2:2779552/1‑280 (MQ=255) aGGGGAACCTCAAAATTAACCACCAGGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGTTGGCGATCGGGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACa < 2:2651786/288‑1 (MQ=255) gggCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCTCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAgcggcg > 1:666311/1‑216 (MQ=255) gggCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGcc > 1:994530/1‑289 (MQ=255) cAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGGATTCCAAT‑GGTCGCGCCGCTCCACGGTCTCGACAGCCGCCTTTGc > 2:302014/1‑288 (MQ=255) cAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTCTGTCTCTACCCACTCTGGTGGCGTGGTCGGGATTCCAAT‑GGGCGCGCCGGTCCACGGGCCCGACACCCGCGTTGGc > 2:1854766/1‑288 (MQ=255) aaaTTACCCATCATGCCAAAACGGTTAAAGGGGGGGGGGGGGCGGTCACGTTGGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCTAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCa < 2:955310/288‑1 (MQ=255) aaaTTAACCCACATGCCAAAACCGGTAAGGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTGGAGGGCGAGCGCGGATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAGAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCa < 2:2865522/288‑1 (MQ=255) aaaTTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCa < 2:1831817/288‑1 (MQ=255) aaaTGAACCATGGTGCCCAAACCGGTAGGGGCGCGGGGGCGGCGTTCACGCTGGGTGGCGTTCTGGGGTTTGGTCAGGTCGCGGCGAGTGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGGGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCa < 2:66689/288‑1 (MQ=255) aaTTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCa < 2:1543355/287‑1 (MQ=255) aCCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAgcggcg < 1:2217360/200‑1 (MQ=255) gCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTa < 1:122795/167‑1 (MQ=255) gCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTa > 2:122795/1‑167 (MQ=255) gCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCCCGGGCGCGACAGCGGCTTTGGCACCAACCCGTGTtgtg > 1:2944762/1‑289 (MQ=255) gCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTgg < 1:2192040/272‑1 (MQ=255) aaaCCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCg > 2:2178337/1‑170 (MQ=255) aaCCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGGTTGGCTCCAACCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTTCa > 2:2987370/1‑229 (MQ=255) ccGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGtttt < 2:643163/289‑1 (MQ=255) gTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAAt > 1:1987765/1‑270 (MQ=255) gTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAAt < 2:1987765/270‑1 (MQ=255) gCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAg < 1:3126367/159‑1 (MQ=255) gCGGGGGCGGCGATCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTTAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTTCTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGGTTGTCTCTTTCCACCTTGTTTGCGTGTTCGGGTTTTCCAT‑GGTCTGGCCGTTCCACCGTCTCACCGACCGCTTTGGCAACACATCGTTCTGTTTTGTTTTCCCTCGTGAAg > 2:2020381/1‑289 (MQ=255) cACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCAGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCt < 1:1356862/288‑1 (MQ=255) gCTCGATGGGGACGGCGCATTTGGGCAGGTCGCGGCAACTGAAGCGATGGCGCTGGGAATTGAGAATGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTg < 2:2228334/289‑1 (MQ=255) gCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTg < 1:460092/289‑1 (MQ=255) gtCGATGGCGATCGGGCAGTTGGGCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTg < 2:2383786/287‑1 (MQ=255) cGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGAGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTcgcg > 2:1409688/1‑205 (MQ=255) aTGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCa < 2:2796944/169‑1 (MQ=255) aTGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCa > 1:2796944/1‑169 (MQ=255) gATCGGGCATTTGGTCGGGTCGCGGCACAGGAGGCGGTGGCGGTGGGGATTGAGAAGGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTAc < 2:1912782/288‑1 (MQ=255) cgcATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGccacc > 1:2844685/1‑289 (MQ=255) aTTTGGACAGGTGGCGGCCAGTGAGGCGAGGGGGCTGGGGATTGGCAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGGGGCGCTACATACCTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAg < 2:2532892/288‑1 (MQ=255) ggTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCa < 1:2387236/289‑1 (MQ=255) tCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCAt < 1:1816728/288‑1 (MQ=255) aTGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCg > 1:2417851/1‑101 (MQ=255) aTGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCg < 2:2417851/101‑1 (MQ=255) tGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCCATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTgg > 1:1923840/1‑282 (MQ=255) cGATGGCGCTGGGTATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCcgcg < 1:676643/288‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTggg < 1:2097766/90‑1 (MQ=255) gcgtTGGGGATTGCGAAAGCGCATCAGCACGGTATGTCCGACGTGGCGCTACATAACTGG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGGGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGcc < 2:1343602/288‑1 (MQ=255) gcgcTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTCTTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGcc < 1:1775236/288‑1 (MQ=255) cgcTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTg > 1:1509729/1‑289 (MQ=255) cTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCgg > 2:1608117/1‑140 (MQ=255) cTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTg > 1:1015091/1‑241 (MQ=255) tGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAAt < 1:2683836/184‑1 (MQ=255) tGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGc < 1:1129954/224‑1 (MQ=255) gcgcATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCAt < 2:573597/250‑1 (MQ=255) aCGGTATGGCCGCCGTGGCGCTACATAACTGG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAg < 1:1475888/288‑1 (MQ=255) cGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCa > 2:1960148/1‑161 (MQ=255) tATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTg > 2:2397358/1‑288 (MQ=255) aTTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATGGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGcc < 1:3002452/289‑1 (MQ=255) ccgccgTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCt < 2:1135352/199‑1 (MQ=255) ccgccgTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGAt > 1:3080776/1‑289 (MQ=255) cgccgTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGAtt < 1:2397358/289‑1 (MQ=255) ccgTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTcc > 2:1515066/1‑264 (MQ=255) gTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCa < 2:1929079/83‑1 (MQ=255) gTGGCGCTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCCTCGCCTGGCATAAAGGCGGCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCCGATTGACg > 2:104760/1‑289 (MQ=255) cgcTACATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGAtt < 1:640471/281‑1 (MQ=255) aCATAACTCG‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTGTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGc < 2:2149743/289‑1 (MQ=255) ||| GGAACAAGAAGCGAAATTAGTTGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATAGTCATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACAGC‑CATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAAT‑GGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGC > CP042583/699322‑699877 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |