| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 837,024 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 837,024 | 0 | A | T | 99.8% | 1046.8 / NA | 436 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base T (213/221); total (214/222) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 837,025 | 0 | G | C | 99.5% | 1038.0 / NA | 436 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (212/222); minor base A (2/0); total (214/222) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 837,026 | 0 | C | G | 99.8% | 1042.4 / ‑6.1 | 436 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (214/221); minor base A (0/1); total (214/222) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 436 total aligned reads displayed.
AAAAGGTGTGAGCGACAACATGCAATTTATACATTGCGCCGCTCAGGATGTTGCTAGCCATTTGGAAACGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGAGTGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGAGCTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTAGCCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCATGTCACCGCGCGCAAACCGCAGAGCAAGGATAAAGTATGAGTGAATTTTCCCAGACAGT > CP042583/836747‑837288 ||| tgAGCGACAACATGCAATTTATACATTGCGCCGCTCAGGATGTTGCTTCGCATTTGGAAACGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCAcgcg > 2:824497/1‑288 (MQ=255) caacaTGCAATTTATACATTGCGCCGCTCAGGATGTTGCTTCGCATTTGGAAACGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGgcg < 1:1988168/289‑1 (MQ=255) tGCAATTTATACATTGCGCCGCTCAGGATGTTGCTTCGCATTTGGAAACGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGt < 2:2982391/289‑1 (MQ=255) tttATACATTGCGCCGCTCAGGATGTTGCTTCGCATTTGGAAACGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTa > 1:295469/1‑287 (MQ=255) tGCGCCGCTCAGGATGTTGCTTCGCATTTGGAAACGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTgg > 1:2134501/1‑289 (MQ=255) cgccgcTCAGGATGTTGCTTCGCATTTGGAAACGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGgcgc < 2:420269/269‑1 (MQ=255) tgcttcgcATTTGGAAACGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCaa > 1:998302/8‑289 (MQ=255) ttcgcATTTGGAAACGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGGTTAGCTGTGGTCGGGAGAAGGTGGTTGGACAAtt > 2:1288823/5‑289 (MQ=255) aTTTGGAAACGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATggg < 2:610020/289‑1 (MQ=255) aTTTGGAAACGCCCGTTGACCTGATATTGTTCCATGCGTGGCTCGAGTGGGTGGCTGCTCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGATAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATggg < 2:1550409/289‑1 (MQ=255) tttGGAAACGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGgcg < 2:1311230/244‑1 (MQ=255) ggAAACGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGCTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCCTGGTTTGTTGATGCATAACCTGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTCCAGGCGGCAATGCCGAAAAACAAAAAACGGACGCCTTCGCCAGATTAACAACGCGACCCGGCGCAGGGTACGCTGTGGCTGGAAGCAGCTGGGTGACAAATCATGGCTAAg > 2:2461198/1‑289 (MQ=255) aaCGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGAc < 1:903880/288‑1 (MQ=255) aaCGCCCGTTGATCGGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGGGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGAc < 2:1410400/288‑1 (MQ=255) ttGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTc > 2:2390951/1‑288 (MQ=255) gATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTCCGTCCAGGCGGCGCGTTTTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGAATACGTGCAGGCGGCAACGCCGAACATGAACAAACGGACGCTTTCGCCAGATTACCCACGCGACCCGGCTCCGGTTTATCCGTTGCTGGCAGAAGCTGGTTGGCAGATTACGGGTAAGGCATGCGTTccccggttt > 2:2549585/1‑281 (MQ=255) gTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGgcgc > 1:795287/1‑218 (MQ=255) tGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGgc > 2:786046/1‑210 (MQ=255) tGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAAtt < 2:1338113/250‑1 (MQ=255) tGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGAcc > 1:117327/1‑201 (MQ=255) tGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGAcc < 2:117327/201‑1 (MQ=255) tGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCga > 1:1038477/1‑289 (MQ=255) gttCGGGTGGGGGGCTGATCCCCGCGGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCga < 2:709861/286‑1 (MQ=255) cTCGAGTGGGTGGCTGATCCACGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAACGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGaaa > 1:1723967/1‑240 (MQ=255) ggtggCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAACAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGCTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACca > 2:3145123/1‑288 (MQ=255) ggtggCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAAtt > 1:2986644/1‑235 (MQ=255) ggtggCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACca > 1:1291041/1‑288 (MQ=255) ggtggCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCGGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGGTTCATGGTTATTTGCCCGAGAAACCCcag > 2:874101/1‑289 (MQ=255) tggCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACcagca > 1:2429343/1‑289 (MQ=255) cTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGAc < 1:2211841/185‑1 (MQ=255) cTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGAc > 2:2211841/1‑185 (MQ=255) aTCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGAcc > 2:2336489/1‑183 (MQ=255) aTCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGcgcg > 1:1337633/1‑288 (MQ=255) tCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGa < 1:1891416/288‑1 (MQ=255) tCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGa < 1:488578/288‑1 (MQ=255) cccGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGgc > 2:1238234/1‑184 (MQ=255) cccGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGgc < 1:1238234/184‑1 (MQ=255) cAGCGTATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCAcg < 2:1752854/171‑1 (MQ=255) tATTGCAGACCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGc > 1:273537/1‑289 (MQ=255) aCCCTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCAcg < 2:107294/158‑1 (MQ=255) ccTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGGGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGGCCGACTGCTACGaa > 2:2820204/1‑277 (MQ=255) ccTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGGTCGCGTGCTTCATGGTTATCTGCCCGAGAAACACCAGCAACGCGAATGGTTAGAACGATTACTTTaa > 2:261772/1‑289 (MQ=255) ccTCTGGTCAGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGATAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTAGCCAGATTATCTACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCAGTGGCTGGAAGAAGCGGGTTGGCAAATAATGGGTAAGACAGGCCGTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGATACACCCCAGCAGACCGACTGCTAGTAAGCATTACTTGaa > 2:2264358/1‑289 (MQ=255) tctggtcagtgtTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGtt > 1:557694/9‑229 (MQ=255) tctggtcagtgtTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAAtt > 2:2420240/9‑289 (MQ=255) ctggtcagtgtTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAAtt < 2:1261281/195‑1 (MQ=255) ctggtcagtgtTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAAtt > 1:1261281/8‑202 (MQ=255) ctggtcagtgtTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTAGCCAGATTATCCCCGCCACCCGGCCCCGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGGAAGa > 2:1610967/8‑212 (MQ=255) gtgtTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGGTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGGGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAAGAACACCAGCAGCGCGACCGCTATGAGGCATTATTTGAATTAGAAAcg > 2:1991937/1‑288 (MQ=255) cGTCCAGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAgcgc < 2:2908657/249‑1 (MQ=255) aGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTc > 2:1462156/1‑212 (MQ=255) aGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTc < 1:1462156/212‑1 (MQ=255) aGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTa > 1:1127065/1‑282 (MQ=255) aGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCg > 2:170908/1‑288 (MQ=255) aGGCGGCGTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGACGCCCGACGGCTATGAAGCATTACTTGCATTAGAAACGCGTTATTGCCg > 2:2141894/1‑288 (MQ=255) gcgTGTTGTCGTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAgg < 1:2549585/288‑1 (MQ=255) gtgttgtcgttAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGaa < 1:1006413/279‑1 (MQ=255) tgttgtcgttAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTAt < 1:1400916/204‑1 (MQ=255) gtttgctgtactGTTCTGAAATGGGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGACGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTCGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCg < 2:2034224/278‑1 (MQ=255) tgtcgttAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGta < 1:3129457/284‑1 (MQ=255) cgttAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGtata < 1:2872532/286‑1 (MQ=255) tAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGc < 1:2360587/162‑1 (MQ=255) aaTGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGtt < 2:1112729/192‑1 (MQ=255) gTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTg < 1:874101/289‑1 (MQ=255) tCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTggg > 1:2782846/1‑289 (MQ=255) tACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGaa > 2:181286/1‑243 (MQ=255) cAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGt > 1:1752698/1‑289 (MQ=255) tGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGa < 2:1383470/216‑1 (MQ=255) tGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGaaa < 1:1421316/245‑1 (MQ=255) tGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGtata > 1:2637453/1‑272 (MQ=255) tGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTtat > 2:540038/1‑289 (MQ=255) tGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCAAGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAg > 2:571857/1‑262 (MQ=255) cgcATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTAccc < 2:907953/276‑1 (MQ=255) cATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTc > 1:180551/1‑289 (MQ=255) aTGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGaa < 1:183228/260‑1 (MQ=255) aTGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCa < 1:1585565/289‑1 (MQ=255) aTGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCa > 1:336598/1‑289 (MQ=255) ggTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAAcc > 1:828108/1‑260 (MQ=255) ttgttgATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCgaga < 2:2434625/190‑1 (MQ=255) ttgATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGaa < 1:1024279/252‑1 (MQ=255) tGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAgg > 2:187210/1‑246 (MQ=255) tGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTggg < 1:426302/265‑1 (MQ=255) gCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGa > 1:323283/1‑198 (MQ=255) cATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGaaa > 1:1093423/1‑226 (MQ=255) cATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCG‑AAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCATGTCACCGCGCGCaa > 1:737031/1‑289 (MQ=255) aCATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCt < 1:2406578/256‑1 (MQ=255) ggTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTg < 1:1553748/253‑1 (MQ=255) gTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCATGTCACCGCGCGCAAACCGCaga > 1:2839712/1‑289 (MQ=255) tCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGAc < 1:1356688/188‑1 (MQ=255) gCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCATGTCACCGCGCGCAAACCGCAGAGCa < 1:709000/289‑1 (MQ=255) gCCGGGAATTTTGATTACGGGCAGGCGGGAAAGCCGAAAAAGAAAAACCGGCCGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGACAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCATGTCACCGCGCGCAAACCGCAGAGc < 2:336598/288‑1 (MQ=255) ccGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGaa > 1:612517/1‑233 (MQ=255) ccGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCATGTCACCGCGCGCAAACCGCAGAGCa < 2:472942/288‑1 (MQ=255) gAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCATGTCACCGCGCGCAAACCGCAGAGCAAGGa < 2:1038477/288‑1 (MQ=255) gAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCATGTCACCGCGCGCAAACCGCAGAGCAAGGa < 2:273537/288‑1 (MQ=255) ttACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCATGTCACCGCGCGCAAACCGCAGAGCAAGGATAAAGTATGa < 1:2256017/289‑1 (MQ=255) tGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCt < 1:2053090/76‑1 (MQ=255) aTGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGCGTTTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGAATGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCATGTCACCGCGCGCAAACCGCAGAGCAAGGATAACTTATGAGTGAATTTTCCCAGAc < 1:2435310/289‑1 (MQ=255) aTGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCATGTCACCGCGCGCAAACCGCAGAGCAAGGATAAAGTATGAGTGAATTTTCCCAGAc < 2:2782846/289‑1 (MQ=255) cGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTTCGCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTg > 1:1657170/1‑154 (MQ=255) ||| AAAAGGTGTGAGCGACAACATGCAATTTATACATTGCGCCGCTCAGGATGTTGCTAGCCATTTGGAAACGCCCGTTGATCTGATATTGTTCCATGCGGTGCTCGAGTGGGTGGCTGATCCCCGCAGCGTATTGCAGACCCTCTGGAGTGTGTTGCGTCCAGGCGGCGTGTTGAGCTTAATGTTCTACAATGCGCATGGTTTGTTGATGCATAACATGGTCGCCGGGAATTTTGATTACGTGCAGGCGGGAATGCCGAAAAAGAAAAAACGGACGCTTAGCCCAGATTATCCACGCGACCCGGCGCAGGTTTATCTGTGGCTGGAAGAAGCTGGTTGGCAAATTATGGGTAAGACAGGCGTTCGCGTGTTTCATGATTATCTGCGCGAGAAACACCAGCAGCGCGACTGCTATGAAGCATTACTTGAATTAGAAACGCGTTATTGCCGTCAGGAACCGTATATTACCCTGGGGCGTTATATTCATGTCACCGCGCGCAAACCGCAGAGCAAGGATAAAGTATGAGTGAATTTTCCCAGACAGT > CP042583/836747‑837288 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |