| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 843,197 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 843,197 | 0 | A | T | 99.7% | 876.9 / NA | 369 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| * | CP042583 | 843,198 | 0 | G | C | 100.0% | 880.6 / NA | 369 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (188/181); total (188/181) | |||||||||||
| * | CP042583 | 843,199 | 0 | C | G | 100.0% | 885.8 / NA | 369 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (188/181); total (188/181) | |||||||||||
Only 100 of 369 total aligned reads displayed.
AGATTGAACTTAGCCGTCTGACCGAAGAATTAACCTCCCGTGAACAGAAACTGGCGATCAGTTCCCGCAGCGTGGCGAACATCATTCGCAAAACCATTCAGCGCGAGCAGAACCGTATCCGTATGCTCAACCAGGGGTTGCAGAACGTAAGCTTTGGTCAGGTGAACAGCGTGCGTCTCAACGTGAACGTGCGTGAAACGCACGCCATGCTACTGGATGTGCTCTCTGAACAGCACGAGCAGCATCAGGATCTGTTTAACAGCAACCGTTTGACCTTCAGCGAAGCGCTGGCGAAACTGTATCAACGTCTTAACCCGCAGATTGATATGGGGCAGCGCACGCCGCAGACCATCGGTGAAGAACTGCTGGATTACCGCAACTATCTGGAAATGGAAGTTGAGGTTAACCGTGGTTCCGATGGCTGGCTGCGCGCAGAGTCTGGTGCATTGAGCACCGGTGAGGCGATTGGTACCGGTATGAGCATTCTGGTGATGGTGGTACAAAGCTGGGAAGATGAATCTCGCCGCCTGCGCGGTAAAGATATCTCTCCTTGCC > CP042583/842919‑843473 ||| agaTTGAACTTAGCCGTCTGACCGAAGAATTAACCTCCCGTGAACAGAAACTGGCGATCAGTTCCCGCAGCGTGGCGAACATCATTCGCAAAACCATTCAGCGCGAGCAGAACCGTATCCGTATGCTCAACCAGGGGTTGCAGAACGTATCGTTTGGTCAGGTGAACAGCGTGCGTCTCAACGTGAACGTGCGTGAAACGCACGCCATGCTACTGGATGTGCTCTCTGAACAGCACGAGCAGCATCAGGATCTGTTTAACAGCAACCGTTTGACCTTCTCGGAAgcgc < 1:2423651/288‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |