Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 809,845 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 809,845 | 0 | A | T | 99.7% | 738.6 / NA | 309 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 809,846 | 0 | G | C | 100.0% | 740.2 / NA | 309 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 809,847 | 0 | C | G | 100.0% | 739.7 / NA | 309 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (155/154); total (155/154) |
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
GTTCAGGTCTTTGTCGTCATTCTCGGCAGTATCGCGATGCTTAGCCAGGCGGCGATGGCCCCAGCGTTATTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGAGTTTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTAAGCTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCT > CP042583/809572‑810122 ||| gTCTTTGTCGTCATTCTCGGCAGTATCGCGATGCTTAGCCAGGCGGCGATGGCCCCAGCGTTATTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGa < 1:2588877/286‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCGTCATTCTCGGCAGTATCGCGATGCTTAGCCAGGCGGCGATGGCCCCAGCGTTATTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGAt > 1:2848797/1‑287 (MQ=255) cgATGCTTAGCCAGGCGGCGATGGCCCCAGCGTTATTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGaa > 1:1310174/1‑289 (MQ=255) ggtGCTTGGCAAGGCGGCGATGGCCCCTGCGTTATTCAGCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGACCATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGGCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCCGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGaa < 2:2057579/286‑1 (MQ=255) aTGCTTAGCCAGGCGGCGATGGCCCCAGCGTTATTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGaaa > 2:1586540/1‑288 (MQ=255) caaGGCGGCGATGGCCCCAGGGTTAGTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGc < 1:1824762/286‑1 (MQ=255) cAGGCTGCGATGGCCCCAGCGTTATTCAGCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTc < 1:80232/289‑1 (MQ=255) 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gCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAAtt < 2:121462/261‑1 (MQ=255) tttACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTcaca < 1:1052995/288‑1 (MQ=255) cGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTTGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTg < 1:1510255/289‑1 (MQ=255) 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tggCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGa > 2:2945649/1‑141 (MQ=255) tggCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCa < 1:1004376/153‑1 (MQ=255) tggCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGt < 1:1552858/241‑1 (MQ=255) gCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCa > 2:1309928/1‑202 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |