| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 731,284 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 731,285 | 0 | G | C | 100.0% | 765.3 / NA | 322 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (176/146); total (176/146) | |||||||||||
| * | CP042583 | 731,286 | 0 | C | G | 99.7% | 763.3 / NA | 322 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (176/145); minor base T (0/1); total (176/146) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.53e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
CGCTGGATGTCACTATTCAGGCGCAGATCCTGCAATTAATCAAAGTATTGCAAAAAGAGATGAGCATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATAAGCCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCATGCCGTTGAGAAAGTCAGTTTTGATCTCTGGCCTGGCGAAACGCTA‑AGCCTG‑GTGGGCGAGTCTGGCAGCGGTAAATCCACTACCGGGCGGGCGTTGCTGCGCCTGGTCGAAAGCCAGGGCGGCGAAATTATCT > CP042583/731006‑731560 ||| gcTGGATGTCACTATTCAGGCGCAGATCCTGCAATTAATCAAAGTATTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACa < 1:415227/288‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |