Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 461,901 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 461,901 | 0 | A | T | 99.2% | 838.5 / ‑1.1 | 352 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base T (186/162); minor base C (3/0); total (189/163) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.52e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.36e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 461,902 | 0 | G | C | 98.6% | 820.5 / ‑6.0 | 352 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/1); new base C (185/162); total (189/163) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.78e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 461,903 | 0 | C | G | 98.6% | 825.4 / 7.1 | 352 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (185/161); minor base . (4/1); total (189/163) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.79e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 |
Only 100 of 352 total aligned reads displayed.
CTTGATGATGTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTAGTCAAAGTCTTAATGACTTTGGCAGCCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTAGCGATAGTGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TAGC‑CTCAGTTTTAGCTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTAGTGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCAGCAATAATGGGTACACGGGCAGC > CP042583/461631‑462161 ||| tgatgaTGTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAggg < 2:1663526/289‑1 (MQ=255) gTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCg > 2:1945286/1‑289 (MQ=255) aTCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATaacga < 1:667011/289‑1 (MQ=255) cgtcgAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATaacgaa > 2:2146932/1‑288 (MQ=255) tcgAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATAAGTGGTATCAGGCGGGGTATAGCAGCAGCTGGGTTGGCATTAGTTA‑TTCG‑CTCTCCTTTTCGTGGAATGAATCCGTAGGGATCGCCGATCACGAAGGt > 2:1731157/1‑289 (MQ=255) cgAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTa < 1:1731157/289‑1 (MQ=255) tgggagggTAAGAATCGGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAAGTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCTGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGt < 2:3079311/284‑1 (MQ=255) gggTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGa < 1:1945286/288‑1 (MQ=255) cGAATATGATTACGACGCTGAGCATCGAGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAAATTACGCTATAGCCGTAAAGACCGACTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTTGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTCTCAGTAGGGGTATACCAGCAGCTGAGTCGGCCTCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGATATTGTAGGGATCCCGGATAACTAACGTATTGTCAGTCTTaac > 2:2936123/1‑288 (MQ=255) atatGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGt < 1:378420/276‑1 (MQ=255) atatGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGACACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGt > 2:378420/1‑276 (MQ=255) gATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGtttcag > 1:2905724/1‑285 (MQ=255) tGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCATAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAAt > 1:3128611/1‑289 (MQ=255) aGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTTGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCCAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCCTTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACTAACGTATTTTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTCCAATGt > 1:861433/1‑289 (MQ=255) aGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTaa > 1:2988562/1‑268 (MQ=255) aGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGt > 1:2757531/1‑289 (MQ=255) cagcgctgtGAACCGGTAATCGGTAGTTACAACAATTTACGTTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACGTAATGACGTTGGCTCGCTTTATTTTTCTGGTAGCCATCAAAAGTACTGGAAGACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGTGGTGTACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAGCGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGttt < 2:2615148/281‑1 (MQ=255) cgcgATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTg > 2:2430350/1‑288 (MQ=255) cgATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGAcc > 1:2380771/1‑289 (MQ=255) tGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGTAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCaa > 1:1395737/1‑288 (MQ=255) tGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCaaa < 2:2267711/289‑1 (MQ=255) tAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCt < 1:780113/288‑1 (MQ=255) cGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGttt > 1:1264451/1‑250 (MQ=255) cGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAACCGTCGCTacac > 2:961968/1‑288 (MQ=255) cGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTacac > 2:1868329/1‑288 (MQ=255) tGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCg > 1:556096/1‑237 (MQ=255) aTTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGa < 1:2146932/289‑1 (MQ=255) cacaATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAggg < 1:1989893/204‑1 (MQ=255) aattACCCTTTAGCCTTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCATAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCt < 2:3128611/287‑1 (MQ=255) tttACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTc > 2:1217721/1‑289 (MQ=255) aCGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGAc < 2:1340811/289‑1 (MQ=255) aGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCgcgcct > 1:1197707/1‑287 (MQ=255) ccGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCACCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCttt < 1:1141978/289‑1 (MQ=255) ttGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGt > 1:1823435/1‑197 (MQ=255) tGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACg > 1:261500/1‑288 (MQ=255) gCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGcc < 1:1546268/289‑1 (MQ=255) gTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCAGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAAc < 2:1107567/289‑1 (MQ=255) ttcacaatcacTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACcg < 2:735817/245‑1 (MQ=255) ttcacaatcacTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACcg > 1:735817/11‑255 (MQ=255) tcccaataacTTGATGACTTTGGCTCGCTTTAAATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACGTCGGATTCAGATACGGTGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCa < 2:2757531/280‑1 (MQ=255) atcacTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACggg < 1:2419286/285‑1 (MQ=255) tcacTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGAcc > 2:1146128/4‑247 (MQ=255) tggctcgcTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGAc < 2:2028563/225‑1 (MQ=255) tggctcgcTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAgctggctg > 1:1601577/8‑289 (MQ=255) ctcgcTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCtggctggc < 1:2048861/284‑1 (MQ=255) cTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATaacga < 1:1755002/146‑1 (MQ=255) cTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGgtt > 1:1027574/1‑288 (MQ=255) cTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGgtg > 1:636586/1‑289 (MQ=255) tttATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGtttcag > 1:1648050/1‑167 (MQ=255) tatTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGt < 2:2312386/289‑1 (MQ=255) cTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGAcc > 2:157684/1‑216 (MQ=255) cTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGAc < 1:2662364/289‑1 (MQ=255) cATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACg < 2:3005046/229‑1 (MQ=255) cATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTgg > 1:2326464/1‑289 (MQ=255) aTCAAAAATACTGGAATCCTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGa < 1:3157721/289‑1 (MQ=255) aTCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGttt < 2:1628502/150‑2 (MQ=255) aTCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCaaa < 1:1452706/176‑1 (MQ=255) aTCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGa > 1:985164/1‑289 (MQ=255) aTCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGa > 1:2846365/1‑289 (MQ=255) aTCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGa < 1:715810/289‑1 (MQ=255) aaaaTACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGc < 1:2830936/289‑1 (MQ=255) cTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAAc < 1:2019270/289‑1 (MQ=255) cttcggattcagATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCca > 2:354890/12‑277 (MQ=255) cttcggattcagATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCca < 1:354890/266‑1 (MQ=255) ttcggattcagATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTa > 1:1092750/11‑288 (MQ=255) attcagATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACt > 2:3185621/6‑118 (MQ=255) gATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGctggctgg < 2:2831855/235‑1 (MQ=255) tACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTTGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGc < 1:1320951/286‑1 (MQ=255) tttCAGGTGGGGTTTACCAGCAACTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGAt < 2:485285/286‑1 (MQ=255) ttacAGGTGGGGTATACCAGCCGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGAt < 2:2846365/285‑1 (MQ=255) tATCATGTGGTGTATACCAGCGGCTAGGTTGGGATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCATAGAGTGAATCTGTAGGGATCCCCGATGACTACCGTATTGTCGGACTTACTGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAACCGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGAAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTATGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGAt < 2:861433/288‑1 (MQ=255) tCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACTGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATAcc < 2:1996341/289‑1 (MQ=255) cAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATGTTCGTGGAATGGATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAAGGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATAcct < 1:1862382/289‑2 (MQ=255) gTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGcc > 2:2493409/1‑250 (MQ=255) gTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGcc < 1:2493409/250‑1 (MQ=255) gggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAAc < 2:2197508/186‑1 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCa > 2:691919/1‑126 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAAc < 1:3072668/129‑1 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTTCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTa > 2:405229/1‑259 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAAc > 2:2721211/1‑185 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTgg > 1:2126807/1‑229 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATAcctcgaata < 2:609251/288‑8 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTGATCACGTAAGCCAGGGTGCTAcgccgaataa > 2:563428/1‑280 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCCTACTGGAAGGCCACAACCTGCGTTACCACGTAAGCCAGGGTGCTAcctcgaatac > 2:1417051/1‑281 (MQ=255) tataCCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGaataat < 1:936340/288‑1 (MQ=255) taCCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGcc > 1:2275735/1‑178 (MQ=255) taCCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATAcctcgaat < 1:2207572/283‑7 (MQ=255) taCCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATg > 1:507282/1‑287 (MQ=255) ccAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATgcg > 2:537746/1‑146 (MQ=255) cagcagCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTac > 1:453464/1‑289 (MQ=255) cagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGctggctgg < 2:823382/206‑1 (MQ=255) cagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGa > 1:2697706/1‑231 (MQ=255) cagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGa < 2:2697706/231‑1 (MQ=255) cagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATg < 1:1686995/281‑1 (MQ=255) cagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATg > 2:1686995/1‑281 (MQ=255) cagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACg > 1:3186430/1‑289 (MQ=255) gcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCtggctggc < 2:17796/205‑1 (MQ=255) ttggTTGGCATCATTTATTCGCTCTCA‑TTTTAG‑TGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATTTTTCAGTGCCTTTCCATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGc < 2:2123220/286‑1 (MQ=255) tGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGc < 1:842260/288‑1 (MQ=255) ggTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGGTTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCAAGTGGGCTACCTCGAATACTGGGTAAACGGGccgg > 2:1465864/1‑286 (MQ=255) ||| CTTGATGATGTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTAGTCAAAGTCTTAATGACTTTGGCAGCCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTAGCGATAGTGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TAGC‑CTCAGTTTTAGCTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTCGGACTTAATGTTAGTGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCAGCAATAATGGGTACACGGGCAGC > CP042583/461631‑462161 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |